install gaussian in linuxGaussian 03 Opteron系统安装指南

《install gaussian in linuxGaussian 03 Opteron系统安装指南》由会员上传分享，免费在线阅读，更多相关内容在教育资源-天天文库。

1、Gaussian 03 Opteron系统安装指南一、系统需求Gaussian03C.02源文件版PGIFortran编译器pgf775.1(注：使用pgf90或者PGI6.0都可能存在兼容问题无法编译)双核四路Opteron处理器Linux系统。注：Gaussian官方说明仅支持SuSELinux9.0，但本安装说明在HPXCLinux3.0和TurboLinux上测试通过(部分系统可能需要进行细微修改，请参见“修改源码”部分)。二、安装前的设置1)切换至CShell，并设置g03root环境变量   $/bin/csh   %setenvg03root"/usr/pk

2、g"     #设置G03安装路径，这里将安装至/usr/pkg/g03/目录。   %cd$g03root2)解压，并设置访问权限   %tarxvfzwkssrc.tar.gz   %chgrp-Rg03g03              #设置G03访问权限，这里只有g03组的用户才可以使用G03。   %cdg03   %./bsd/install三、修改源码Gaussian03C.02对某些Opteron系统可能出现不兼容的现象，若安装失败，可以尝试下列方法：1)修改bsd目录下cachesize文件运行$g03root/g03/bsd/cachesize如果输出

3、的不是一个整数，编译过程将出现错误而无法完成此时可以打开该文件，将grepcache/proc/cpuinfo

4、uniq

5、tr-d"[:alpha:][:punct:]"改为grep"cachesize"/proc/cpuinfo

6、uniq

7、tr-d"[:alpha:][:punct:]"或者grepcache/proc/cpuinfo

8、uniq

9、tr-d"[:alpha:][:punct:]"

10、head-12)到zixiaBBS量化版或者量子化学网论坛(http://www.quantumchemistry.net/bbs/)量化类软件版发文求助四、开始安装   %so

11、urce$g03root/g03/bsd/g03.login   %bsd/bldg03>&make.log五、检查安装是否成功完成编译完成后，检查make.log文件结尾是否有编译错误终止的提示。运行   %ls$g03root/g03/*.exe应该有80个文件。六、修改登入批处理文件.login   #.logincommands                   setenvg03root"/usr/pkg"       #这里设置G03安装目录为/usr/pkg/g03              setenvGAUSS_SCRDIR"/scratch/" #这

12、里设置G03临时文件目录(rwf文件等)为/scratch/        source$g03root/g03/bsd/g03.login注：Gaussian03D.01支持PGI6.0以及SuSELinux9.0,9.1,9.2,9.3;SuSELinuxEnter.Server9SP3;RedHatEnterpriseLinux4Update2等多种Linux系统。G03其他版本升级至D.01需要100美元工本费（gaussian.com报价）。注2：感谢zixiaBBSqchem和defoe关于G03安装问题的讨论。Gaussian03 Linux下的设置获得已编

13、译好的g03软件包:g03.tgz.假设解压至/home/g03,即tarxzfg03.tgz。然后在.bashrc(假设系统的shell默认是bashshell)加入如下环境变量exportGAUSS_EXEDIR=/home/g03/g03exportg03root=/home/g03exportLD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:/home/g03/g03exportPATH=/home/g03/g03/:$PATHexportGAUSS_SCRDIR=/tmp  最后source.bashrc或..bashrc即可。g98在单机 li

14、nux下编译及修改 link 详细完成版首先感谢在bbs上发文章的朋友(主要是zixia量化计算和厦大理论化学中心论坛)及身边的朋友，我的工作是在他们的基础上完成的。有了大家的帮助，我才从未接触过linux和量化计算到能够完成这件事，用了不是很长的时间。虽然是班门弄斧，但能够写出点东西让大家少走弯路，我很高兴。对于只是使用g98来说，使用执行程序就可以了。以下情况需要编译：  1．需要修改和添加g98源程序。  2．需要针对电脑对g98优化，以便使计算更快。  3．练习。 Linux下编译linux源代码，windows下编译