绵羊角蛋白关联蛋白8_2基因克隆与表达分析_张立春

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1、中国畜牧兽医2015,42(12):3140-3145ChinaAnimalHusbandry&VeterinaryMedicinedoi:10.16431/j.cnki.1671-7236.2015.12.005绵羊角蛋白关联蛋白8.2基因克隆与表达分析张立春1,曹阳1,孙福亮2,尹峰3,朴庆林1,王晓阳1,金海国1*,张明新1*(1.吉林省农业科学院畜牧科学分院,公主岭136100;2.延边大学农学院,延吉133002;3.吉林农业大学动物科技学院,长春252059)摘要:本研究旨在克隆绵羊角蛋白关联蛋白8.2(keratin-associatedprotein,KAP8.2)基因mRN

2、A并分析该基因在不同组织器官的表达分布。首先提取小尾寒羊与新吉细毛羊皮肤及不同组织总RNA,RT-PCR方法克隆KAP8.2基因并进行两个品种间的比较分析,实时荧光定量PCR方法分析两个品种间KAP8.2基因的表达谱差异。结果表明已成功克隆出绵羊KAP8.2基因mRNA,该片段长574bp,其中ORF区192bp,编码63个氨基酸,甘氨酸(Gly)和酪氨酸(Tyr)含量依次为23.8%和20.6%,属于典型的HGT-KAP家族。多态性分析显示新吉细毛羊与小尾寒羊KAP8.2基因间存在丰富的多态性,多态位点多位于CDS区两侧,其中小尾寒羊KAP8.2基因3′UTR区c192+19-39出现一个

3、疑似fru-let-7j的作用靶位。不同组织表达谱分析显示该基因为多组织表达基因,但两个品种羊不同组织表达谱存在较大差异,表现为小尾寒羊在脾脏、肝脏和皮肤中高表达,而新吉细毛羊则在皮肤和心脏中高表达。本研究提示小尾寒羊与新吉细毛羊KAP8.2基因在基因多态性还是组织表达分布上存在显著差异,提示该基因与毛表型性状相关。关键词:KAP8.2基因;新吉细毛羊;小尾寒羊;基因克隆中图分类号:Q786文献标志码:A文章编号:1671-7236(2015)12-3140-06CloningandExpressionPatternAnalysisofKAP8.2GeneinSheep1,CAOYang1,

4、SUNFu-liang2,YINFeng3,PIAOQing-lin1,ZHANGLi-chun1,JINHai-guo1*,ZHANGMing-xin1*WANGXiao-yang(1.BranchofAnimalHusbandry,JilinAcademyofAgriculturalScience,Gongzhuling136100,China;2.AgriculturalCollegeofYanbianUniversity,Yanji133002,China;3.CollegeofAnimalScience&Technology,JinlinAgriculturalUniversity

5、,Changchun252059,China)Abstract:TheobjectofthisstudywastoclonetheKeratin-associatedprotein8.2(KAP8.2)genefromSmall-tailHansheepandXinjiFine-woolsheepandtestthetissuesexpressionpattern.Inthisstudy,thetotalRNAwereextractedfromdifferenttissuesfirstly,andKAP8.2genewasclonedbyRT-PCR.Intheend,thedifferen

6、texpressionpatternsofKAP8.2geneinSmall-tailHansheepandXinjiFine-woolsheepwasdetectedbyQRT-PCR.ThecloningresultsshowedthattheKAP8.2genewerecloned,andthelengthofKAP8.2mRNAwas574bp,containinga192bpORFwhichencodedaproteinof63aminoacids.TheseKAP8.2genebelongedthetypicalHGT-KAPfamilybecausetherateofglyci

7、neandtyrosinewere23.8%and20.6%,respectively.ThepolymorphismanalysisshowedthatthereweresomepolymorphismsinKAP8.2geneandalmostSNPslocatedonbothsidesofCDSregion.Theregionwhichlocatedonthe3′UTRc192+19-39ofKAP8.

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