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时间:2019-10-12
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1、1应用需求分析山东大学是-•所历史悠久、学科齐全、学术实力雄厚、办学特色鲜明,在国内外具有重要影响的教育部直属重点综合性大学,是国家"2111程”和“985工程”重点建设的高水平大学之一。山东大学生命科学学院在山东大学有着悠久的历史和辉煌的成就。1901年山东大学堂(山东大学前身)创办时,就开设过牛物学方面的课程。1930年,私立青岛大学(后改为国立山东大学)成立时正式设置生物学系。中科院院士、著名实验胚胎学家童第周教授,中科院院上、著名海洋生物学家曾呈奎教授以及箸名微生物学家王祖农教授都先后担任过系主任,他们以其先进的学术思想和卓越的成就,为促进山东
2、大学生物学科的发展做出了贡献,并使山东大学牛物学科享誉海内外。中科院院士、小科院著名动物学家张致一教授,小科院院士、著名细胞生物学家庄孝億教授都是生物学系早期的毕业生。改革开放以来,山东人学的生命学科有了新的巨大的发展。1996年3月,在原有的生物学系、微生物学系、微生物研究所等单位的基础1二组建了生命科学学院。建院后,学院以学科建设为龙头,加强国家重点实验室建设和博士与硕士学科点建设,注重本科教学与人才培养,积极引进国内外人才,为生命科学院的腾飞与发展打下了坚实的慕础。生命科学学院现有生物科学、生物技术、生态学和生物工程四个本科专业,按本科专业设置生
3、物科学系、生物技术系、生态学系和生物工程系,并设有木科实验教学中心。生命科学学院下设五个研究所:微牛物研究所,发育牛物学研究所,细胞•遗传研究所,牛化与分子生物学研究所,生态学与生物多样性研究所。另建有微生物技术国家重点实验室、发育机制与棊凶调控山东省高校重点实验室,生态学与生物多样性学校重点实验室。微生物学为国家重点学科,发酵工程学,发育生物学为山东省重点学科。学院具有生物学一级学科博士授权点、发酵工程学博士点(工学),并设有生物学博士后流动站。此次,牛命科学学院要设计搭建的X射线衍射数据海量存储与计算系统是为支持車大科研项口提供的基础平台。应川软件
4、比较多,不同软件的应川特点也是千差万别。为此,如何根据不同的应用特点设计好系统,对HPC厂商来说是一个重大的挑战。不过可以相信,这套高性能系统的建成,将为生命科学学院科研一线的老师们提供更好的研究工具,人幅度提高科研人员的工作效率。2系统方案设计2.1系统方案概述针对于本次高性能项目需求,并结合浪潮多年来对牛命科学计算领域高性能应用的深刻理解,浪潮特别推出了针对本次项H需求的基于Intel最新处理器的浪潮天梭TS10000高性能服务器集郡,本集群具有计算性能优越、功耗控制领先、监控管理系统方便易用、系统开放易于扩展、服务体系完善等特点。除此Z外,颇受广
5、大用户认可的浪潮高性能集群培训服务体系,将为此次项目锦上添花,免除用戶的后顾之忧。集群总体描述:>主机系统:■2台浪潮英信NF8560四路服务器(4xlntelXeonX7542处理器,16X8GBECCRegisteredDDR3内存,1x600GBSAS破盘,双千兆网卡,澗40GB/s高速MellanoxF・X系列Infiniband网卡双机互联)>存储系统:■存储,采用1套浪潮AS300N。AS300N2U12盘位,标配单存储处理器,口J扩展两个存储处理器,标配4GB高速缓存,最大可支持24GB,标配2个千兆以太网主机接口,可扩展至4个,支持In
6、finiband连接,支持RAID0、1、5、6、10、50、60,可支持SSD、SAS、SATA硬盘,可扩展3个AS300NJJBOD为3U16盘位,5块2TB,7200转,SATAII企业级硬盘。存储通过千兆网口接入到现有网络。>管理网络:两台主机系统之间通过40GbpsInfiniband互连,通过千兆网络接入管理网。>视频切换系统:釆用一套八口切换进行所有节点的切换,25寸液晶显示器。>软件:■RedhatLinuxAS5.4■浪潮TSMM集群监控管理软件■浪潮TSJM作业管理软件■浪潮TSDM集群部署软件■Intel集群编译、调试、数学库等软
7、件■MPhPVM、OpenMP等并行环境■浪潮睿捷集群备份软件2.2系统配置表部件名称部件型号技术规格数量基础模块机柜系统TS4220机柜19〃、42UT业标准机柜、天梭高性能服务器专用机柜;1个承重托盘,支持并柜并带有并柜遮条,口带2个线缆槽1PDU-40双路单相220V供电,32A;40口,36个国标三扁口,4个万用口,带两个工业连接器1TS1OK配件包TS10000配件包,每机柜必配一套1TS10K配件盒TS10000配件盒,每项目必配一套,含专业键盘、鼠标、USB软驱1盲板高性能服务器机柜1U专用盲板,用于遮挡机柜中空余槽位以便美观31键盘鼠标
8、抽屉键盘鼠标抽屉,用于放置放键盘或鼠标及仪器1集群监管报警终端独立于服务器的外置换件设备可对集
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