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《西伯利亚鲟Sox17基因cDNA全长的克隆及其表达分析》由会员上传分享，免费在线阅读，更多相关内容在工程资料-天天文库。
1、西伯利亚禰Soxl7基因cDNA全长的克隆及其表达分析宋炜陈芬芳张凤英马春艳赵明马凌波中国水产科学研究院东海水产研究所农业部东海与远洋渔业资源开发利用重点实验室上海海洋大学水产与生命学院摘要：采用RACE技术获得西伯利亚❻寻(Acipenserbaerii)Sox17基因cDNA全长，序列分析表明，西伯利亚WSoxl7基因cDNA全长2671bp,包括588bp的5'端非翻译区，901bp的3,端非翻译区和编码393个氨基酸残基的1183bp开放阅读框。氨基酸序列比对显示，该基因具较高的保守性，与塞内加尔多鳍鱼(Pol
2、ypterussenegalus)的相似度最高为72%。系统进化分析表明，西伯利亚鲍与塞内加尔多鳍鱼聚为一支，且支持率为95%。以延伸因子efla(elongationfactor1-alpha)作为内参基因，对Soxl7基因在西伯利亚色寻各组织的相对表达量进行分析，发现Soxl7基因在不同组织中均有表达，但表达具有明显的组织差界性。在脑中表达量最高，而在肾、血液、眼、肠和胸鳍5个组织中表达量均较低。同时，Soxl7基因在西伯利亚鲂不同发育时期均有表达，但表达具有一定的吋间差异性。在宽神经板期的表达量高，相当于表达量最
3、低点11日龄仔鱼的167倍。本研究为量化西伯利亚垢胚胎发育分化过程屮相关基因提供了参照工具,同时可为今后深入研究西伯利亚鲂Soxl7在胚胎发育过程中的作用提供基础参考资料。关键词：西伯利亚仓寻;Soxl7;cDNA全长;表达分析;作者简介：宋炜(1983-)，男，副研究员，主要从事鱼类发育生物学研究。E-mail:swift83@sina.com作者简介：马凌波，研究员。E-nia订:malingbo@vip.sina.com收稿日期：2017-05-22基金：国家自然科学基金项目(31302161)Cloning,a
4、nalysisandexpressiondetectionoffull-lengthcDNAofSoxl7fromAcipenserbaeriiSONGWeiCHENFen-fangZHANGFeng-yingMAChun-yanZHAOMingMALing-boKeyLaborstoryofEastChinaSeaandOceanicFisheryResourcesExploita/tion,MinistryofAgriculture,EastChinaSeaFisheriesResearchInstitute,Ch
5、ineseAcademyofFisherySciences;Abstract：Inthisstudy,thefull-lengthcDNAofSoxl7genefromSiberiansturgcon(Acipcnscbaerii)wasobtainedusingRACEtechniques.Thefull-lengthofSox17genecDNAwas2671bpinlength,includinga1183bpopenreadingframe(ORF)encoded393aminoacids,a588bp5unt
6、ranslatedregion(5‘UTR)anda901bp3untranslatedregion(3‘UTR).MultiplealigrnnentanalysesshowedSiberiansturgeonwashighlyconservativetootherfishes.IthadhighsimilaritywithPloypterussenegalusof72%supportrating.Ph)dogeneticanalysisshowdthatSiberiansturgeonfirstclusteredt
7、ogetherwithPloypterussenegaluswiththeapprovalratingof95%.Andthenefla(elongationfactor1-alpha,efla)genewasusedasainternalreferenceondetectingtheexpressionofSoxl7geneinvarioustissuesofSiberiansturgconbyreal-timefluorescencequantitativcPCR.TheresultsshowedSoxl7gene
8、expressedindiferenttissuesandtheexpressionlevelofSoxl7wasrelativelylowinkidney,blood,eye,intestineandpelvicfin.However,inbrain,theexpressionlevelofSox17wasthehighesti
