核酸的提取与纯化

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时间:2019-08-08

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1、核酸的提取与纯化一DNA的提取与纯化(一)实验目的与主要原理DNA存在于细胞核中。通过裂解组织与细胞,使细胞膜破碎,暴露出DNA与蛋白质的混合物。此时,通过蛋白酶的消化,使DNA与蛋白质进行分离,而后利用硅胶柱或者酚:氯仿法,去除蛋白质,从而提取高纯度DNA。(二)实验材料蛋白质K(20mg/ml),裂解液(100mmol/lTris(pH8.0),500mmol/LEDTA(pH8.0),20mmol/lNaCl,10%SDS),硅胶柱,TE(10mmol/lTris-HCl,1mmol/LEDTA(pH8.0),0.5*TAE(20mmol/lTris-乙酸,0.5mm

2、ol/lEDTA,pH8.0),10*Loadingbuffer(50mmol/lEDTA,60%甘油,0.25%溴酚蓝,pH7.0)。(三)实验方法DNA提取的方法目前主要有两种,一种是利用酚:氯仿抽提的方法,另一种是利用硅胶柱吸附的方法。其中酚:氯仿抽提法由于试剂具有较强的腐蚀性和毒性,且对环境污染较大,目前使用者较少。而硅胶柱的方法操作比较简单,且毒性很低,对环境的影响较少,故而被广大实验者所使用。目前硅胶柱的生产厂家较多,以沉淀方法较为多见,主要步骤如下。1样本前处理哺乳动物细胞:提前准备55℃冰浴。(1)对于贴壁细胞,用胰蛋白酶或其他方法收集细胞,对于悬浮细胞,直

3、接收集细胞。用PBS洗3次。(2)加入3倍体积的裂解液,加入蛋白液K终浓度达到500ug/ml,37℃孵育4~6小时。动物组织:提前准备55℃,70℃水浴。(1)将25mg动物组织切碎,置于一无菌的1.5ml离心管中(注意,尽量越碎越好)。(2)加入150~200ul的裂解液(含500ug/ml的蛋白酶K),55℃孵育直至完全裂解,(因组织不同而异,鼠尾6~8h,可以过夜裂解,每小时颠倒2~3次)。(3)如果需要去除RNA,可以加入适量RnaseA于样品中,室温孵育2min。(4)12000r离心5min,转移上清于一无菌的离心管。2DNA提取过程(1)利用2倍体积无水乙醇

4、和1/10体积的3mmol/L醋酸钠沉淀DNA(注意沉淀为DNA,不能弃去)(2)将上述混合物加入硅胶柱中,12000r离心1min,后用75%的乙醇清洗杂质,洗2~3次。(3)将硅胶吸附柱置于干净的离心管中,在柱的中央加入200ul预热TE(60℃),或去离子水(pH)7.0),室温静置1min,12000r离心1min,洗脱DNA。洗脱出的DNA置于-20℃保存。    3琼脂糖凝胶电泳(1)1%琼脂糖的配制:例如:0.15g琼脂糖+15ml0.5*TAE微波炉加热至沸腾,待降低至70℃加入Goldview染料(5ug/100ml),倒入小型胶槽中(其他规模胶槽按此比例

5、配制)。室温静置40min。(2)取50~100ngDNA,用去离子水补充体积至10ul,加入1ul10*DNAloadingBuffer,进行电泳。电泳120V20~30min(电泳液5*TAE) (四)注意事项1裂解液与样品的比例要适当,过少的裂解液可能导致样本裂解不完全,而过多的裂解液也会影响提取效果。2尽量切碎组织,以免影响裂解效果;完全裂解后可以呈粘稠状。3组织标本一般要保存在-80℃冰箱或液氮中,且避免反复冻融;使用无菌离心管和枪头,避免DNA酶污染。一.RNA的提取与纯化(一)实验目的与实验原理RNA的提取方法有很多种,其中Trizol试剂提取RNA是目前常用

6、的方法之一。Trizol是由苯酚和异硫氰酸胍配制而成,在匀浆和裂解过程中,Trizol可以裂解细胞、降解细胞其他成分,但同时保护RNA,抑制RNA酶活性。在氯仿抽提后,RNA存留在水相中,用异丙醇可以将其沉淀,最后得到RNA。(一)实验材料Trizol,氯仿,DEPC水,DEPC水配制75%乙醇,10*MOPS缓冲液(0.2mol/LMOPS,80mmol/lNaAc,10mmol/lEDTANa2),1*MOPS电泳缓冲液(10*MOPS150ml,37%甲醛80ml,加水至1500ml),10*RNA上样缓冲液(50%甘油,1mmol/lEDTA,0.25%溴酚蓝,0.

7、25%二甲苯青)。(二)实验步骤1RNA的提取(1)25cm*25cm培养瓶细胞+1mlTrizol(吹打使之充分裂解);100ml组织+1mlTrizol(超声破碎仪破碎细胞使之充分裂解),注:6孔板:加0.5mlTrizol。(2)收集后转入0.5mlEP管,加200ml氯仿。(3)颠倒混匀至氯仿完全混匀,室温2~3min(发现液面分为两层,上层为清亮,下层为红色)。(4)离心:4℃,12000r,10min.(5)转上层水相到1.5EP管,尽量避免吸取中层蛋白质层。注:上层为RNA;中层为蛋白;下层为DNA。

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