龙眼胚性愈伤组织AGO6基因克隆及其在体胚发生过程中的表达分析

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1、江西农业大学学报2015,37(1):141-148http://xuebao.jxau.edu.cnActaAgriculturaeUniversitatisJiangxiensisDOI:10.13836/j.jjau.2015022杨曼曼,林玉玲,王天池,等.龙眼胚性愈伤组织AGO6基因克隆及其在体胚发生过程中的表达分析[J].江西农业大学学报,2015,37(1):141-148.龙眼胚性愈伤组织AGO6基因克隆及其在体胚发生过程中的表达分析∗杨曼曼,林玉玲,王天池,赖钟雄(福建农林大学园艺植物生物工程研究所/亚热带果树研究所,福建福州350002)摘

2、要:依据龙眼胚性愈伤组织转录组数据库Unigene序列,利用RT-PCR结合RACE技术,以龙眼胚性愈伤组织cDNA为模板,获得DlAGO6基因的cDNA全长序列,共3168bp(登录号为KF819529),完整开放阅读框2700bp,编码900个氨基酸。生物信息学分析表明:DlAGO6的cDNA所编码的氨基酸序列含有2个高度保守的PAZ和PIWI结构域,具有典型的AGO类蛋白的结构特征;与拟南芥AGO6蛋白序列有较高的同源性。龙眼体胚发生过程中DlAGO6表达量的qPCR分析表明:DlAGO6在龙眼松散型胚性愈伤组织时期的表达量最高,在鱼雷形胚时期表达量最低

3、,推测DLAGO6在龙眼松散型胚性愈伤组织阶段的高表达量,可能与细胞的旺盛分裂有关。关键词:龙眼;体胚发生;AGO6;基因克隆;定量PCR中图分类号:S667.2文献标志码:A文章编号:1000-2286(2015)01-0141-08CloningofAGO6fromEmbryogenicCallusandItsExpressionAnalysisbyqPCRduringSomaticEmbryogenesisinDimocarpuslonganLour.∗YANGMan⁃man,LINYu⁃ling,WANGTian⁃chi,LAIZhong⁃xiong(

4、InstituteofHorticulturalBiotechnology/InstituteofSubtropicalFruitTrees,FujianAgricultureandFor⁃estryUniversity,Fuzhou350002,China)Abstract:Basedonthedatabaseoflongantranscriptomesequences,theDlAG06fromlonganembryogen⁃iccalluswasisolatedbyusingRACEandPCR.Theresultsshowedthatthecloned

5、full—lengthcDNAse⁃quenceofDlAGO6was3168bpinlength(Genbank:KF819529),containinga2700bpopenreadingframe(ORF)encoding900aminoacids.BioinformaticspredictedthatthededucedDlAGO6proteinwithtwocon⁃servedPAZandPIWIdomainshadthetypicalcharacteristicsoftheAGOfamily,whichhadahighidentitywiththe

6、knownArabidopsisthalianaAGO6protein.TheqPCRanalysisindicatedthattheexpressionlevelofDlAGO6genewasthelowestatthestageoftorpedoembryoandreachedthemaximumatthestageofthefria⁃ble⁃embryogeniccallus,whichsuggestedthatDlAGO6maybeassociatedwithexuberantcelldivision.Keywords:Dimocarpuslongan

7、;somaticembryogenesis;AGO6;geneclonging;qPCR收稿日期:2014-05-15修回日期:2014-06-23基金项目:国家自然科学基金项目(31272149、31201614)、福建省重大科技平台建设项目(2008N2001)和福建省自然科学基金青年项目(2012J05042)作者简介:杨曼曼(1988—),女,硕士生,主要从事果树生物技术研究,E⁃mail:291194137@qq.com;∗通信作者:赖钟雄,研究员,博导,E⁃mail:Laizx01@163.com。·142·江西农业大学学报第37卷Argonaut

8、e蛋白(AGO)是在细菌、古细菌、真菌

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