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1、万方数据选fiHEREDITAS(Beijing)2011年8月,33(8):857—869ISSN0253-9772WWW.chinagene.ca综述DoI:10.3724/SP.J.1005.2011.00857基因组拷贝数变异及其突变机理与人类疾病杜仁骞1,一,金力1,2,3张锋1,21.复旦大学生命科学学院现代人类学教育部重点实验室,上海200433;2.复旦大学生命科学学院遗传工程国家重点实验室,上海200433;3.复旦大学生物医学研究院,上海200032摘要:拷贝数变异(Copynumbervariat
2、ion,CNV)是由基因组发生重排而导致的,一般指长度为1kb以上的基因组大片段的拷贝数增加或者减少,主要表现为亚显微水平的缺失和重复。CNV是基因组结构变异(Structuralvariation,sv)的重要组成部分。CNV位点的突变率远高于SNP(Singlenucleotidepolymorphism),是人类疾病的重要致病因素之一。目前,用来进行全基因组范围的CNV研究的方法有:基于芯片的比较基因组杂交技术(array.basedcomparativegenomichybridization,aCOH)、SN
3、P分型芯片技术和新一代测序技术。CNV的形成机制有多种,并可分为DNA重组和DNA错误复制两大类。CNV可以导致呈孟德尔遗传的单基因病与罕见疾病,同时与复杂疾病也相关。其致病的可能机制有基因剂量效应、基因断裂、基因融合和位置效应等。对CNV的深入研究,可以使我们对人类基因组的构成、个体间的遗传差异、以及遗传致病因素有新的认识。关键词:拷贝数变异;突变机理;疾病;人类基因组Copynumbervariationsinthehumangenome:theirmutationalmechanismsandrolesindis
4、easesDURen.Qianl,,JINLil,2,,ZHANGFen91,21.MOEKeyLaboratoryofContemporaryAnthropology,SchoolofLireSciences,FudanUniversity,Shanghai200433,China;2.StateKeyLaboratoryofGeneticEngineering,SchoolofLifeSciences,FudanUniversicy,Shanghai200433,China;3.InstitutesofBiomed
5、icalSciences,FudanUniversity,Shanghai200032,ChinaAbstract:Copynumbervariation(CNV)isthemaintypeofstructurevariation(Sv)causedbygenomicrearrangement,whichmainlyincludesdeletionandduplicationofsub.microscopicbutlargeplkblgenomicsegments.CNVhasbeenrecognizedasoneof
6、themaingeneticfactorsunderlyinghumandiseases.Themutationrate(perlocus)ofCNVismuchhigherthanthatofsinglenucleotidepolymorphism(SNP).Thegenome-wideassaysforCNVstudyincludearray—basedcomparativegenomichybridization(aCGH),SNPgenotypingmicroarrays,andnext-generations
7、equencingtechniques.V矾OUSmolecularmechanismsareinvolvedinCNVformation,whichcallbedividedintotwomaincategories.DNAre.combination.basedandDNAreplication-basedmechanisms.CNVscanbeassociatedwithMendeliandiseases.sporadicdiseases,andsusceptibilitytocomplexdiseases.CN
8、VsCanconveyclinicalphenotypesbygenedosage,genedisruption,genefusion,andpositioneriects.FurtherstudiesonCNVswillshednewlightonhumangenomestructure,geneticvaria—tionsbe
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