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时间:2019-06-13
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1、用Gaussian计算CO的偶极矩方向如果用Gaussian简单做一下CO的计算,会发现g03得到的电荷分布是氧上带负电荷。但是实际情况是氧上面应该是正电荷,C原子上带负电荷. 输入文件如下: ----------------------------------------------------- %chk=CO6311G.chk %mem=6MW %nproc=1 #hf/6-311++g(3df,3pd)geom=connectivitypop=full COopt6-311G++(3df,3pd) 01 C O1B1 B11.10
2、255600 123.0 2 ------------------------------------------------------ 这是个经典的问题,一般的量化计算都会给出不正确的结果。也就是氧原子上带负电。O的电负性是3.44,C的是2.55,按常理,O要电子的能力强,所以带负电。但其实这是不正确的。 碳原子上带负电荷是从CO分子成键的特点分析得到的,一般认为CO中的一个π是由O原子提供电子对形成的配位键,基于这一点,尽管O的电负性比C大,但C原子因为接受了O的电子对而显负电。这个概念主要用来说明在羰基配合物中为什么配位原子是C而不是O。
3、 根据文献启发,发现使用DFT,如下基组,可以算出Mulliken分析中,C带负电荷,但是用NBO或者AIM,都还是C带正电荷。 C0 6-311+G(d) **** O0 6-311+G **** O0 D11.000.000000000000 0.0100000D+000.1000000000D+01 ****Gaussian中偶极矩的单位的换算用Gaussian进行极化分子的计算时,最后会输出沿着X,Y,Z方向的偶极矩,但是其单位用的是Debye。 典型输出如下: ---------------------------------
4、------------ Charge=0.0000electrons Dipolemoment(Debye): X=0.1018Y=-0.0475Z=-38.8636Tot=38.8638 --------------------------------------------- 关于Debye的单位定义如下: Non-SIunitofelectricdipolemoment.Itisequaltotheelectricdipolemomentfortwochargesof10–10franklinseparatedby1Angstrom,D=1
5、0–18Frcm≈3.33564×10–30Cm 或者说: 1a.u.=0.97174E22V/m2=2.542Debye 其中1a.u.偶极矩定义为 1au=twopointelectronunitchargesseperatedby1bohr(0.529angstrom)=2.54Debye 在Gaussian的计算输出结果中,会有如下的信息 -------------------------------------------------------- Orbitaloccupationis: 40A1(1)alphaand39A1(
6、1)beta 6A2(1,)alphaand6A2(1)beta,and 0.00alphaelecin1orbitalsplus0.00betaelecin1orbitals 36E1(2,)alphaand36E1(2)beta,and 0.00alphaelecin0orbitalsplus0.50betaelecin1orbitals 29E2(2)alphaand29E2(2)beta Totalnumberelectrons:352.0 -------------------------------------------------
7、------- 这里的A1.1,A2.1,E1.2等表达的是分子轨道的对称性信息。 是群论中经常用到的对称性的表示方法。 主轴对称,A,反对称,B 下标1,垂直于主轴的C2对称,反对称,则用2 括号中1,(可能是上标‘),表示垂直于主轴的晶面对称,2,反对称 E是二维的,A,B是一维的对称不可约表示如何可视化Gaussian的分子轨道 是利用gaussian的cugegen的程序。利用计算产生的CHK文件,然后 用formchk将chk转化为.fch的文件。利用chem3d打开,或者gaussview打开, 在chem3d里面有一个toolb
8、ar的view栏,选择molecula
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