《生物物理学导论》PPT课件

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1、生物物理学导论-09第五章生物能力学(2)Calvin循环示意图首先,五碳化合物二磷酸核酮糖(RuDP)在反应中得到一分子二氧化碳(CO2),反应被羧基歧化酶催化,产生的六碳化合物直接分解成二分子的三碳化合物3-磷酸甘油酸(PGA)。然后,磷酸甘油酸(PGA)被ATP磷酸化,并被转氢酶(尼克酰胺腺嘌呤二核苷酸磷酸NADPH)还原成3-磷酸甘油醛(TP)。随后,六分之一甘油醛(TP)被醛缩酶还原成1,6-二磷酸果糖(FDP),通过一系列酶促反应转化为葡萄糖(G6P)。其余部份通向含又一个ATP调节的磷酸化步骤的反应循环,重又形成五碳化

2、合物二磷酸核酮糖。产生一分子葡萄糖,循环反应需要羧化和歧化六分子的二磷酸核酮糖,形成十二分子磷酸甘油酸。十二个这样的分子需要十二分子ATP和十二分子尼克酰胺腺嘌呤二核苷酸磷酸酶(NADPH),以形成十二分子磷酸甘油醛。两个磷酸甘油醛分子然后结合起来最终形成一个葡萄糖分子,其余十个磷酸甘油醛分子通过循环,再利用六个ATP分于形成六个新的二磷酸核酮糖分子。整个过程需要十二分子的尼克酰胺腺嘌呤二核苷酸磷酸酶(NADPH)和十八分子的ATP;在光反应中每两分子尼克酰胺腺嘌呤二核苷酸磷酸NADP+的还原,需要三个ATP分子以实现Calvin循

3、环。在光诱导的循环电子途径中,一个额外的光合磷酸化位置将满足这一需要。5.4发酵与呼吸不需氧的氧化作用能量总是以ATP的形式回收,它的合成与食物的逐步氧化相偶联。这样的氧化,即使在完全缺氧的情况下也可以发生。在有些生物中,这种不需氧的氧化过程是能量回收的唯一形式。在大多数细胞中,不需氧和需氧的能量转化都可发生,而且在所有高等生物的细胞中,不需氧阶段先于需氧阶段。糖(或氨基酸、或脂肪酸)的不需氧氧化称为发酵。有几种形式的发酵,它们有不同的起始底物和最终产物。有些酵母细胞通过使葡萄糖发酵成乙醇,不需氧而生存。一些细菌可使葡萄糖发酵成为丙

4、酮或丁醇。另一些细菌使葡萄糖发酵成乳酸。使葡萄糖发酵成乳酸,称为酵解。这是一种葡萄糖的裂解,它在高等生物中先于近一步的氧化。酵解酵解发生在细胞的原生质中,它是一系列酶促反应,在这些反应中六碳葡萄糖被磷酸化、异构化、再度磷酸化,然后裂解成两个很容易相互转化的三碳片段。这些片段之一,3-磷酸甘油醛然后氧化并形成ATP,继续异构化并失去一分子水后,发生另一阶段的磷酸化,它与分子内氧化还原反应相偶联且形成ATP。葡萄糖(Glu)通过己糖激酶被磷酸化为6-磷酸葡萄糖,进行这一磷酸化要耗去一个ATP分子的一个磷酸根。通过葡糖磷酸变位酶,异构化成

5、6-磷酸果糖(F6P)。再耗去另一个ATP分子时,发生另一次磷酸化,催化这一过程的酶是磷酸果糖激酶。这一阶段的产物是二磷酸果糖(FDP),它通过醛缩酶分解成两个磷酸丙糖:3-磷酸甘油醛(TP)和磷酸二羟基丙酮(DHAP)。为了能够合成ATP,必须利用ATP,这一过程需要“加油”。产生的ATP多于消耗的ATP,否则就无任何意义了。事实上,在进行第一次磷酸化之后,3-磷酸甘油醛(TP)被NAD+氧化成1,3-二磷酸甘油酸(DPG)。磷酸化氧化3-磷酸甘油酸(3PGA)再使ADP磷酸化为ATP,催化这一步的酶是3-磷酸甘油醛脱氢酶。3-磷

6、酸甘油酸(3PGA)在磷酸甘油酸变位酶的作用下,然后异构化为2-磷酸甘油酸(2PGA),并在烯醇酶的作用下,失去一分子水时转化成磷酸烯醇丙酮酸(PEP)。最后,磷酸稀醇丙酮酸(PEP)在丙酮酸激酶的作用下,将另一ADP分子磷酸化成ATP,产生丙酮酸(Pyr)。丙酮酸在尼克酰胺腺嘌呤二核苷酸酶NADH的催化作用下还原成乳酸。在从3-磷酸甘油醛到丙酮酸的一个序列中,有两分子ATP被合成。但是,由于磷酸丙糖异构酶将另一个磷酸丙糖转化成3-磷酸甘油醛,所以对每一个葡萄糖-丙酮酸序列,有四分子ATP被合成,二分于ATP被消耗。结果,每个葡萄糖

7、分子净得两分子ATP。引起二磷酸果糖裂解的醛缩酶反应,在二磷酸果糖的方向有一近90%的平衡。在Calvin循环中,这一反应基本上发生在相反的方向上。这一反应在糖酵解中得以向前进行的原因在于,反应产物之一3-磷酸甘油醛被氧化去掉,它的能量保存在ATP的产生之中。在Calvin循外中,磷酸甘油酸的还原需要能量,它由原来被光还原的尼克酰胺腺嘌呤二核苷酸磷酸酶NADH的氧化供给。因此,3-磷酸甘油醛的被还原,在糖酵解序列的整个过程里是必须的。为我们提供了一个控制手段。当酵解之后,不跟随需氧的能量转换时,丙酮酸还原为乳酸.尼克酰胺腺嘌呤二核苷

8、酸磷酸酶NADH在这一反应中被氧化。在无氧代谢中,尼克酰胺腺嘌呤二核苷酸磷酸NAD+以一循环方式反应,这里没有纯氧化,但能量的保存与氧化过程完全一样.需氧的氧化在需氧细胞中,酵解之后是呼吸反应,这一反应在真核细胞中发生于线粒体内。线粒

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