动物育种学第7章－个体遗传评定之BLUP法

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1、个体遗传评定－－BLUP法估计育种值关于遗传评定和育种值遗传评定的概念评定个体单个或多个性状的遗传价值预测后裔在特定环境下的表现科学、准确地选择种畜的方法选种、选配的主要依据育种工作的中心任务获得优良后代遗传评定的方法使要评估的个体在相同的环境下进行比较将要评估的个体或其亲属（同胞和后裔）集中在相对标准化的环境下进行性能测定性能测定站：鸡（选择指数法）用统计学方法对环境差异进行校正场内测定估计育种值（BLUP法）测定站测定和场内测定的定义据测定的场所进行划分测定站测定（stationtest）：将待测畜群集中在专门的性能测定站、并在一定时

2、间内进行性能测定场内测定（on-farmtest）:直接在各个畜牧场内进行的性能测定测定站测定和场内测定的优缺点测定站测定的优点：测定结果具有客观性、中立性被测畜群个体间的差异主要是遗传差异：相同的环境条件、测量工具和测量人员等可以对需要特殊测量设备或较高技术要求的性状进行测量：eg.体细胞数测定、氟烷敏感基因测定等测定站测定和场内测定的优缺点测定站测定的缺点：测定成本较高：运输费、检测费等测定规模有限：选择强度小容易传播疾病：不易对传染病进行控制遗传－环境互作：测定结果与场内测定有出入场内测定的优缺点：刚好与测定站测定相反。若场间个体缺

3、乏遗传联系时，不能跨场进行遗传评定测定站测定和场内测定的应用情况测定站测定：上世纪60-70年代，鸡、猪、牛等性能测定多用目前主要用于需要特殊设备才能测定的性状。eg.胴体品质、体细胞数场内测定：上世纪80年代以后，已成为世界各国性能测定的主要方式BLUP方法的广泛应用：校正环境的影响人工授精的普及：不同畜场个体间建立了遗传联系受遗传和环境的共同影响受多个基因的作用一般不能对单个基因进行分析绝大多数重要经济性状都是数量性状数量性状的基本特征表型值（P）=遗传效应（G）+环境效应（E）=加性遗传效应（A）+显性效应（D）+上位效应（I）+系

4、统环境效应（ES）+随机环境效应（ER）加性遗传效应：可以由亲代传递给后代的遗传组分表型值的效应分剖育种值的概念个体作为亲本的种用价值（对后代的遗传贡献）决定性状所有基因的平均效应总和衡量个体遗传素质的最主要指标不能被观测，只能根据表观信息（表型值）估计育种值的概念平均效应（α），遗传加性效应（A）一个个体随机交配的后代，其平均表型值与群体均值之差等于育种值的一半育种值的估计育种值估计方法：利用个体间的相似性，评定个体的遗传水平育种值估计方法的效率，直接关系到是否更真实地预测个体的遗传素质育种值估计方法的效率，也关系到群体的遗传进展和育种

5、效益问题利用各种可利用的表型信息和特定的统计学方法，将加性遗传效应从表型值中剖分出来基因+表型值数据库统计分析估计育种值环境估计育种值的精确性取决于可利用的信息量统计分析方法育种值估计方法利用所有亲属的信息可利用的亲属的表型信息直接的信息来源：本身，父母，后裔间接的信息来源：祖父母，全同胞，半同胞，叔叔，婶婶，………个体1/41/41/41/41/21/21/21/41/2祖父祖母外祖父外祖母父亲母亲同胞半同胞后裔关于BLUP育种值估计方法BLUP：结合了选择指数法和最小二乘法的优点选择指数法的基本要点不存在系统环境效应个体随机

6、来自同一总体各遗传参数事先已估计出来当满足三个前提时，使用选择指数法，可得到育种值的最佳线性预测（BLP）在家畜育种实践中使用选择指数的重要原则是满足第二个前提最小二乘法(LS)的基本要点1934年，Yates提出；1960年，Harvey引入到畜牧统计中可估计影响观察值的各种固定效应可将观察值中的固定效应校正出去对于不平衡数据可获得最佳线性无偏估计值（BLUE）利用最小二乘法（LeastSquares,LS）校正后的观察值称最小二乘均数BLUP产生和发展的背景选择指数法理论上的缺陷结合最小二乘方法的优点1949年C.R.Henderso

7、n理论上提出BLUP由于计算技术的滞后，限制了应用20世纪70年代中期计算机技术的发展，为BLUP在育种中应用提供了可能首先在奶牛育种中，而后在猪育种中应用我国先后在奶牛和猪育种中得到应用BLUP计算机程序的研制BLUP=最佳线性无偏预测（BestLinearUnbiasedPrediction)最佳-估计误差最小，估计育种值与真实育种值的相关最大线性-估计是基于线性模型（估计值与观察值呈线性关系）无偏-估计值的数学期望为真值（固定效应）或被估计量的数学期望（随机效应）预测-预测一个个体将来作为亲本的种用价值（随机遗传效应）BLUP的概念

8、BLUP是一种统计方法，畜禽育种中适合应用这一方法预测个体育种值，即遗传评定（geneticevaluation)BLUP的概念应用BLUP法进行种畜遗传评定，可以提高选种的准确性，进而加快群