利用基因芯片筛查大肠癌肿瘤相关基因_曾伟

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1、生物医学工程与临床2010年11月第14卷第6期BME&ClinMed,November2010,Vol.14,No.6-541-doi:10.3969/j.issn.1009-7090.2010.06.019·生物工程·利用基因芯片筛查大肠癌肿瘤相关基因曾伟121111111,南清振,戴益琛,陈章兴,谢军培,傅育卡,林志翔,姜元芹,朱小三摘要:目的探讨大肠癌肿瘤相关基因的差异表达。方法采用含有8064个人类靶基因的基因表达谱芯片筛选大肠癌组织同正常大肠黏膜的差异表达基因,并用逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)技术对其中4条差异表达基因加以验证。结果大肠癌差异表达基因有1807条,发现上调表达

2、的基因有936条,下调表达的基因有871条,其中癌基因及抑癌基因共57条。这57条基因中,36条基因表达上调,21条基因表达下调。结论大肠癌的发生发展与多个原癌基因及抑癌基因的差异表达有关。关键词:大肠癌;芯片技术;基因中图分类号:R735.3文献标识码:A文章编号:1009-7090(2010)06-0541-05Screeningcolorectalcancertumor-relatedgeneswithgenechipZENGWei1,NANQing-zhen2,DAIYi-chen1,CHENZhang-xing1,XIEJun-pei1,FUYu-ka1,LINZhi-xiang1,

3、JIANGYuan-qin1,ZHUXiao-san1(1.DepartmentofGastroenterology,No.174thHospitalofPLA,Xiamen361003,Fujian,China;2.DepartmentofGastroenterology,NanfangHospital,SouthernMedicalUniversity,Guangzhou510515,Guangdong,China)Correspondingauthor:DAIYi-chen.E-mail:dyichen@sina.comAbstract:ObjectiveToinvestigatethe

4、differenttumor-relatedgenesexpressionincolorectalcancer.MethodsTheexpresseddifferentiallygenesbetweencolorectalcancerandnormalcolorectaltissueswereanalyzedwithgenechip(contained8064humantargetgenes),andof4geneswereverifiedbyreverse-transcriptionpolymerasechainreaction(RT-PCR).ResultsThe1807genesexpr

5、esseddifferentiallyincolorectalcancer,and936genesunregulatedand871genesdownregulated;Thedifferentexpressionofoncogenesandtumorsuppressorgeneswere57,which36genesunregulatedand21genesdownregulated.Amongthe1807expresseddifferentiallygenes,theresultsofRT-PCRtoverify4pairsofdifferentialexpressiongeneswer

6、econformedtogenechip.ConclusionItisdemonstratedthatcolorectalcancerdevelopmentisrelatedtodifferentialexpressionofmultipleproto-oncogenesandtumorsuppressorgene.Keywords:coloncancer;chiptechnology;gene目前,人类对于肿瘤的认识和研究已经进入到分大肠腺癌组织5例,癌旁正常大肠黏膜组织5子水平,越来越多的肿瘤相关基因被鉴定,一些已经例,均经病理组织检查证实。留取的新鲜组织标本,用成为临床上早期诊断肿瘤的重

7、要指标,而一些甚至成Rnase-Free0.9%氯化钠溶液漂洗,锡纸包裹并标记为了开发抗肿瘤药物的重要分子靶点。大肠癌是我国后迅速冻存于液氮中备用。含有8064个人类靶基因最常见的消化道恶性肿瘤之一,近年来其发病率逐年的基因表达谱芯片1张,由深圳微芯生物公司提供。增加[1][2]检测大肠,并趋于年轻化,笔者应用基因芯片1.2芯片杂交癌和正常大肠组织基因群,根据其表达的差异筛选出按Trizol法提取

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