《蛋白质结构基础》PPT课件

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1、第二章蛋白质高级结构本章主要内容第一节蛋白质结构基础第二节蛋白质结构解析第三节蛋白质结构预测ProteinsProteinissynthesizedviathefollowingprocesses:Eachproteinismadefromthe20standardaminoacidsandfoldintoaspecific3-Dstructure.DNARNAProteinGeneFunction氨基酸与多肽链蛋白质的空间结构多肽链的折叠蛋白质结构与功能的关系重点：蛋白质的层次体系，二级结构、模体与结构域多肽链的折叠本节主要内容：一、氨基酸与多肽链（

2、一）氨基酸Allorganismsusethesame20aminoacidsasbuildingblocksfortheassemblyofproteinmolecules.20CommonAminoAcids?第21和22种天然氨基酸:硒半胱氨酸和吡咯赖氨酸1986年英国的Chamber和德国的Zinoni等发现了硒半胱氨酸(Selenocysteine)2002年美国的Srinivasan和Hao等报道发现了第22种天然氨基酸吡咯赖氨酸(Pyrrolysine)它们是由基因密码子直接编码的非标准氨基酸其三联体密码子分别为UGA和UAGThe20a

3、-aminoacidssharecommonstructuralfeatures.Eachhasacarboxylgroupandanaminogroup(butnotinproline)bondedtothesamecarbonatom,designatedasthea-carbon.Eachhasadifferentsidechain(orRgroup,R=“Remainderofthemolecule”).1.Generalstructure2.分类1）疏水氨基酸(hydrophobicornonpolaraminoacids):8Ala,Val

4、,Leu,Ile,Met,Pro,Phe,Trp趋于彼此间或与其它非极性原子发生疏水相互作用。侧链一般没有化学反应。主要位于蛋白质分子内部。2）极性氨基酸(polaraminoacids):极性不带电荷：7Ser,Thr,Asn,Gln,Cys,Tyr,Gly.侧链都含有极性基团，有不同程度的化学反应.荷电氨基酸(chargedaminoacids):5带负电荷Asp,Glu(acidic);带正电荷Arg,Lys,His(basic)侧链在生理条件下都可以解离，使其带上正电或负电。3.单一构型和旋转异构体1）构型与构象（configurationan

5、dconformation）描述分子两种不同的空间异构现象。2)OnlytheL-aminoacidshavebeenfoundinproteins(D-isomershavebeenfoundonlyinsmallpeptidesofbacteriacellwallsandinsomepeptideantibiotics).3）优势构象与旋转异构体交错构象（staggedconformation)是能量上最有利的排布方式。（二）肽单位和多肽链Peptideunitandpeptidechain1.肽键与多肽thecarboxygroupofthefi

6、rstaminogroupcondenseswiththeaminogroupofthenexttoeliminatewaterandyieldapeptidebonds.Thepeptide(amide)bondwasabout1.33Å(C-Nsinglebond,1.49;C=Ndoublebond,1.27),thushavingpartialdoublebondfeature(shouldberigidandunabletorotatefreely).Proteinsarebuiltupbyaminoacidsthatarelinkedbyp

7、eptidebondsintoapolypeptidechain.三肽，四肽：<12寡肽oligopeptide12~20多肽polypeptide>20蛋白质：几十个peptides以上活性肽：谷胱甘肽GSH:三肽催产素，加压素：九肽胰岛素：51肽ThepolypeptidechainaredividedintopeptideunitsthatgofromoneCtothenextC.Thepolypeptidechainofthemainchainatomsarerepresentedasrigidpeptideunits,linkedthro

8、ughtheCatoms.2.肽单位与多肽主链二、蛋白质的空间结构（一）蛋白质结构的层次体系