基于单碱基延伸和酶放大系统的SNP漏声表面波生物传感器的实验研究

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1、基于“单碱基延伸和酶放大系统”的SNP漏声表面波生物传感器的实验研究唱凯,陈伟,张泉,徐泽刚,靳晓军,张可珺,王云霞,王丰,陈鸣(第三军医大学大坪医院野战外科研究所检验科,重庆400042)摘要:目的 探讨漏声表面波生物传感器检测单核苷酸多态性(SNP)的方法。方法 分别在漏声表面波生物传感器反应体系加入2条仅存在一个碱基不同(A/G)的靶序列,与固定的探针杂交。利用酶生物信号放大系统,结合单碱基延伸技术,观察其杂交信号的改变。结果 靶位点为完全匹配的A时,相位下降(6.47±0.42)°;而靶位点为错配的G时,相位下降仅为(0.77±0.25

2、)°,两者差异有统计学意义(P<0.01)。结论 成功建立了漏声表面波生物传感器检测SNP的新方法。关键词:漏声表面波生物传感器;信号放大;SNP中图法分类号:文献标识码:AStudyofSNPLeakySurfaceAcousticWaveBiosensorDetectiononSingleBaseExtensionandEnzymeAmplificationSystemCHANGKai,CHENWei,ZHANGQuan,XUZe-gang,JIXiao-jun,ZHANGKe-jun,WANGYun-xia,CHENMing(Depart

3、mentofClinicalLaboratoryMedicine,ThirdAffiliatedHospital,ThirdMilitaryMedicalUniversity,Chongqing400042,China)Abstract:ObjectiveToexploreamethodforsinglenucleotidepolymorphism(SNP)detectionusingleakysurfaceacousticwave(LSAW)biosensor.MethodsTwotargersequenceswhichexistjuston

4、ebasedifference(A/G)wereaddedontheLSAWbiosensorreactionsystem,andwerehybridizedwithcorrespondingprobes.Combiningenzymesignalamplificationsystemandsinglebaseextension(SBE)technology,changesofthehybridizationsignalwereobserved.ResultsPhasedecreased(6.47±0.42)degreewhenthetarge

5、rpointwasmatchedA.Whilephasedecreased(0.77±0.25)degreewithmismatchedG.Phasechangewassignificantlydifferent(P<0.01).ConclusionAnewmethodforSNPdetectionwithLSAWbiosensorwassuccessfullyestablished.Keywords:LSAWbiosensor;signalamplification;singlenucleotidepolymorphism单核苷酸多态性(si

6、nglenucleotidepolymorphism,SNP)作为基因变异的主要形式,以其数量多、分布广和稳定遗传等特点,在生物医学、遗传学、基因突变与疾病易感基因筛查、药物敏感性基金项目:国家高技术研究发展计划(863计划,2007AA02Z416);国家自然科学基金(30400107);军队十一五科技攻关项目(06G073)SupportedbytheNationalHighTechnologyResearchDevelopmentProgramofChina(863Program,2007AA02Z416),theNationalNatu

7、ralSeienceFoundationOfChina(30400107)andtheEleventhFive-yearmilitaryscienceandtechnologyproject(06G073)作者简介:唱凯,男,黑龙江佳木斯人,主要从事生物传感器方面的研究。E-mail:changkai111111@163.com通信作者:陈鸣,电话:(023)68757602,E-mail:chenming1971@yahoo.cn收稿日期:2009-07-17;修回日期:2009-09-10研究以及人群进化史研究和作物品种鉴定等方面中发挥着重

8、要的作用[1-3]。但由于缺乏简单有效快速低廉的临床检测手段,SNP的研究还停留在实验室阶段。生物传感器[4]是将生物活性材料(酶、蛋白质、DNA、抗

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