《测序技术FAQ》PPT课件

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1、GSJuniorFAQBasicsofSystemandExperiementswww.454.comGSJunior仪器GSJunior试剂GSJunior数据处理器GSJuniorSystem二代测序平台触手可得7ft8ft二代测序选哪家？上手容易价格适中经久验证的实验实际又实用的选择系统及计算机硬件试剂测序原理实验及应用软件及生物信息竞争其他系统及计算机硬件试剂测序原理实验及应用完整的GSJunior系统主要包括些什么硬件及耗材？包括一台GSJunior测序仪(货号：5922160001GSJ

2、uniorComplete),配套电脑及显示器(HPZ400服务器，货号：5943329001及5943337001）GSJunior配套软件v2.5(货号:5996627001)以及装机时配套附件(GSJuniorInstallationKit，货号：5943345001）。其中：包括：BDD装置(要于PTP板上样），悬滴PCR测序珠计数器（用于悬滴PCR后打破油包水体系后测序珠富集时的计数）,BDD离心平衡板及BDD离心器适配装置(上样过程中需要进行离心）,数据信号线（链接测序仪与电脑），废液瓶(

3、收集测序废液）等.另外如果需要，可以订购IKATurrax用于形成悬滴PCR的油包水体系，主要原理是震荡分散。什么是IKATurrax?是为品牌IKA,型号为Turrax的试管分散机，将试管放置在主机上，通过转子转动，分散均质或混合的样本。在我们的实验中用于准备emPCR的油包水体系。此外，也可以利用GSFLXTitaniumMVemPCRKit(Lib-L)及GSFLXTitaniumMVemPCRKit(Lib-A)的试剂盒，同步准备8个GSJunior的emPCR体系，方便规模化操作。GSJun

4、ior和GSFLX+的异同有哪些？相同点：测序原理都是焦磷酸测序，测序试剂的化学性质相同，测序质量相当测序制备的基因组文库可以在两个平台上通用两者的应用领域相同，可以同样进行shotgun文库，pair-end文库以及amplicon文库测序。不同点:测序运行周期短(GSJunior为10小时，GSFLX+为22小时）GSJunior单次运行费用低测序结果读长数量为GSFLX的1/10，GSJunior的典型读长为400bp，GSFLX+典型读长为700bp,GSJunior的测序重量在40Mb-70

5、Mb，GSFLX+在700到1Gb利用IKA设备，可以方便的建立emPCR体系GSJunior的通量是多大？一般以E.coli基因组为例，Shotgun文库测序，一次测序可获得35MB数据一般以350bp长扩增子文库为例，Amplicon扩增子测序，一次约可获得25Mb序列通常，一次测序，shotgun实验可以获得10万条序列，amplicon实验可以获得7万条序列。样本的CG比例会影响到最终获得的数据量，或高或低。取决于样本质量和实验过程，通量可以达到60Mb以上GSJunior单个序列的读长是多少

6、？平均读长约400碱基，典型读长约500碱基，最长可超过600碱基典型读长通常为读长正态分布图的最顶峰。Junior系统在装机时需要订购什么试剂？用于一次安装过程中需要清洗系统的试剂盒、TestFragmentRun的试剂盒、培训用的试剂盒。详见GSJunior的装机单及相关培训必配清单。V:_OrgASAS_APPLICATIONGS5_QuotationQuotationTools2011GSJunior系统配套计算机是什么？它的作用是什么？推荐的计算机是HPZ400,我们的货号还

7、包括3年的保修计算机用于控制GSJunior系统进行测序实验、日常维护、原始图像数据转换成序列并筛选质控、也可用于序列分析(序列分析也可以在独立的计算机上进行）Z400的内存以及CPU可以处理目标片段或基因组小于50Mb的序列比对、目标片段或基因组小于12Mb的序列拼接系统及计算机硬件试剂测序原理实验及应用GSJunior有哪些试剂盒：emPCR的试剂盒：GSJuniorTitaniumemPCRKit(LibL)GSJuniorTitaniumemPCRKit(LibA)测序用的试剂盒：GSJuni

8、orTitaniumSequencingKit-测序试剂GSJuniorTitaniumPicoTiterPlateKit-PTP板GSJuniorControlBeadKit-阳性对照测序珠用于TestFragmentRun吸管更换的试剂盒:GSJuniorSipperMaintenanceKit-每次测序反应和维护清洗都需要定一套维护清洗：GSJuniorMaintenanceWashKit-彻底清洁流路系统，当发现流路有受到污染的可能或者有一段时间