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《西北太平洋厚蟹属的物种界定和生物地理学研究》由会员上传分享，免费在线阅读，更多相关内容在教育资源-天天文库。
1、SpeciesDelimitationandHistoricalBiogeographyintheGenusHelice(Brachyura:Varunidae)intheNorthwesternPacificWeiYin,CuizhangFu*,LiGuo,QixinHe,JunLi,BinsongJin,QianhongWuandBoLi西北太平洋厚蟹属的物种界定和生物地理研究ZOOLOGICALSCIENCE26:467–475(2009)报告人：胡志勇指导教师：傅萃长副教授作者介绍通讯作者：傅萃长博士研究生复旦大学研究方向：生物地理学，鱼类进化副教授复旦大学主要研究方向：
2、生态与历史生物地理；亲缘动物地理学；鱼类的系统发育与进化；河口的鱼类生态学与渔业第一作者：殷维Contents研究背景1目的内容2材料方法3研究结果4讨论5重要名词解释Pliocene：上新世，属于新生代第三纪后期，上新世猿人下树进入平地Pleistocene：更新世，属于新生代第四纪早期，更新世人类开始出现juniorsynonyms：后来命名的同物异名种，一般不被采用analysisofmolecularvariance(AMOVA)：分子方差分析指通过估计单倍型(含等位基因)或基因型之间的进化距离,进行遗传变异的等级剖分，巧妙的避开了分子差异不便于计算的难题Haplotyp
3、le：是单倍体基因型的简称，在遗传学上是指在同一染色体上进行共同遗传的多个基因座上等位基因的组合研究背景厚蟹属Helice厚蟹隶属于节肢动物门、甲壳纲、十足目、方蟹科厚蟹种类：台湾厚蟹H.formosensis;侧足厚蟹H.latimera;天津厚蟹H.tientsinensis;三齿厚蟹H.Tridens共四种2.厚蟹分布：西北太平洋大陆和岛屿海岸线潮间带的较高区域FrombaiduYinetal.研究背景西北太平洋独特的地理特征邻接着众多的边缘浅海，有日本海、黄海、东中国海、南中国海西北太平洋在末次盛冰期时的海岸线(Ota,1998)引自陈卉上新世和更新世冰期交替海平面的升降
4、海面轮廓改变影响物种的形成隔离和二次接触作用过程研究背景—此前的研究影响近海鱼类种群空间结构(Liuetal.,2006,2007)影响海洋产卵蟹类的物种形成和种群空间结构(Wangetal.,2008)影响潮间带螺类和近海鱼类的系统地理分布(Kojimaetal.,2003,2004,2006;Liuetal.,2008)鱼类蟹类螺类鱼类上新世和更新世冰期交替西北太平洋洋流研究背景此前的研究ShihandSuzuki(2008)分析了厚蟹线粒体16SRNA和COI基因，认为H.latimera,H.formosensis和H.tientsinensis组成了一个有待解决的复合分
5、支H.latimeraclade，由此推测厚蟹可能只由两个种组成H.latimera和H.Tridens研究背景ShihandSuzuki的研究存在的不足使用的分子标记少，仅有16SRNA和COI基因研究的地理区域相对较小形态学没有佐证Shih提出的H.formosensis和H.Tientsinensis是H.latimera同物异名种(他们眼框下的齿堤数有显著差异)没有给出明确的种的分界标准研究目的本研究拟解决的问题扩大研究的范围使用更多分子标记探究厚蟹属内物种的个数，建立种与种之间的形态学分类标准研究厚蟹属的历史生物地理学，分析厚蟹属的物种形成机制材料方法厚蟹的采集共17个
6、样点共采集123个样本,—42H.formosensis—37H.latimera—42H.tientsinensis—1Helicanawuana—1Chasmagnathusconvexus材料方法DNA的提取,扩增,测序采用酚氯仿法从蟹的腿部肌肉提取总DNA(Palumbi,1996)PCR扩增以下片段：12SrRNA,16SrRNA,COI,ITS-2和28SrRNA1.5–2.0%的琼脂糖凝胶电泳纯化PCR产物使用与PCR相同的引物做测序实验内容系统发育树的构建第一步：序列排序和视觉检查(ClustalX1.83(Thompsonetal.,1997)第二步：选择数集和
7、拆分序列：以(12S+16S+COI)基因为数据集构建系统树，首先划数集为五部分12S,16S,和3个COI编码区,每一部分在MrModeltestversion2.2(Nylander,2004)中选择一个独立替代模型第三步：以每百代取样频率在MrBayesversion3.1.1中运行九百万代(RonquistandHuelsenbeck,2003)第四步：丢弃前三分之一部分，余下部分用于构建系统树实验内容单倍型网络图的构建第一步：单倍型的鉴别使用软件DnaSP4.20(Ro
