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时间:2019-07-03
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1、流感病毒的快速检测方法一、RT-PCR快速诊断方法(一)生物安全要求(二)病毒核酸提取(三)RT-PCR(四)PCR产物纯化(五)流感病毒RT-PCR检测引物二、免疫荧光方法检测流感病毒(一)原理(二)标本处理(三)间接免疫荧光法(四)结果判断三、实时荧光定量PCR(Real-TimePCR)快速诊断检测(一)基本原理(二)实验试剂(三)实验步骤四、快速诊断试剂盒流感的快速检测方法,与传统的病毒分离鉴定相比具有快速、简便的特点。因此常用于流感暴发时早期病原学检测用。流感的快速诊断包括直接和间接免疫荧光法、ELISA、RT-PCR、Real-TimeP
2、CR快速诊断速方法、流感快速诊断试剂盒等。这里介绍RT-PCR、Real-TimePCR、免疫荧光快速诊断速诊断方法和几种流感快速诊断试剂盒优缺点。无论那种快速诊断都无法代替传统的病毒分离鉴定方法。一、RT-PCR快速诊断方法核酸检测是一种鉴定流感病毒基因组的有力方法,即使基因组含量很低或死病毒也可以检测到。本章将介绍检测流感病毒的聚合酶链式反应(PCR)。流感病毒的基因组是负链RNA,在进行PCR扩增前必须合成与病毒RNA互补的DNA,即为cDNA。逆转录酶(RT)就是用于合成cDNA的多聚酶,因此,扩增流感病毒基因组的过程称为RT-PCR。RT-
3、PCR需要一对型别特异引物,四种脱氧核苷酸(dNTPs),RNA模板,逆转录酶及TaqDNA多聚酶;首先由逆转录酶将病毒的RNA逆转录合成cDNA,然后再进行聚合酶链反应经25~30个循环,使DNA产物达到倍增的效果。(一)生物安全要求生物安全级别与个人防护要求:生物安全二级实验室,防护要求与二级实验室的要求相同。并应遵守相应的生物安全规定。进行高致病性禽H5RT-PCR快速检测时可以在生物安全二级实验室里进行,核酸提取在生物安全三级实验室的生物安全柜里完成。(一)病毒核酸提取1.实验材料及仪器(1)QIAGEN公司的RneasyMiniKit(Ca
4、talog#74104)(2)β-巯基乙醇(β-mercaptoethanol)(3)70%乙醇(4)无菌1.5ml离心管(5)10μl、20μl、200μl、1000μl加样器和枪头(6)可调14K微型离心机(7)旋转混合器2.操作步骤(1)取1支无菌、无RNA酶的1.5mlEppendorf管,加入500μlRLT。(2)取采样液(鼻拭子、咽拭子、胸水等)或病毒培养物(鸡胚尿囊液或细胞培养液)100μl,加入上述Eppendorf管中。(3)加5μlβ-巯基乙醇,充分混匀。(4)加600μl70%乙醇,于旋转混合器混匀。(5)从试剂盒中取出带滤膜
5、的离心柱,并标上标本号。(6)将第4步的混合液体分两次(每次600μl)吸入于滤柱中,12000rpm离心15秒,弃收集管中的离心液。(7)滤柱仍放回收集管上,将第4步的混合液全部吸入滤柱中,12000rpm离心15秒,弃收集管中液体。(8)于滤柱中加入700μlRW1,12000rpm离心15秒。(9)从试剂盒中取出一支新的2ml收集管,将离心后的滤柱转到新的收集管上,于柱子中加入500μlRPE,12000rpm离心15秒弃收集管中液体。(10)滤柱放回收集管上,于滤柱中加入500μlRPE,13000~14000rpm离心2分钟。(11)从试剂
6、盒中取出一支1.5mlEppendorf管,将滤柱转到新的1.5ml管上,于滤柱中加入30~50μl无RNA酶的水,室温静置1~3分钟。(12)12000rpm离心1分钟,弃滤柱。收集的离心液即为提取病毒的RNA,可以直接用于逆转录实验,或在-20℃以下保存,-30℃可保存3~4个月。3.注意事项(1)试剂盒中的RPE液用前需加44ml无水乙醇,使终体积达到55ml。(2)所有用过的枪头、收集管放入2%次氯酸钠消毒缸中过夜。(二)RT-PCR1.一步法RT-PCR(1)实验材料1)QIAGENOneStepRT-PCRKitCatNo2102122)
7、RNaseinhibitor40u/μl(Promega)3)上游引物200ng/μl4)下游引物200ng/μl1)模板RNA(TempletRNA)(2)实验步骤1)PCR反应配置(在清洁区缓冲间,加RNA模板应在核酸室)无RNA酶水(RnaseFreeWater)28.75μl5×Buffer10μl10mMdNTP2μlEnzymeMix2μlRnaseinhibitor0.25μl上游引物1μl下游引物1μlRNA模板5μl总量:50μl2)将PCR反应管放入PCR扩增仪3)RT-PCR反应条件:此循环的反应条件仅共参考,如果引物更换,相应
8、的反应条件需要做适当调整。®60℃1min®42℃10min®50℃30min®95℃15min®94℃30
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