图像处理在基因芯片分析系统中的应用

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1、摘要基因芯片是近10年来在生命科学领域迅速发展起来的一项高新技术。它是伴随人类基因组计划(HumanGenomeProject，HGP)的顺利实施，应运而生的一项基于基因表达和基因功能研究的革命性技术，它将分子生物学和微电子技术相结合，在生命科学与信息科学之f刮架起一道桥梁，成为后基因组时代基因研究的重要技术之一。基因在芯片的研制在我国也已起步并取得了重要的进展。我国已经在少数民族基因组的保存、致病基因的分离、生物信息学以及基因组新技术开发等方面取得了良好的开端，但达到临床应用的水平还不是很高。本文主要就基因芯片原始图像用计算机图

2、像分析的方法进行了研究，主要研究工作和结果如下：1．在现阶段基因芯片半自动、半手工的图像分析基础之上，采用灰度变换、自适应阈值、轮廓跟踪等方法实现了基因芯片图像的全自动分析，在保证分析结果准确的同时大大提高了分析的效率。2．利用VisualBasic语言实现了图像的采集、图像的处理、分析以及数据的处理，已经在某医院临床试用，并且取得了良好的效果。关键词：基因芯片、图像处理、灰度变换、自适应阈值、VB语言ABSTRACTThegeneticchipisanewandhightechnologydevelopedrapidlyinth

3、efieldsofthelifesciencesinthepast10years．ItisimplementingsuccessfullywhichfollowstheHumanGenomeProject(HumanGenomeProject，HGP)，ageneexpressionandgenerevolutionarytechnologyofthegenefunctionstudyariseatthehistoricmoment．Itcombinesmicroelectrictechniquewithmolecularbiol

4、ogy,erectsabridgebetweenthelifesciencesandtheinformationscience，whichisthemostimportanttechnologyofthegenestudiesinthelatergenomeera．Generesearchonthechiphadalreadystartedandmadeimportantprogressinourcountry．Ourcountryalreadyinnationalminoritysave，separationofthepatho

5、genicgenome，bioinformaticsandnewtechnologicaldevelopmentofthegenome，etc．madethegoodbeginning．Butthelevelwhichreachesclinicalpracticeisnotstillveryhigh．Thisdiscussesmainlythegeneticchipprimitivepictureusingcomputerimageanalysismethod．Mainresearchworkandresultareasfollo

6、ws：1．Geneticchipanalysisisdoneusingthesemi—automatic，semi—handworkanalysesmethodsinthepresentstage．Greyleveltransformation，adaptivethresholdvalue，outlinetrackingmethodareadoptedinordertorealizethefull—automaticanalysisofthegeneticchipimage．Theanalyzedefficiencyisimpro

7、vedgreatlyonconditionthattheanalysisresultisguaranteedaccuratelN2．UsingtheVisualBasiclanguage，theimagecollection，thepattern，dataprocessingandanalyzingarerealized．Ithavealreadyemployedclinicallyinahospital，andachievedagoodresult．Keywords：geneticehip，imageprocessing，gre

8、yleveltransformation，adaptivethresholdvalue，VBlanguage独创性声明本人声明所呈交的学位论文是本人在导师指导下进行的研究工作和取得的研究成果，除了文中特别加以标注和致谢之处外，论文中不包含其他人已经