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时间:2019-07-10
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1、第二章酶学基础知识一、酶的本质、组成、分类和命名酶的定义:由生物体活细胞产生的能加快反应速度的蛋白质及小分子RNA,是生物催化剂。本质:传统的酶(蛋白类酶):蛋白质……参与体内广泛的生化反应核酶(核酸类酶):小分子RNA.……参与RNA的剪接酶的分子组成蛋白质部分:酶蛋白(apoenzyme)辅助因子(cofactor)金属离子小分子有机化合物全酶(holoenzyme)单纯酶(simpleenzyme)结构组成仅含氨基酸组分结合酶(conjugatedenzyme)酶蛋白决定反应的特异性辅助因子决定反应的种类与性质辅助因子a.本身无
2、催化作用b.负责运输转移电子,原子等作用 有些蛋白质具此作用称蛋白辅酶c.可用透析法将辅助因子(辅酶)除去d.若辅助因子(辅基)以共价键和酶蛋白牢固结合,不易透析除去金属酶(metalloenzyme)金属离子与酶结合紧密,提取过程中不易丢失。金属激活酶(metal-activatedenzyme)金属离子为酶的活性所必需,但与酶的结合不甚紧密。辅助因子也可以是小分子有机化合物维生素或者维生素的衍生物转移的基团小分子有机化合物(辅酶或辅基)名 称所含的维生素氢原子(质子)NAD+(尼克酰胺腺嘌呤二核苷酸,辅酶I尼克酰胺(维生素PP)
3、之一NADP+(尼克酰胺腺嘌呤二核苷酸磷酸,辅酶II尼克酰胺(维生素PP)之一FMN(黄素单核苷酸)维生素B2(核黄素)FAD(黄素腺嘌呤二核苷酸)维生素B2(核黄素)醛基TPP(焦磷酸硫胺素)维生素B1(硫胺素)酰基辅酶A(CoA)泛酸硫辛酸硫辛酸烷基钴胺素辅酶类维生素B12二氧化碳生物素生物素氨基磷酸吡哆醛吡哆醛(维生素B6之一)甲基、甲烯基、甲炔基、甲酰基等一碳单位四氢叶酸叶酸某些辅酶(辅基)在催化中的作用酶可按其所催化的反应类型进行分类(一)催化氧化还原反应的酶属于氧化还原酶类氧化还原酶类(oxidoreductases)包括催化
4、传递电子和氢、以及需氧参加反应的酶。例如,脱氢酶类、加氧酶类、过氧化物酶和过氧化氢酶等。(二)催化分子间基团转移的酶属于转移酶类转移酶类(transferases)包括将磷酸基从ATP转到另外底物的激酶、加无机磷酸使化学键断裂的磷酸化酶,以及糖基转移酶、转氨酶等。(三)水解酶类催化加水分解化学键水解酶类(hydrolases)按其所水解的底物不同根据它们的作用部位蛋白酶、酯酶、磷酸酶、糖苷酶、核酸酶外切酶、内切酶(四)裂合酶催化移出化学基团并形成双键或相反的过程裂合酶或裂解酶类(lyases)是指催化一分子非水解地分裂成两个分子并留有双键
5、,或相反的酶。如:脱水酶、脱羧酶、醛缩酶合酶(synthases)催化反应方向相反,一个底物去掉双键,并与另一底物结合形成一个分子的酶。(五)催化分子异构体互变的酶类属于异构酶类异构酶类(isomerases):催化分子内部基团的位置互变、几何或光学异构体互变、以及醛酮互变的酶类。如:变位酶、表构酶、异构酶。(六)催化两分子结合成一分子并偶联有高能键的水解供能的酶类属于连接酶或合成酶类DNA连接酶、氨基酰-rRNA合成酶、谷氨酰胺合成酶属于连接酶或合成酶类(ligases或synthetases)。酶可按其所催化的反应类型予以命名(一)系
6、统名称给出酶促反应的各种信息,但较繁琐习惯命名法,一般是按酶所催化的底物命名,在其底物英文名词上加后缀“ase”作为酶的名称。如:蛋白酶(protease)、磷酸酶(phosphatase)原则:1,绝大多数依据其底物来命名。 催化水解蛋白质的称为蛋白酶。2,某些酶根据其所催化的反应性质来命名。 水解酶催化底物分子水解。3,有的结合上述两个原则来命名。 琥珀酸脱氢酶是催化琥珀酸脱氢反应的酶。4,有的还加上酶的来源或酶的其他特点。 胃蛋白酶、胰蛋白酶系统命名法:EC:1.4.1.3EC----enzymeco
7、mmission1.----类(氧化还原酶类)4.----亚类1.----亚-亚类3.----亚-亚类中的排序系统命名法根据酶所催化的整体反应,按酶的分类对酶命名,每个酶都有一个名称和一个编号。酶的分类系统名称编号催化的反应推荐名称1.氧化还原酶类(S)-乳酸:NAD+-氧化还原酶EC1.1.1.27(S)-乳酸+NAD+丙酮酸+NADH+H+L-乳酸脱氢酶2.转移酶类L-丙氨酸:-酮戊二酸氨基转移酶EC2.6.1.2L-丙氨酸+-酮戊二酸丙酮酸+L-谷氨酸丙氨酸转氨酶3.水解酶类1,4--D-葡聚糖-聚糖水解酶EC3.2.1.1水
8、解有3个以上1,4--D-葡萄糖基的多糖中1,4--D-葡糖苷键-淀粉酶4.裂合酶类D-果糖-1,6-二磷酸D-甘油醛-3-磷酸裂合酶EC4.1.2.13D-果糖-1,6-二磷酸磷酸二羟
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