《遗传评估过程》PPT课件

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1、遗传评估过程1什么是遗传评估?评估个体单个或多个性状的遗传价值预测后裔在特定环境下的价值估计育种值2遗传评估过程育种值作为亲本个体的价值决定性状所有基因的加性效应总和3P=G+EP=表型值G=基因型值E=环境离差G=A+D+IP=A+D+I+E遗传评估过程表型值4A=b(P-m)A=育种值b=加权系数P=表型值m=同龄组均数遗传评估过程估计育种值5个体仅有单个纪录b=h2A=h2(P-m)A=育种值h2=遗传力P=表型值m=同龄组均值遗传评估过程举例6个体仅有单个纪录背膘厚10mm公猪A=h2(P-m)A=.

2、52(10-14)=-2.08mm背膘厚16mm母猪A=h2(P-m)A=.52(16-14)=1.04mm遗传评估过程举例7个体仅有单个纪录重复率=w=h2=.52or52%后裔EBV=(EBV公猪+EBV母猪)/2=(-2.08+1.04)/2=-.52mm遗传评估过程举例8A=b(P-m)b=nh2/[1+(n-1)r]A=育种值n=纪录数h2=遗传力r=性状重复率P=表型值m=同龄组均值遗传评估过程个体有多个纪录9一母猪三纪录平均产仔数12头b=nh2/[1+(n-1)r]=3x.11/[1+(

3、3-1).3]=.206A=b(P-m)A=.206(12-10)=.41遗传评估过程个体有多个纪录10A=b(P-m)b=2ph2/[4+(p-1)h2]A=育种值p=后裔数h2=遗传力P=表型值m=同龄组均值遗传评估过程后裔纪录11一公猪有五后裔平均日龄140天b=2ph2/[4+(p-1)h2]=2x5x.3/[4+(5-1).3]=.577A=b(P-m)=.577(140-170)=-17.1遗传评估过程后裔纪录12遗传评估过程多个亲属资料A=b1X1+b2X2+b3X3…..bnXnb取决于纪录数

4、后裔数遗传力重复率相关13遗传评估过程什么是BLUPBLUP是最佳线性无偏预测它是用于预测个体育种值的方法14遗传评估过程什么是BLUP最佳估计误差最小估计与真实育种值相关最大线性估计是基于线性模型假设个体性能是遗传和非遗传效应的总和15遗传评估过程什么是BLUP无偏估计过程中估计值是无偏的估计与真实育种值间平均差为零.即所有可能估计值的平均值等于真实育种值.预测一个体将来作为亲本的预测育种值16遗传评估过程主要优点可同时估计同龄组和其它效应,因而能进行场间比较可考虑所有个体间相关,能利用所有资料估计育种值估计

5、育种值的最佳方法17遗传评估过程条件需要个体,亲属,环境效应和遗传参数所有资料评估过程相当复杂需解大量的数学等式需内存大计算时间高效的计算方法硬件容量18遗传评估过程过程确定数学模型(个体动物模型)构建亲缘矩阵构建混合模型等式用迭代法解方程计算准确性(重复率)19yijkm=HYi+Lj+ajk+pjk+eijkmyijkm总产仔数HYj产仔的场年效应Lj母猪的窝效应ajk个体加性效应pjk母猪永久环境效应eijkm剩余效应遗传评估过程模型20遗传评估过程混合模型等式21育种值估计模型动物模型（animalmo

6、del）数学方程式：是观察值向量是所有固定效应向量是的关联矩阵是个体育种值向量是的关联矩阵是随机残差向量期望和方差：22混合模型方程组：23BLUP育种值估计举例单性状动物模型BLUP育种值估计某种猪场有如下种猪性能测定资料，测定性状为达100kg日龄，已知该性状的遗传力为0.33，试对该性状资料进行个体育种值估计。种猪达100kg日龄记录猪场个体父亲母亲达100kg日龄11——14012——152131—1352412143253216024计算个体育种值根据资料性质，可对种猪达100kg日龄写出如下动物模型

7、：是第猪场，第个体的观测值是第猪场的效应第个体的育种值是随机残差用矩阵形式表示，则对于该资料有：25由此可得：混合模型方程组为：26方程组的解为：27BLUP育种值估计软件PESTPEST是由美国Illinois大学的Groeneveld、Kovac和Wang（1990）开发研制的多性状遗传评估软件，其英文全文名为（MultivariatePredictionandESTimation，目前已在世界各国广泛应用。根据性能测定和生产数据，PEST提供了基于30多种数学模型的单性状或多性状BLUP育种值的计算，包括

8、固定模型、个体动物模型、公畜模型、公畜—母畜模型和外祖父模型等。为了满足实际育种的需要，系统还提供了可自行定义性状、修改模型和设定参数的余地。PEST可以在不同的操作系统下运行。28NETPIGNETPIG（种猪场网络管理系统）是四川农业大学动物科技学院和重庆市养猪科学研究院（系统指导：李学伟、王金勇；程序设计：徐顺来）联合研制开发WINGDOWS界面的种猪场网络管理系统该软件有两个版