天根荧光定量PCR技术专题NEW

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时间:2019-10-08

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1、“从RNA提取到荧光定量PCR”解决方案――qPCR―qPCRqPCR系统qPCR系统TIANGENBIOTECH(BEIJING)CO.,LTD内容概要荧光定量PCR的原理荧光定量PCR的标记方法荧光定量PCR解析方法SYBR法实验流程及注意事项TIANGEN公司荧光定量产品选择指南荧光定量PCR原理--定义实时定量PCR技术:利用荧光信号的变化实时检测PCR扩增反应中每一个循环扩增产物量的变化,通过Ct值和标准曲线的关系对起始模板进行定量分析与常规PCR技术比较:对PCR扩增反应的终点产物进行定量和定性分析,无法对起始模板准确

2、定量,无法对扩增反应实时检测荧光定量PCR原理--常用名词概念扩增曲线荧光阈值Ct值荧光定量PCR原理--扩增曲线平台期)荧光基团荧光强度(RnLog---linerphaseBaselineCycle(((循环数(循环数)))荧光检测元件荧光定量PCR原理--荧光域值前15个循环信号作为荧光平台期本底信号(baseline))荧光域值的缺省设置是荧光强度3~15个循环的荧光信号的标(Rn准偏差的10倍Log---linerphase手动设置:大于荧光背景Threshold值和阴性对照的荧光最高值;进入指数期的最初阶段真正的信

3、号:荧光信号超Baseline过域值Cycle(((循环数(循环数)))荧光定量PCR原理--CtCt值Ct值)荧光强度Ct值的定义:::(RnPCR扩增过程中,扩Ctvalue增产物的荧光信号达到设定的阈值时所经过的扩增循环次数Cycle(((循环数(循环数)))荧光定量PCR原理--CtCt值定量的数学原理Ct值定量的数学原理理想的PCR反应X=X2nn0*n::扩增循环数:扩增循环数X0::起始模板数量:起始模板数量X::第:第n次循环后扩增产物数量n荧光定量PCR原理--CtCt值定量的数学原理Ct值定量的数学原理非理想的PCR反应

4、nXn=X0*(1+En)n::扩增循环数:扩增循环数En::扩增效率:扩增效率X0::起始模板数量:起始模板数量X::第:第n次循环后扩增产物数量n荧光定量PCR原理--CtCt值定量的数学原理Ct值定量的数学原理在扩增产物达到荧光阈值时CtXCt=X0*(1+En)=M(1)XCt:::荧光扩增信号达到阈值时扩增产物的量:荧光扩增信号达到阈值时扩增产物的量,,,在阈值设定以后,在阈值设定以后,,,它是一个常数,它是一个常数,,,定为,定为M方程式(1)两边同取对数得:CtLogM=LogX0*(1+En)(2)整理方程式(2):LogX

5、0=LogM-CtLog(1+En)荧光定量PCR原理--CtCt值与模板起始量的关系Ct值与模板起始量的关系SampleCk102Ck104起始模板DNA量越多,荧光达到域值的循环数越少,即Ct值越小。Log模板起始浓度与Ct值呈线性关系。CyclenumberLogofDNAconcentration荧光定量PCR反应有效性的确认线性关系、、扩增效率确认、扩增效率确认相关系数(((R(RRR222):大于0.98标准曲线斜率:::-:---3333--------3.53.5PCRPCR扩增效率PCR扩增效率(((E(EEE))))

6、:0.9:0.9:0.9-:0.9---1.21.2检测灵敏度确认35Cycles35Cycles内35Cycles内内内可得到好的定量结果可得到好的定量结果如果采用SYBRSYBR检测方法SYBR检测方法,,,30Cycles,30Cycles30Cycles内无非特异性产物扩增30Cycles内无非特异性产物扩增35Cycles35Cycles内无引物二聚体产生35Cycles内无引物二聚体产生荧光定量PCR技术的应用定性分析研究::杂合或纯合子鉴定:,(SNPs)分析等绝对定量研究::病毒和病原菌定量分析:,基因拷贝数定量,GMO

7、定量检测等相对定量研究:mRNA表达量分析,siRNA效果确认,基因芯片结果验证,差异显示结果验证等内容概要荧光定量PCR的原理荧光定量PCR的标记方法荧光定量PCR的解析方法SYBR法实验流程及注意事项TIANGEN公司荧光定量产品选择指南常用荧光标记方法非特异性荧光标记SYBRGreenI特异性荧光标记TaqManProbe分子信标SYBRGreenI染料法——原理SYBRGreenI是一种结合于所有dsDNA双螺旋小沟区域的具有绿色激发波长的染料。SYBRGreenISYBRGreenISYBRGreenI染料法——

8、作用机理热变性引物退火延伸反应SYBRGreenI染料法——问题点与关键点问题点:SYBRGreenI与任何双链DNA进行结合后散发荧光,,因,因此如果反应体系中有非特异性扩增或

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