【精品】药大毕业论文

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1、中国药科大学本科毕业论文论文题目RPE65蛋白质的结构预测英文题目StructurePredictionoftheRPE65Protein专业院部学号姓名指导教师（院上）课题完成场所屮国药科大学江宁校论文工作时间：年月至年月RPE65蛋白质的结构预测目录摘要1前言2笫一章背景介绍生物信息学在蛋口质结构预测中的应用第二章RPE65基因蛋口概述2.1RPE65基因蛋白的功能2.2RPE65蛋白质基因的组成6第三章RPE65的3D结构模型预测93.13D-PSSM获得RPE65的初步模型信息93.2SCWRL软件预测侧

2、链坐标103.3Jackal软件包对模型的修饰12第四章结果和讨论14第五章视网膜色索变性研究进展18参考文献20致谢21RPE65蛋白质的结构预测摘要：应用生物信息学的方法对蛋白质结构的预测，为进一步研究蛋白质的生物学功能开辟了一个新的领域。木课题的提出是通过生物信息学软件预测RPE65蛋白质的三级结构，并根据获得的三维结构模型，对其蛋£1质功能的可能机制进行讨论，进而为设计新的蛋白质或改造已冇蛋白质捉供可靠的依据。关键词：蛋口质结构预测，视网膜，RPE65StructurePredictionoftheRPE

3、65ProteinAbstract：Usingbioinfbrmaticsmethodsforproteinstructurepredictionopensanewareaforfurtherstudyofproteinbiologicalfunction.ThetopicproposedbybioinfbrmaticsmethodtopredictthenaturalconformationofRPE65anditsstructures,accordingtoobtainedthree-dimensionals

4、tructuremodeloftheproteintodiscussitsfunctionandpossiblemechanisms-Thismethodalsoprovidesareliablebasisfordesigningnewproteinsandmodifiedproteins.Keywords：proteinstructureprediction;retina;RPE65刖吞视紫红质是感光细胞中的一种视色索，在光线的接收和视觉屯位的产生方面具冇重要的生理作用，由视紫红质介导的过度光信号传导是光性视网

5、膜变性的主要原因。近年的研究表明，视网膜色素上皮细胞中的RPE65蛋白作为影响视紫红质再牛的关键因素，与视网膜光损伤的易感性密切相关⑴。随着近年来生物信息学的快速发展，我们在该课题中应用生物信息学的研究方法对RPE65蛋白质的结构进行预测。生物信息学的一项重要研究是从蛋白质的氨基酸序列预测蛋白质结构。它的重点研究问题包扌4有效建立“低同源性蛋口质比对方法”，为大部分蛋口质天然构彖能够得到准确预测捉供有效的基础方法；在从头预测方法屮，建立较为准确的力场和有效的构象搜索算法，达到准确快速预测目的；建立准确有效地判断蛋

6、口质天然构象预测模型质量的方法。可见通过生物信息学的方法对蛋白质结构的预测，为进一步研究蛋白质的生物学功能开辟了一个新的领域。所谓的蛋白质结构预测就是如何从蛋白质的氨基酸序列预测岀其空间结构。由于蛋白质的生物学功能在很大程度上依赖于其空间结构，因此进行蛋白质的结构预测对了解未知蛋口生物学功能具有重要意义。本课题即是通过计算机在Linux系统下获得RPE65蛋白质基因的三维立体结构模型，进而讨论它在视觉周期中所发挥的重要作用。课题所介绍的计算机模型的研究，其主要过程是通过3D-PSSM服务器获取RPE65基因蛋白的

7、初步三维结构模型，英相应的侧链是从SCWRL屮获得。最后，应用Jackal与Charmm力场对初步模型进行修复和完善。根据获得的三维结构模型，对蛋白质功能的可能机制进行讨论。并了解该蛋白质的生物学功能，进而为设计新的蛋白质或改造已有蛋白质提供可靠的依据，同吋为新的药物分子设计提供合理的靶分子结构。第一章背景介绍生物信息学在蛋白质结构预测中的应用目而，生物信息学主要是以计算机为工具对生物信息进行储存、检索和分析，并从中归纳总结出生物系统的规律，是当今生命科学和自然科学的重大前沿领域之一，同时也是21世纪自然科学的核

8、心领域之一。其研究包括了基因组学、蛋白质组学、系统生物学、比较基因组学，重点主要体现在基因组学（Genomics）和蛋口质组^（Proteomics）两方而，具体说就是从核酸和蛋白质序列出发，分析序列屮表达的结构功能的生物信息。门1989年在美国举办生物化学系统论与生物数学的计算机模型国际会议，生物信息学已经发展到了计算生物学、计算系统生物学的时代。生物信息学的目标包括：