龙头鱼群体遗传结构分析【开题报告】

龙头鱼群体遗传结构分析【开题报告】

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1、毕业设计开题报告生物科学龙头鱼群体遗传结构分析一、论述龙头鱼研究现状,说明选题的依据和意义龙头鱼Harpoonneherus属于灯笼鱼目,狗母鱼科,龙头鱼属;俗名豆腐鱼、细鱼、狗吐鱼。龙头鱼是温、热带性鱼类,广泛,分布于太平样、印度洋的温带和热带近岸海域及河口处;我国自浙江省以南沿岸都有分布,一年四季都有生产。龙头鱼是当地浅海各种作业的主要捕捞对象,产量不小,资源丰富,有一定的生产经济价值。龙头鱼肉味鲜美,做鱼汤十分可口,很受群众欢迎;若腌制成龙头鱼干用于油炸更有风味。SRAP(Sequence-relatedampl

2、ifiedpolymorphism)即相关序列扩增多态性,是Li和Quiros发展的一种基于PCR的新型分子标记技术。SRAP标记原理是利用基因外显子里G、C含量丰富,而启动子和内含子里A、T含量丰富的特点设计两套引物,对开放阅读框架进行扩增。该标记具有简便、稳定、产率高、便于克隆目标片段的特点,并已被应用于图谱构建、性状的标记和遗传多样性分析。该标记具有多态性丰富、简便、稳定、快速、成本低等特点,已被广泛应用于油菜、桃、野牛草、西葫芦、甜菜、豌豆、黄秋葵、紫菜等植物的遗传多样性分析。SRAP标记技术现已广泛应用于植物

3、的种质鉴定、亲缘关系的分析和遗传多样性的检测,但在鱼类中研究较少,为此,本研究以4个龙头鱼群体作为研究对象,利用SRAP标记分析龙头鱼遗传结构和多样性,以期为后续的龙头鱼育种工作提供理论依据。二、研究的基本内容,拟解决的主要问题:研究的基本内容:利用厦门、珠海等等地的龙头鱼作为研究对象,利用微卫星标记分析其遗传结构和多样性,检测4个群体龙头鱼的遗传多样性水平。解决的主要问题:1.SRAP引物的选择;2.PCR反应体系的确定;3.PCR产物的检测。三、研究步骤、方法及措施:研究步骤:1.查阅相关资料,了解有关龙头鱼的基本

4、特征;2.仔细阅读研究文献资料并翻译相关英文资料;3.不同地理群体龙头鱼样品的采集4.将各群体龙头鱼的鳍条剪取后保存于95%的乙醇中。5.龙头鱼DNA的提取,引物的选择,PCR扩增6.PCR反应结束后,取扩增后的样品5µl,上样缓冲液1µl,混匀后按顺序将混合液加入加样孔,于水平电泳槽中进行电泳;7.数据整理和分析,撰写毕业论文;8.上交论文初稿;9.反复修改论文;10.论文定稿。方法、措施:查阅文献,参考已知文献中关于对龙头鱼不同群体的遗传多样性的研究。在老师指导下完成龙头鱼样本的采集;DNA提取参照刘云国等(200

5、6)的方法进行。取扩增后的样品5µl,上样缓冲液1µl,混匀后按顺序将混合液加入加样孔,于水平电泳槽中进行电泳。电泳完成后,经溴化乙锭(EB)染色液染色15min。于GDXI型BIO-RAD凝胶成像仪拍照。进行数据分析:运用NTSYSpc2.2软件统计数据,按照UPGMA(unweightedpair-groupmethodandarithmeticaverage)法聚类分析,绘出树状图。用Popgene.32软件对种群遗传学参数进行分析和计算。 四、参考文献[1].Pang,Ritland,Carlson,etal.

6、Japanesequailmicro2satellitelociamplifiedwithchickenspecificprimers[J].AnimalGenetics,1999,30:195~199.[2].国伟,沈佐锐.微卫星DNA标记技术及其在昆虫学上的应用[J].生物技术,2004,14(2):60.[3].国伟,沈佐锐.微卫星DNA的多态性及其应用[J].生物技术通讯,2004,15(2):158.[4].杨效文,张广学,陈晓峰.棉蚜微卫星DNA的克隆及其多态性检测[J].昆虫学报,2001,44(4):5

7、86.[5].安瑞生,等.微卫星DNA在分子遗传标记研究中的应用[J].昆虫知识,2002,39(3):561.[6].TAUTZD.HypervariabilityofsimplesequenceasageneralsourceforpolymorphicDNAmarkers[J].NucleicAcidResearch,1989,17:6463~6471.[7].MAGUIRETL,etal.Characterisationandanalysisofmicrosatellitelociinamangrovespec

8、ies,Avicenniamarina(Fork)vierh(Avicenniaceae)[J].TheorAp2plGenet,2000,101:279~285.[8].周莉,等.应用微卫星标记对雌核发育银鲫的遗传多样性初探[J].动物学研究,2001,22(4):257~264.[9].孙效文,等.斑马鱼SSLP标记检测鲤鱼种

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