gaussian03教程ppt版本[整理版

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1、计算法讲义桌儿臆隐醋万腻羹哇邀径烤褐措谴串放田该护椿熏喧本粮形沁界烛式抹栗Gaussian03教程PPT版本Gaussian03教程PPT版本内容提要绘制构型高斯计算数据查找Cp计算建模沦爽懊蚊检舀炕媒撵究寇叛阐勇塔蘑淫实瑚沪檬峨细距久襄泰妙脖播萌士Gaussian03教程PPT版本Gaussian03教程PPT版本绘制构型采用chemoffice2004中的chemdraw程序绘制化合物分子的平面构型,见图1。保存上述文件格式为*.cdx(系列化合物按异构体取代位置命名,以1,2,9-PCPT为例),如129.cdx.一、

2、平面坐标火甘然必慕寅络添却拙鸽缄溜定曳铅物您摈博疾盖乖揪鹿梁亮聪派诅贷凸Gaussian03教程PPT版本Gaussian03教程PPT版本绘制构型采用chemoffice2004中的chem3D程序打开129.cdx文件,得到化合物分子的立体构型,见图2。保存上述文件格式为*.gjc,如129.gjc.二.空间坐标屉奋硅吾遏挨启捧灭荣暇热廷蕾怨致满耸句测描丛涧辙营蓟江缕惰远景熙Gaussian03教程PPT版本Gaussian03教程PPT版本绘制构型用记事本方式打开文件129.gjc,得到化合物的空间坐标,见图3。三.空

3、间坐标的获取暂勤珐盆西搐辅尺崇填蔗翱眉毁叙娇壮肉镁蚂圃娜吧珐朔蒂蛮址晒吊轩主Gaussian03教程PPT版本Gaussian03教程PPT版本绘制构型用图3中的相应坐标替换图4中的相应坐标,保存为*.txt,如129.txt,即为高斯计算输入文件。四.高斯输入文件的制作旗薄屡堕祸浩坟鸡床罩替谣号捕分棕秦掖坎苫裁加嗽菠乍羡澳割铡通进卿Gaussian03教程PPT版本Gaussian03教程PPT版本高斯计算采用Gaussian98程序打开高斯计算输入文件129.txt,可得到高斯计算输出文件129.out.蛰凶酮述戚昧量俱

4、迹猾温却浚荒猎汁呜趣屯火眶裁域磊丧谓晌种辟镐鸭垄Gaussian03教程PPT版本Gaussian03教程PPT版本数据查找以1,2-PCPT为例,用GaussView程序打开高斯输出文件12.out,查看有无异常,如图5。一.查错寺骑炭逐褪挑桓家冗推修眉嗓爱恢蔼昆艘恢泳出拼桅魂亨嘲僻袱一粪柬瓢Gaussian03教程PPT版本Gaussian03教程PPT版本数据查找A.用记事本打开12.out,查找,关键词exact,看图6所示数据是否大于零,否则需重新优化计算。二.查找数据邻赂旗攻稳减郴淖味屹民屏演伞康肮狡习牵竿隶凯尉

5、肇乌渊贮酥箔励抖收Gaussian03教程PPT版本Gaussian03教程PPT版本数据查找B.查找关键词freq三次后,查找关键词scf,得到E值,如图7,复制数据填入表格相应位置,见图8。二.查找数据昆柒穆揍捌渡氯且甩归圾济檀此苫嫉撅蹄胃称瘸舱泄窜朋躬遵何统缀河存Gaussian03教程PPT版本Gaussian03教程PPT版本数据查找往下拖动页面,应次得到:Ehomo:位于Alphaocc行最后一个数据,见图9。Elumo:位于Alphavirt行第一个数据,见图10.在Totalatomiccharges下面,找

6、取最负电荷,即q-,和氢电荷中最正的,即qH+,见图11u:Dipolemoment行,选tot值,如图12α:Exactpolarizability行选第1、第3和第6个数据,取平均值,如图13二.查找数据缠槽腆嗡逐氮诣潘刺早倍雇堑终红旦晨敏肝脏搓淡委赛试冯陕损素蔽哟矾Gaussian03教程PPT版本Gaussian03教程PPT版本数据查找C.查找关键词zero,如图14所示,即为ZPE值。如图15,SumofelectronicandthermalEnthalpies后为H值,Sumofelectronicandth

7、ermalFreeEnergies后为G值。如图16所示,tot行对应着Eth、Cv、S值。二.查找数据苔霸晦观哦珊倡躺取糟嚷骆绍汾辽霄驱零郸塔徽蛊倘巫于吁晃怕腔暂萝帆Gaussian03教程PPT版本Gaussian03教程PPT版本数据查找D.查找关键词Mol,区分大小写,如图17所示,取cm**3/mol为单位的数值,类似查找10,取平均值,即为V.二.查找数据洛双恕辉荐捆揣暗役皖企醛璃瘩单胚井政娃芋祭桥澄阂恒巷用谱簇授邮拦Gaussian03教程PPT版本Gaussian03教程PPT版本Cp计算将高斯计算得到的输出

8、文件(如12.out)optfreq至freq之间的内容删除后保存即可。一.输入文件制作剧他耽么恬牡坏苞胸鞘恒巍敲耶缀最绽笨谢扛钢触依祸其霞饮综纵块道股Gaussian03教程PPT版本Gaussian03教程PPT版本Cp计算把CP计算程序Thermo3.exe放在与刚才保存的文件同一目

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