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时间：2019-07-16
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1、实验五进化树分析实验目的1.理解系统发育分析的基本原理2.学会使用MEGA5.1软件包构建系统发育树。实验原理系统发生树（英文：Phylogenetictree）又称为演化树（evolutionarytree），是表明被认为具有共同祖先的各物种间演化关系的树。是一种亲缘分支分类方法。（cladogram）。在树中，每个节点代表其各分支的最近共同祖先，而节点间的线段长度对应演化距离（如估计的演化时间）。MEGA5可以识别fasta格式文件将17-RNASE1.fasta.txt重命名为17-RNAS
2、E1.fasta选择打开方式为MEGA5，打开17-RNASE1.fasta，自动跳出序列窗口用ClustalW做多序列联配ClustalW参数设置多序列联配后结果以.meg格式保存结果回到MEGA主窗口打开所保存的文件（.meg）点击按钮打开文件窗口显示保守位点显示变异位点回到MEGA主窗口构建进化树当前打开的文件选择邻接法建树选择Bootstrap检验作业1.使用MEGA5.05软件包构建蛋白质进化树的具体使用顺序，并写出具体步骤。2.以下面的序列为材料构建系统进化树，并将进化树抓图。附序列：
3、花生SAMDC蛋白质进化树分析，见SAMDCms.txt文档。
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