asm（active shaped model）算法在基因芯片图像处理中的研究与系统实现

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1、上海大学硕士学位论文ASM（ActiveShapedModel）算法在基因芯片图像处理中的研究与系统实现姓名：敖天真申请学位级别：硕士专业：计算机系统结构指导教师：马文丽20070101上海大学硕士学位论文摘要基因芯片技术怒近年来发展非常迅速的一门学科交叉技术，尤其在其反应强像羟理方瑟，蹙涉及到擞会科孥，橇械蔗程穆攀，光学耪诗算撬科学戆综合交叉应用。基因芯片图像的处理和数据采集一直悬基因芯片技术中的一项关键技术，壹接影响戮髓端机械光学硬件设计秘后面爱物学分耩。本文基予生命辩学与计算机科学的交叉研究领域——基因芯片的图像处理，针对圜产设备基因芯片图像规整性远落后国外产品生成

2、图像的弱点，研制出譬其楣翳步熬基毅芯片黧像处理分辑系统。该系统具窍算法速度抉，系统扩展性好的特点，并且可实现全自动图像分析处理。第一、零深邃在研究了蠢兹零建豹基羧芯片黧像谖爰冀法器，翻錾燃戆弓l入了一款在人工智能和计算机视觉方面应用颇广的主动形状模型(ASM)算法，蓄次实瑗了ASM在基茵芯笄鹜像中的应焉，并挺嬲了裙关的篱位方法。经过实验测试发现该算法具有速度快，硬件资源占用少，在绝大多数情况下都可以非常好地对点阵图进行标识。而且可避免原有算法所实现系统的分析入工千预过程，实现全自动图像分析娥理。第二、本课题在研究中改进了科研系统单纯以技术为主导的歼发过耩，从基嚣芯冀鬻豫处

3、理渡务滚稷瓣鲎务模型分耩入手，采震统一_蓬程建摸露模块纯的思想进行整个架构的设计研究。第三、零课题萼

4、入数攒仓库的设计理念，研究了逶鬻子基霞芯片数臻挖摇的逻辑与物理存储方式。对原有纂因芯片数据分析中以单纯统计学分析的方式是～个改进。最嚣，零课题掰研制系统与中心其他科研人员的数掇挖掘模块以接嗣缀连接后实现舆有自主知识产权的GMAS系统1．0版本。关键词：基因芯片，ASM算法，训练类，测试类，图像处理，面向对象，统一蘸模过程UMLV上海大学硕士学位论文ABSTRACTDNAmicroarraytechnologyisacross-disciplinarytechnologyd

5、evelopingveryrapidlyinrecentyears．Especiallytheimageprocessingofitrelatestolifesciences，mechanicalengineering，computerscienceandintegratedcross-opticalapplications．DNAmicroarrayimageprocessinganddataacquisitiontechnologyhasbeenakeytechnology．Howtodealwithitdirectlyaffectsthebiologyanalysi

6、sandthedesignofmechanicalandopticalhardwarejointedbyit．Thispaperisbusedonmyresearchinthemicroarrayimageprocessingthatcovetsthelifescienceandcomputersciencefordomesticequipment．Becausetheimageacquiredbydomesticisfarweakerthanforeignproducts．Thesystemisfasterthanbeforeandhasexcellentscalabi

7、lity．Wecangetautomaticimageanalysisandprocessingwithit．First,thispaperinnovatesinthealgorithmofmieroarrayimageprocessing．Itusesanewapplicationnamedactiveshapemodel(ASM)algorithmandtherelevantsimplifiedmethod,whichwidelyusedintheartificialintelligenceandcomputervision．Aftertestingitreveals

8、thatthealgorithmisfasterandconsumeslesshardwareresources．inmostcasesitcanbeverygoodforBitMapmarking．Inadditional，thealgorithmcanbeachievedautomaticimageanalysisbyavoidingmanualworksori百nal．Secondly,thispapermadeimprovementinthesystemdesignbyusingtheunifiedmodelingfr