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1、说明：这次文献检索的作业找的关键主题是“生物大分子”相关问题。就“生物大分子模拟仿真问题”的相关知识的文献检索结果初次主题本来是能源，背景检索意义为：展望未来，石油、天然气、核能和水能、风能、太阳能等可再生资源的份额则会提高，逐步形成多元化、优质化的能源结构。能源是现代经济社会发展的基础和重要制约因素，能源安全事关经济安全和国家安全。全球能源发展现状及问题有：能源资源品种丰富，人均占有量较少；能源建设不断加强，能源效率仍然较低；能源生产迅速增长，生态环境压力明显；能源消费以煤为主，能源结构需要优化；能源需求继续增加，可持续发展面临挑战。后根据检索结果，将检索主题定为“生物大分子模
2、拟仿真”主题意义：现在，人类基因组的框架已经绘制，21世纪的生命科学正迈向蛋白质组学的新时代。生物大分子将继续占领国际学科前沿，发挥已有优势，突出自身被研究的特色，成为学科交叉的中心点，展现生命活动的规律和本质。搜索工具：Webofknowledge（领先一步）关键词：“energy”（能源）初次搜索结果:近似值4,146,818发现问题：1、范围太大。2、找不到与化学主题贴近的文献。3、部分文献阅读难度太大。问题分析：由于关键字涵盖的范围太广，所以才会导致搜索结果过多，无法直接找到目标文献。解决方法：直接在结果内精炼检索结果---“Chemistry”再次搜索结果：近似值445
3、,094发现问题：检索结果还是范围很广问题分析：检索的关键字限制太少解决问题：再次精炼检索结果，添加精炼----“SCIENCETECHNOLOGY”,”ARTICLE’,”2009”,”ENGLISHI”.检索结果：近似值28,409我选择被引频次（降序）的顺序查看文献：结果分析：尽管是2009年发表的一些文章，部分文章的被引频次非常高。针对这次的结果，我决定直接浏览最高被引频次的第一篇文章：再次发现问题：作者研究的是生物大分子模拟仿真问题，并不是我要找的有关于能源的文章，为什么我会搜到这篇文章呢？问题分析：原因在于作者给出的关键字：解决问题：根据搜索结果，我决定改变搜索目标，
4、就锁定在这篇文章。文章精读：文章摘要：CHARMM(ChemistryatHARvardMolecularMechanics)isahighlyversatileandwidelyusedmolecularsimulationprogram.Ithasbeendevelopedoverthelastthreedecadeswithaprimaryfocusonmoleculesofbiologicalinterest,includingproteins,peptides,lipids,nucleicacids,carbohydrates,andsmallmoleculeligan
5、ds,astheyoccurinsolution,crystals,andmembraneenvironments.Forthestudyofsuchsystems.theprogramprovidesalargesuiteofcomputationaltoolsthatincludenumerousconformationalandpathsamplingmethods,freeenergyestimators,molecularminimization,dynamics,andanalysistechniques,andmodel-buildingcapabilities.T
6、heCHARMMprogramisapplicabletoproblemsinvolvingamuchbroaderclassofmany-particlesystems.CalculationswithCHARMMcanbeperformedusinganumberofdifferentenergyfunctionsandmodels,frommixedquantummechanical-molecularmechanicalforcefields,toall-atomclassicalpotentialenergyfunctionswithexplicitsolventand
7、variousboundaryconditions,toimplicitsolventandmembranemodels.Theprogramhasbeenportedtonumerousplatformsinbothserialandparallelarchitectures.Thisarticleprovidesanoverviewoftheprogramasitexiststodaywithanemphasisondevelopmentssincethepublicatio
