实验一 核酸序列的检索

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1、实验一核酸序列的检索GenBank格式LOCUS(代码)：是该序列条目的标记，或者说标识符，蕴涵这个序列的功能。该字段还包括其它相关内容，如序列长度、类型、种属来源以及录入日期等。说明字段是有关这一序列的简单描述。ACCESSION(编号)：具有唯一性和永久性，在文献中引用这个序列时，应该以此编号为准。KEYWORDS(关键词)：由该序列的提交者提供，包括该序列的基因产物以及其它相关信息。SOURCE(数据来源)：说明该序列是从什么生物体、什么组织得到的，次关键字ORGANISM(种属)指出该生物

2、体的分类学地位。REFERENCE(文献)：说明该序列中的相关文献，包括AUTHORS(作者)、TITLE(题目)及JOURNAL(杂志名)等，以次关键词列出。该字段中一般还列出医学文献摘要数据库MEDLINE的代码。该代码实际上是个超文本链接，点击它可以直接调用上述文献摘要。一个序列可以有多篇文献，以不同序号表示，并给出该序列中的哪一部分与文献有关。FEATURES(特性表)：具有特定的格式，用来详细描述序列特性，包括蛋白质编码区以及翻译所得的氨基酸序列，外显子和内含子位置、转录单位、突变单位、

3、修饰单位、重复序列等信息，以及与蛋白质数据库SwissProt和分类学数据库Taxonomy等其它数据库的交叉索引编号。特性表中带有‘-xref/’标志的字符可以连接到其它数据库。BASECOUNT(碱基含量)：给出序列中的碱组成，A、T、G、C每类的个数。ORIGIN：是序列的引导行，引导碱基序列，以双斜杠行“//”结束。)FASTA格式>gi

4、19527219

5、ref

6、NM_133999.1

7、MusmusculusFIG4homolog(S.cerevisiae)(Fig4),mRNAGGGA

8、ATCCGGAAGCAGCCGGCGAGCCCGCTGCTGAACGTTTGGTGTTCTGACACTGTTTTTGTCAGCTGTGTCTGGTGTGCTGGAGGTCTGCGGGGTCTCCTCGCTCTGTCTCCAGGGGGAACCCCGCCGCTGTCACGACCTGGGCCGCGGCCTGGTGCCCTGTGGCGGGGCCGCCATTGGCTGGAGCCATGCCCACGGCCGCTGCCCCCATCATCAGCTCGGTCCAGAAGCTGGTGCTGTATGAGACCAGAGCT

9、AGATACTTTCTAGTTGGGAGCAATCATGCAGAAACGAAGTACCGTGTCCTGAAAATTGATAGAACAGAACCGAAGGACTTGGTGGTAATCGACGACAGGCACGTGTACACACAACAAGAAGTGAGGGAACTTCTTGGCCGCCTGGATCTGGGAAACAGAACAAAGATGAGCCAGAAAGGATCCTCCGGGTTGTTTCGAGCCGTCTCAGCTTTTGGAGTCGTAGGTTTTGTCAGGTTCTTAGAAGGCTACTA

10、TATTGTATTAATAACTAAGCGGAGGAAGATGGCAGACATTGGAGGTCATGCAATTTATAAGATTGAAGATACAAGTATGATTTATATCCCCAATGACTCTGTTCGGATTTCTCACCCCGACGAAGCTAGGTATCTAAGGATATTTCAAAATGTGGATCTATCTAGCAATTTTTACTTTAGTTACAGCTATGATTTGTCACACTCACTTCAGTATAATCTTACCGTCCTGCGAATGCCCCTGGAGATGTTAA

11、AGTCAGAAACATCCAAGGCGTGCCAGGAGAGCTTCGACATCTTTGAAGATGAAGGATTAATTACACAGGGTGGCAGTGGTGTATTTGGGATCTCTAGTGAGCCTTATATGAAGTATGTATGGAACGGTGAACTTCTGGATATAATTAAAAACACTGTGCATCGTGACTGGCTATTGTATATCATTCATGGGTTCTGCGGGCAGTCCAAGCTTTTGATCTATGGACGACCAGTGTATGTGACCCTAATAGCC

12、AGGAGATCCAGTAGGTTTGCTGGGACGCGCTTTCTCAAGAGAGGCGCAAACTGTGAGGGTGACGTTGCAAATGAGGTGGAGACCGAGCAGATCCTCTGTGATGCTTCTGTGATGTCTTTTACCGCAGGCAGTTACTCTTCTTACGTACAAGTTAGAGGATCCGTTCCCTTATTCTGGTCCCAAGACATCTCAACTATGATGCCGAAACCACCCATTACACTGGACCAGGCGGATCCCTTTGCA