Gaussian09模拟ECD光谱确定天然产物绝对构型

《Gaussian09模拟ECD光谱确定天然产物绝对构型》由会员上传分享，免费在线阅读，更多相关内容在学术论文-天天文库。

1、Gaussian09模拟ECD光谱确定天然产物绝对构型（YJH）Gaussian模拟溶剂下的ECD光谱已知:某天然产物的平面结构如下图，通过NMR确定了1，2位的相对构型；目的：通过Gaussian计算ECD光谱，确定该化合物的绝对构型。该化合物在甲醇中的CD谱见下图。 首先我们会在GV中将构建这个化合物，并对化合物的结构进行优化。这个化合物有两个手性中心，分别为图中1,2所指的位置。事先已经得知OH和Ar的朝向相反，所以若连接Ar的手性碳为S构型，则连接OH的手性碳为R，称为情况1.若连接Ar的手

2、性碳为R构型，则连接OH的手性碳为S构型，称为情况2. 在情况1下，构建的输入文件如下：====================================================1.%nprocshared=162.%mem=32GB3.%chk=/home/xs/yjh/cdtry2-1C.chk4.#optfreqb3lyp/6-31g(d)scrf=(solvent=methanol)5.6.[NoTitle]7. 018. C                -5.5562823

3、8  -1.31201768   0.415028389. C                -5.49337448  -2.68989041   0.6677139010. C                -4.26766705  -3.36415459   0.6007378911. C                -3.09945710  -2.66258202   0.2812064712. C                -3.13176688  -1.26596279   0.14

4、49638413. C                -4.36150486  -0.59503739   0.2079908114. C                -1.78779957  -3.42132119   0.0652469115. C                -0.60584820  -2.48940164   0.3418669116. C                -0.79125907  -1.23039583  -0.5181315517. O         

5、       -1.92754854  -0.49268059  -0.0309965618. C                -4.39446030   0.92949183   0.074575101. C                -3.23488067   1.65664195  -0.222069402. C                -3.28962707   3.05618841  -0.282718233. C                -4.50192220   3.

6、71953238  -0.041688544. C                -5.65965114   2.98056177   0.241037195. C                -5.59961760   1.58146545   0.277838606. O                -6.85529518  -0.68189906   0.364309107. O                -4.21166207  -4.77166494   0.847117228. 

7、O                 0.60690589  -3.16358866  -0.003977419. C                 0.45578307  -0.33296230  -0.4127867910. C                 0.82247778   0.48633577  -1.4890208111. C                 1.95726104   1.30305033  -1.3930432412. C                 2.7

8、2538924   1.30037579  -0.2209301113. C                 2.35872770   0.48108566   0.8552594214. C                 1.22393132  -0.33559747   0.7593559015. O                 3.88338530   2.13368389  -0.1230911416. O                 2.33143