linux下Gaussian安装与运行

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1、一：Linux版高斯03的安装方法安装g03有以下几步：例如我要安装到/home/xiaoyuan下1、拷贝高斯安装文件g03.tar.gz到/home/xiaoyuan/Gaussian/目录下用如下命令解压tar-zxvffilename2、解压得到g03文件夹后，cd进入g03文件然后进入其bsd文件夹，运行./install3、修改你用户路径下的.bashrc文件，比如你的用户名为xiaoyuan，则vi/home/xiaoyuan/.bashrc在最后的test-s~/.alias&&.~/.alias

2、

3、true下面添加以下几行：  g03root=/home/xiaoyuan

4、/Gaussian  GAUSS_SCRDIR=/home/xiaoyuan/Gaussian/g03/scratchexportg03rootGAUSS_SCRDIR  .$g03root/g03/bsd/g03.profile其中第一行为高斯安装目录，第二行为高斯临时文件夹目录。4、保存修改（按Esc建回到一般模式(左下角插入标志消失)，然后打入:wq回车进行保存）退出.bashrc。然后运行source/home/xiaoyuan/.bashrc如不提示错误就好了。注：若要在进去bashrc修改，则按下Esc,然后按A键就可以编辑了.5.在/home/xiaoyuan/Gaussia

5、n/g03/下建立scratch文件夹。6.可以放个小分子的ch4.gjf文件到scratch里面，然后cd到scratch这个目录，运行命令g03ch4.gjf&运行，正常运行说明安装成功二：下面是我用的，你把你的改成相应的路径。1）建立一个gauss.sh文件如下。#!/bin/shg03root=/cluster3/gaussianGAUSS_SCRDIR=.exportg03rootGAUSS_SCRDIR#LD_LIBRARY_PATH=${LD_LIBRARY_PATH}:/cluster3/gaussian/g03if[-z"${LD_LIBRARY_PATH}"]then 

6、 LD_LIBRARY_PATH="/cluster3/gaussian/g03";exportLD_LIBRARY_PATHelse  LD_LIBRARY_PATH="/cluster3/gaussian/g03:${LD_LIBRARY_PATH}";exportLD_LIBRARY_PATHfisource$g03root/g03/bsd/g03.profil2）然后在~/.bash_profile文件中source这个文件sourcegauss.sh三：2编辑.bashrc文件。用一个文本编辑器打开你的home下的.bashrc文件，ubuntu下的vi，不好用，新手不推荐用，我

7、有一个.vimrc文件，如果你不知道怎么对这个文件修改，可以直接用我的附件里的.vimrc覆盖你home下的文件，你的vi会非常好用，言归正传，在你的.bashrc文件最后加上这么几行###################################################################forGaussian.03.C02G03ROOT=/home/userid/g03GAUSS_EXEDIR=$G03ROOTGAUSS_SCRDIR=/tmp/userid/g03LD_LIBRARY_PATH=$G03ROOT/:$LD_LIBRARY_PATHPATH=$

8、G03ROOT/:$PATHexportG03ROOTGAUSS_EXEDIRGAUSS_SCRDIRLD_LIBRARY_PATHPATH##################################################################带下划线加粗的地方要根据自己情况修改。3重启bash，当然不需要让你的机器重启。输入bash，或是再打开一个窗口就可以了。4win下生成的*.gjf文件因为格式问题不能直接使用，需要用dos2unix这个小工具转一下:dos2unix*.gjf5运行g03有两种方式。a)g03foo.gjf，会生成一个foo.log文件b

9、)g03foo.log有地方说linux下g03的输入文件后缀名为.com，没有不要，linux下文件不区分后缀名。6有时会有这样的问题，开机后/tmp/userid/g03文件夹消失了，需要手工建一个才能用。7有一个脚本很简单可是功能很大,可以实现批处理#!/bin/bashforiin*.gjfdog03<${i}>${i}.logdon