数量遗传讲稿-4

《数量遗传讲稿-4》由会员上传分享，免费在线阅读，更多相关内容在行业资料-天天文库。

1、第七章基因效应分析第一节尺度效应基因效应分析的主要手段是方差和协方差，方差分析的正确性是建立在一系列的基本假定上的，如果遗传试验结果不符合这些基本假设，就不能进行正确的方差分析，有可能得出错误结论。这些假定主要是：（1）分布为正态；（2）方差与平均数相独立；（3）观测值的各分量呈可加性。有些数据就其本身特性就不符合这些假定。但通过对数、反三角函数、倒数转换，有可能使本来不符合假定的试验结果符合基本假定，从而得出正确的结论。数据的转换也叫尺度转换，当应进行尺度转换而未进行时，就会发生某种特定现象，即尺度效应；一旦正确的

2、尺度转换进行，尺度效应消失。使用最多的尺度转换为对数转换，对数转换对方差与平均数成比例、倍加性效应、上位互作、基因型与环境互作都有良好的作用。当变异系数小于20%时转换与否影响不大，尺度转换采用哪一种尺度要具体问题具体分析，不同性状不同群体需要不同的尺度。—、检验标准尺度是否合适的两个条件是：基因效应的可加性和遗传成分与非遗传成分的独立性。基因效应的可加性将确定非等位基因互作是否存在，由于大多数情况下对加性和显性的估计是根据基因互作不存在的假定而做的，所以尺度是否合适的检验是很重要的，尺度效应不存在，说明加性-显性模

3、型合适。当上位互作不存在时，第二节尺度检验为了判断现有数据的度量尺度是否合适，要进行尺度检验。据此1955年Hayman和Mather提出了以下四个尺度效应的检验标准。当有回交群体时，这样计算出相应的标准误和t值，若t值＞1.96，表明尺度达显著水平，说明尺度不合适，存在上位性；否则t值＜1.96，表明尺度不显著，说明尺度合适，不存在上位性。二、尺度检验实例三、尺度作用分析⑴A尺度主要检验d×d型互作⑵B尺度主要检验h×h型互作⑶C+D的显著性涉及到d×d型和h×h型互作⑷dh型互作与尺度C、D尺度有关，但影响A和B

4、尺度，A和B尺度检验d×d、d×h、h×h等互作。世代平均数方差均方差P13.6680.00720.0018P24.6030.00510.0013F13.2870.00020.0001F23.3430.01720.0043B14.0370.00100.0003B24.0980.03880.0097F33.4040.01530.0038不同世代包含的基因型种类和频率彼此不同，因而群体均值不同。各世代群体平均值的差异，实际上反映着基因效应种类及其比例的大小。将若干不同世代群体培育在相同环境下，则可根据世代平均值的比较，求

5、得基因效应及其相应变异的估值，这就是世代均值分析。—、遗传模型不同学者根据各自所作假定，所针对群体和考虑问题的出发点不同，分别提出了不同的世代均值构成遗传模型，据此可估算各类基因效应。第三节世代均值分析(一)Mather和Jinks的遗传模型这是Mather和Jinks1971年提出的遗传模型。这种模型假定P1为AABB，P2为aabb，所以各世代的遗传模型构成如下：(二)Hayman的遗传模型这是Hayman1958年提出的遗传模型，和Mather与Jinks的模型一样，有6个参数，P1的基因型为AABB，P2的基

6、因型为aabb，但他假定F2的平均值的遗传构成为m，即Mather和Jinks的有关参数减去h即得。(三)Gardner的遗传模型这种模型假定有4种参数m，d，h和i，P1的基因型为AABB，P2的基因型为aabb。二、用和差法估算基因效应这里采用Hayman的遗传模式，用实测值代替期望值可得将上述数据代入可得，世代平均数方差均方差P13.6680.00720.0018P24.6030.00510.0013F13.2870.00020.0001F23.3430.01720.0043B14.0370.00100.000

7、3B24.0980.03880.0097F33.4040.01530.0038它们的方差为各类基因效应的显著性测验三、用回归分析法估算基因效应用和差法估算基因误差较大，且繁琐，而用回归法进行均值分析，估算基因效应并进行相应显著性测验，较和差法简捷且精确度高，不必做更多的假定，现以Gardner模式为例，说明分析程序。该模式有四种效应m、d、h、dd，可分别将其表示为四个参数为：β0、β1、β2和β3，若用X0、X1、X2和X3分别表示各基因效应在不同世代群体内的系数，从而可得世代均值Y依X而变化的一组回归方程。举例①

8、②③变异来源df三参数四参数平方和均方世代5199.946d17.9937.993159.733159.733**h17.0884.69035.58935.589**离差34.6461.549dd12.1460.9140.914剩余23.7321.866第四节联合尺度检验单个尺度检验仅用少数世代，一次只检验一个尺度。为了扩大检验范围，Caval