不同土壤细菌种群结构对氯嘧磺隆胁迫的响应及降解菌系的获得

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1、生态学杂志ChineseJournalofEcology2012,31(7):1724-1732不同土壤细菌种群结构对氯嘧磺隆胁迫的响应*及降解菌系的获得1,2111,211**秦胜红李新宇李旭谢建飞苏振成张惠文12(森林与土壤生态国家重点实验室,中国科学院沈阳应用生态研究所,沈阳110164;中国科学院研究生院,北京100049)摘要应用PCR-DGGE、DNA测序等方法,在室内驯化条件下研究了8种来源于中国不同地区土壤样品细菌种群结构对氯嘧磺隆胁迫的响应。结果表明:在氯嘧磺隆100~500-1mg·L浓度梯度下,土壤细菌群落

2、组成有明显的更迭现象,多样性发生明显变化,驯化至10周,绝大部分细菌种群消失,样品的细菌种群结构趋于简单并呈现趋同效应;DNA测序结果表明,在驯化第10周可培养Methylophilussp.、Betaproteobacterium、unculturedbacterium成为优势菌属,所获细菌种群出现的16个优势种群中有10个与已知的具有有机污染物降解功能和有机污染环境修复功能细菌的相似性大于97%;其中5个与嗜甲基菌16SrDNA部分序列相似性达98%以上。获得了一组对氯嘧磺隆具有降解作用的细菌菌系,可在5d-1内将100mg

3、·L氯嘧磺隆降解67%;其主要组成为嗜甲基菌属(Methylophilussp.)、丛毛单胞菌属(Comamonassp.)、鞘酯杆菌属(Sphingobacteriumsp.)和嗜氢菌属(Hydrogenophi-lussp.)。关键词土壤细菌种群结构;DGGE;香农多样性指数;氯嘧磺隆中图分类号X171.5文献标识码A文章编号1000-4890(2012)7-1724-09Responsesofbacterialcommunitystructureindifferentsoilstochlorimuron-ethylanda

4、c-1,2quisitionofchlorimuron-ethyldegradingbacterialpopulation.QINSheng-hong,LIXin-111,211**1yu,LIXu,XIEJian-fei,SUZhen-cheng,ZHANGHui-wen(StateKeyLaboratoryofForestandSoilEcology,InstituteofAppliedEcology,ChineseAcademyofSciences,Shenyang2110164,China;GraduateUnivers

5、ityofChineseAcademyofSciences,Beijing100049,China).ChineseJournalofEcology,2012,31(7):1724-1732.Abstract:Byusingwholegenomic16SrDNAPCR-DGGEandsequencinganalysis,thispaperstudiedtheresponsesofbacterialcommunitystructureofeightsoilsamplescollectedfromdiffer-entsitesinC

6、hinatochlorimuron-ethylstressundertheconditionsofacclimationinlaboratory.Therewasanotablealternationinthebacterialcommunitystructureofalleightsamplesduring10-1weeksenrichmentculturewiththeapplicationofchlorimuron-ethylincreasedfrom100mg·L-1to500mg·L.Bytheendoftheenri

7、chmentculture,theShannonindicesofthebacterialcommunitychangedsignificantly,withmostofbacterialpopulationsdisappeared.Moreover,therewasaconvergenceinthebacterialcommunitystructureofallsoilsamples.Thesequencingofthedistinguishedbandsfromthe10thweekDGGEprofileshowedthat

8、after10weeksculture,theculturableMethylophilussp.andBetaproteobacteriumandunculturablebacteriabecamedom-inantgroups.Inthesixteendom

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