白菜翻译起始因子eIF(iso)4Eac与芜菁花叶病毒TuMV-C4UK1蛋白互作分析

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1、白菜翻译起始因子elF(iso)4E」/c与芜菁花叶病毒TUMV-C4/UK1蛋白互作分析李国亮钱伟张淑江李菲章时藩张慧谢露露武剑王晓武孙日飞中国农业科学院蔬菜花卉研究所摘要：为阐明白菜翻译起始因子异构体elF(iso)4E的表达特性，以及该异构体与芜菁花叶病毒(TuMV)的互作关系，在白菜'极早春'屮克隆了elF(iso)4E.a基因，在'BP8407'中克隆了cIF(iso)4E.c基因。这两个基因长度一致，均编码200个氨基酸。酵母双杂交和双分子荧光互补试验表明：elF(iso)4E.a仅与Tu

2、MV-C4株系互作，而不与TuMV-UKl株系互作；elF(iso)4E.c仅与TuMV-UKl株系互作，而不与TuMV-C4株系互作。对白菜elF(iso)4E蛋白氨基酸序列及空间结构分析发现:elF(iso)4E蛋白包含帽结合蛋白结构，elF(iso)4E.a和cIF(iso)4E.c蛋口间存在20个差异氨基酸，其中17个差异氨基酸位于帽结合蛋白结构上;TuMV-C4VPg与TuMV-UKlVPg蛋白有4个氨基酸差界位点。通过对TuMV不同株系的VPg蛋白(病毒基因组连接蛋白)氨基酸序列频率分析发

3、现，在4个氨基酸差异位点处，氨基酸的使用频率具有选择性。关键词：白菜;elF(iso)4E;TuMV;VPg(virusgenome-linkedptotein);互作关系;作者简介：孙日飞E-mai1:sunrifei@caas.cn;Tel:010-82109511收稿日期:2017-03-17基金：国家自然科学基金项目(31372069)AnalysisoftheProteinInteractionofelF(iso)4E・a/cwithTuMV-C4/UKlinBrassicarapassp.

4、chinensisLIGuoliangQIANWeiZHANGShujiangLIFeiZHANGShifanZHANGHuiXIELuluWUJianWANGXiaowuSUNR辻eiInstituteofVegetablesandFlowers,ChineseAcademyofAgriculturalSciences;Abstract：Toclarifytheexpressioncharacteristicsofeukaryoticinitiationfactors[elF(iso)4E]andt

5、heinteractionrelationshipofelF(iso)4EwithTuMVVPg,theeTF(iso)4E.aandeTF(iso)4E.cgeneswereclonedfromtheBrassicarapassp.chincnsismaterials'Jizaochun，and'BP8407,,respectively.Bothofthetwogenescouldencode200aminoacids.Theyeasttwo-hybridandbimolecularfluoresc

6、encecomplementation(BiFC)resultsshowedthatTuMV-C4couldonlyinteractwithelF(iso)4E.a,insteadofeTF(iso)4E.c;theTuMV-UKlcouldonlyinteractwitheTF(iso)4E.c,insteadofcIF(iso)4E.a.AnalyzingtheaminoacidsequenceandthedomaintertiarystructureofelF(iso)4Eproteinreve

7、aledthatitcontainedthecap-receptionsite.Therewere20differentaminoacidsbetweenelF(iso)4E.aandeIF(iso)4E.c,17ofwhichwerelocatedinthecap-receptionsite(accountingfor85%).ThroughaligningtheTuMV-C4/UKlVPgaminoacidsequcncos,fourdifferentoniinoacidswerefound;an

8、daftercomparativeanalyzingthesequencesfromdifferentTuMVstrains,thefrequencyoftheaminoacidshadcertainselectivityinthefouraminoacidpoints.Keyword：Brassicarapassp;chincnsis;cIF(iso)4E;TuMV;VPg(virusgenome-linkedprotein);proteininter