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时间:2019-06-26
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1、基因重组与基因工程Generecombinationandgeneticengineering孙庆涛刘华明2011.3.16重组DNA技术又称为基因工程(geneticengineering)或分子克隆(molecularcloning)。基因工程的操作过程主要由以下步骤组成:①载体和目的基因的分离②载体和目的基因的切断③载体和目的基因的重组④重组DNA的转化和扩增⑤重组DNA的筛选和鉴定一、载体和目的基因的分离为了进行基因重组,首先需要对载体DNA和目的基因分别进行分离纯化,得到其纯品。(一)载体:基因工程中常用的载体(vector)主要包括质粒(plasmid)噬菌体(phag
2、e)病毒(virus)这些载体均需经人工构建,除去致病基因,并赋予一些新的功能,如有利于进行筛选的标志基因、单一的限制酶切点等。1.质粒:存在于天然细菌体内的一种独立于细菌染色体之外的双链环状DNA,具有独立复制的能力,通常带有细菌的抗药基因。最早使用的质粒DNA是人工构建的pBR322,该质粒分子大小为4.3kb,带有抗四环素和抗氨苄青霉素基因,含EcoRⅠ,BamHⅠ,HindⅢ等单一的限制酶切点。2.噬菌体:可通过转染方式将其DNA送入细菌体内进行增殖。常用的为人工构建的λ噬菌体载体。噬菌体两端的片段对于其包装是必需的,因而应予保留;而其中间部分则可进行改造或置换,使之具有某
3、种单一的限制酶切点。目的基因与噬菌体DNA进行重组时,可采用插入重组方式,也可采用置换重组方式。3.病毒:常用的为SV40,通过感染方式将其DNA送入哺乳动物细胞中进行增殖。(二)目的基因:目的基因的筛选和分离可采用以下方法进行:1.直接从染色体DNA中分离:仅适用于原核生物基因的分离,较少采用。2.人工合成:根据已知多肽链的氨基酸顺序,利用遗传密码表推定其核苷酸顺序再进行人工合成。适应于编码小分子多肽的基因。3.从mRNA合成cDNA:采用一定的方法钓取特定基因的mRNA,再通过逆转录酶催化合成其互补DNA(cDNA),除去RNA链后,再用DNA聚合酶合成其互补DNA链,从而得到
4、双链DNA。这一方法通常可得到可表达的完整基因。4.从基因文库中筛选:将某一种基因DNA用适当的限制酶切断后,与载体DNA重组,再全部转化宿主细胞,得到含全部基因组DNA的种群,称为G-文库(genomicDNAlibrary)。将某种细胞的全部mRNA通过逆转合成cDNA,然后转化宿主细胞,得到含全部表达基因的种群,称为C-文库(cDNAlibrary)。C-文库具有组织细胞特异性。5.利用PCR合成:如已知目的基因两端的序列,则可采用聚合酶链反应(polymerasechainreaction,PCR)技术,在体外合成目的基因。但此法可能会造成克隆的目的基因碱基序列的改变。PC
5、R概述PCR:使用一对寡核苷酸引物,以目的序列为模板,利用DNA合成酶和四种脱氧核糖核酸进行DNA的体外合成反应。PCR技术具有灵敏度高,特异性高、操作方便和重复性好等特点,能够在几个小时内获得多达几百万拷贝的目的基因。该技术在上个世纪80年代中期由美国K.Mullis发明建立,经过近二十年已发展成包括多种衍生技术,在很多领域中广泛使用,K.Mullis也因此获得1993年度的诺贝尔化学奖。PCR基本原理DNA在细胞中的复制是一个复杂的酶促脱氧核糖核酸聚合过程,是DNA聚合酶、DNA连接酶、引发酶、DNA引物、四种脱氧核糖核酸、DNA超螺旋酶、离子环境等多成份参与的过程。PCR是在
6、试管内使用最基本的成份模拟了细胞内的DNA复制,所以在一个PCR中必需成分是1.模板DNA2.DNA聚合酶3.四种脱氧核糖核酸4.正向和反向两条引物5.适当的缓冲体系。变性:是指模板的热变性,双螺旋模版DNA成为单链的DNA分子;在应用TaqDNA聚合酶进行PCR反应时,变性往往在94℃~95℃条件下进行。这也是TaqDNA聚合酶进行30个左右的PCR循环而活力不致受到过多损失时所能耐受的最适温度。退火:是指引物和模板在局部形成互补的杂交链的过程。退火温度比两条寡核苷酸引物的熔解温度低5~10℃,PCR实验要对退火温度进行优化。PCR基本步骤延伸:在镁离子存在条件下,DNA聚合酶按
7、碱基互补原则,催化四种脱氧核糖核酸加在引物的3′端,使引物沿5′→3′方向生成与模版DNA互补的新DNA链。双链模版DNA变性退火5′3′5′3′5′5′3′3′5′5′3′3′5′5′3′3′上游引物下游引物延伸3′5′5′3′3′5′5′3′多次循环(2n拷贝)1、目的基因的克隆2、基因的体外突变3、DNA和RNA的微量分析4、DNA序列测定5、基因突变分析PCR的主要用途二、载体和目的基因的切断通常采用限制性核酸内切酶(restrictionendonuclea
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