Materials Studio快速入门教程

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1、MaterialsStudio快速入门教程该教程将介绍MaterialsStudio软件的基本功能，在这一部分，你将学到：1.生成Projects2.打开并且观察3D文档3.绘制苯甲酰胺分子4.观察并且处理研究表格文档5.处理分子晶体：尿素6.建造Alpha石英晶体7.建造多甲基异丁烯酸盐8.保存Project并结束1.生成Projects(1).运行MaterialVisualizer从运行菜单中运行或者在桌面点击快捷方式。(2).生成Project生成名称为MyQuickstart的Project。2.打开并且观察3D文档(1).调整显示风格在3D结构上单击右键，并选择DisplaySt

2、yle。右键菜单DisplayStyle对话框中的各选项的意义如下：Atom栏：DisplayStyle:Line：线状模型。Stick：棍状模型。Ballandstick：球棍模型。CPK：球堆砌模型。Polyhedron：多面体堆积模型（晶体）。Lattice栏:Display:显示单个晶胞或者元胞。Range：显示在X、Y、Z方向上晶胞的数量。Lattice:显示晶胞边界的风格。在3D结构上单击右键并选择Lighting选项，该选项将指定加光情况：在此选项卡内可以设定三个光源，并改变光源的照射位置（照射位置用箭头显示）。(2).改变3D结构的视图可以使用3DViewer工具栏上的工具来

3、改变3D视图。通过选择相应的工具并在3D结构上拖动来改变结构视图。Rotate:旋转结构视图。Zoom:向上或者右侧拖动可以增大所选结构的视图；向下或者向左侧拖动会缩小所选结构的视图。Translation:将结构沿着不同的方向平移。对于三键鼠标来说，左键执行所选操作，中键始终是平移操作，而右键则是旋转操作，同时按下左健和右键则会完成缩放操作。此外还可以将键盘和鼠标联用来完成上述操作。以下操作将改变3D结构的位置：FittoView:根据窗口的尺寸，为3D结构选择合适的大小。Recenter:将结构放置到窗口的中心，结构大小不变。ResetView:将结构放置到窗口中原来的位置，并恢复原有大

4、小。(3).选择对象的各种类型在3DView工具栏上选择3DViewerSelectionMode，并通过单击原子、键来选择相应的对象。该对象变为黄色表示已经被选中。通过鼠标的托拽操作可以选择一定区域内的所有对象，包括原子和键。在结构中的某个原子或键上双击鼠标可以选择整个结构。3.绘制苯甲酰胺分子化学家不得不每天处理大范围的小分子和中间体。快速生成该类分子对于每一个分子建模环境都是非常重要的。苯甲酰胺分子就是这样一种小分子，在下边我们将以该分子作为例子，进行研究工作。下面是要建造的苯甲酰胺结构：(1).生成3D文档在菜单上选择New，并且选择3DAtomisticDocument后单击OK。

5、此时文件名称出现在左侧的ProjectExplorer中，名称为3DAtomisticDocument.xsd，在其上单击鼠标右键，选择ReName进行改名并进行保存。(2).将分子改变为球棍模型在DisplayStyle对话框中进行详细操作。(3).绘制分子环和原子链在Sketch菜单上选择SketchRing工具，并移动到文档中绘制环（环的右侧会显示环的尺寸，可以在键盘上按下数字键3-8来改变环的大小）。现在选择SketchAtom工具，移动到环上，当原子变为绿色后表示可以进行绘制操作，单击原子将键连接到该原子上，然后移动鼠标并在合适位置单击设置另一个原子。要结束绘制，请在最后一个原子上

6、双击鼠标左健或者按下键盘上的Esc键。注意：可以使用Undo命令取消上一次操作。(4).绘制氧原子在SketchAtom的选项箭头下选择氧原子，并以相同的方法绘制氧原子。(5).编辑原子类型选中某个原子后，在Modify菜单下的ModifyElement中选择Oxygen来改变原子类型。或者可以在Sketch工具栏中选择ModifyElement按钮来直接改变原子类型。(6).编辑键的类型首先选择两个原子之间的键，然后在Sketch工具栏上的ModifyBondType按钮来改变键的类型，同样的选项也可以在Modify菜单下的ModifyBondType中找到。如果要选择多个原子或键，请按下

7、Shift后再进行选择。如要取消选择，请在结构外单击鼠标左键。(7).调整氢原子并进行整理可以通过程序自动加氢而不需要单独的为每个原子加上合适的氢原子。在Sketch工具栏上，单击AutoHydrogen按钮为结构加入合适的氢原子，并按下Clean按钮修正结构的几何，这样结构中的键、键角和扭转角都会变得具有化学合理性。(8).将共轭结构转化为凯库勒式MSModeling可以很轻松的在共轭结构和凯库勒式之间进行