生化技术考核ppt

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1、中国海洋大学实验报告姓名:周梦阳专业年级:07生物技术学号:040012007184实验时间:周二90节教师:孔凡娜课程:分子生物学实验题目:基因组DNA的提取与电泳鉴定一.【实验目的】掌握基因组DNA的提取原理和方法二.【实验原理】1、用机械的方法使组织和细胞破碎;加入SDS等离子型活性剂,溶解细胞膜和核膜蛋白;加入酚氯仿等表面活性剂使蛋白变性。离心,除去组织和变性蛋白,上清液中加入冰冻的无水乙醇使DNA沉淀,离心,弃上清,70%乙醇漂洗DNA;倒掉上清,风干,溶于灭菌的双蒸水中。2、分子置于

2、电场中以一定速度(迁移率)移向适当电极。迁移率同电场强度、电泳分子所携带的静电荷数成正比,还与介质的摩擦系数相关。一定电场强度下DNA分子的迁移率取决于核酸分子本身的大小和构型。3、琼脂糖是D-和L-半乳糖残基残基通过α(1→3)和β(1→4)糖苷键交替构成的线状聚合物。琼脂糖凝胶可以形成直径50nm-200nm的三维筛孔通道。琼脂糖溶液的密度取决于琼脂糖的浓度,我们所用的是经过化学修饰的低熔点(LMP)琼脂糖,结构上比较脆弱,较低温度下即可熔化。浓度越高,孔隙越小,分辨能力越强。琼脂糖凝胶分辨

3、DNA片段的范围为0.2-50Kb;聚丙烯酰胺凝胶分辨力为1bp-1000bp。4、凝胶电泳中,加入溴化乙锭(简称EtBr)染料对核酸分子染色之后,将电泳标本放置在紫外光下观察,便可以十分敏感儿方便地检测出凝胶介质中DNA的谱带位置。三.【实验材料与用品】材料:龙须菜用具:天平、离心管、高速离心机、水浴锅、琼脂糖凝胶电泳系统、琼脂糖凝胶电泳系统等。药品:液氮、缓冲液、SDS、蛋白酶K、tris—饱和酚、氯仿、冰冻的无水乙醇、70%乙醇、RNA酶、EB、TBE、琼脂糖四.【实验步骤】(一)基因组D

4、NA的提取(1)将龙须菜从培养瓶中取出,吸干表面水分后用电子天枰秤取0.2g,液氮充分研磨后分装到1.5ml的离心管中。(2)在装有藻体粉末的离心管中加入900μl提取缓冲液、90μl20%的SDS、10μl10mg/ml的蛋白酶K。充分混匀后于37℃水浴锅中裂解30min,每5min混匀一次。(3)12000转离心10min,取上清。(4)加入等体积Tris饱和酚抽提,充分混匀后12000转离心10min,取上清。(5)加入等体积氯仿抽提,充分混匀后12000转离心10min,取上清。(6)加

5、入等体积氯仿抽提,充分混匀后12000转离心10min,取上清。(7)加入两倍体积的无水乙醇,充分混匀后于-20℃半小时。(8)将上述溶液从冰箱中取出,12000转离心10min,出现的沉淀即为基因组DNA。(9)倒掉上清,加入800μl70%的无水乙醇,洗沉淀,12000转离心10min。洗两次。(10)倒掉上清后,将沉淀晾干后加入50μ去离子水溶解。(11)加入Rnase消化30min。(12)-20℃保存备用(二)基因组DNA的电泳检测(1)配制1%的Agarose胶(1gAgarose粉

6、末,融于100ml1×TAE中)(2)分别在样品槽中加入标准DNAmarker和样品DNA3μl(buffer与样品DNA的混合物),电泳。(3)将琼脂糖胶放在EB溶液中染色5-10分钟。(4)使用凝胶成像系统拍照并检验。五.【实验结果】我们是第2组,由下图可见无明显条带,这说明样品中混有蛋白质杂质,抽提不完全。六.【思考题】1、简述DNA提取过程中各种试剂的作用。SDS:破坏细胞膜结构,使蛋白质变性,解聚核糖体,使DNA得以释放。蛋白酶K:降解蛋白质乙醇:沉淀DNATris:缓冲液EDTA:螯

7、合剂,螯合酶活性中心的金属离子,从而抑制DNase的活性酚氯仿:使蛋白质变性,同时抑制了DNase的降解作用。用苯酚抽提过程中,蛋白质与DNA分离,蛋白质与苯酚相似相溶,DNA溶于水相,离心分离后保持水相,加入酒精沉淀DNA。重蒸水:吸取DNA上面所粘附的离子RNA酶:降解混杂在DNA中的RNA2、简述DNA提取过程中需要注意哪些问题。1)材料量不能太多,氯仿的加入量不能太少,且要充分摇匀,否则蛋白质变性不完全。2)苯酚具有高度腐蚀性,飞溅到皮肤、粘膜和眼睛会造成损伤,因此应注意防护。氯仿易燃、

8、易爆、易挥发,具有神经毒作用,操作时应注意防护。3)操作要快,酚暴露在空气和光线下易被氧化,呈红色。4)收集细胞的多少是实验成功与否的关键;5)沉淀中加1mlSTE后,打散细胞团便于充分消化细胞;6)饱和酚吸取时记得吸取下层的有机相;7)乙醇沉淀时,要沿离心管壁向DNA溶液中加入无水乙醇,轻轻摇动离心管混和至体系完全均一,见白色絮状DNA。3、查阅资料简单介绍通过紫外分光光度计给核酸定量的原理。分光光度计计采用一个可以产生多个波长的光源,通过系列分光装置,从而产生特定波长的光源,光源透过测试的样

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