计算化学相关的免费的在线数据库、分子结构库及工具

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1、一些计算化学相关的免费的在线数据库、分子结构库及工具这是我平时收集的和计算化学/分子模拟有关的免费的在线的库和工具，这类网站是很有意义的。下列网址于2009年7月8日验证皆可用，若无法访问可尝试代理。前面有√的代表比较重要。很多在线工具需要java运行环境。如果有其它好的免费的化学相关的在线的库或工具欢迎回帖补充，我也会在日后逐渐补充。1在线信息数据库部分√SDBS光谱数据库：http://riodb01.ibase.aist.go.jp/sdbs/cgi-bin/direct_frame_top.cgi简介：很

2、好的有机化合物光谱数据库，包含六类光谱：EI-MS、FT-IR、H-NMR、C13-NMR、ESR、Raman。含3万余个化合物，其中以商业化学试剂为主，约2/3是6碳至16碳的化合物。数据大部分是其自行测定的，并不断添加。可以通过化合物、分子式、分子量、CAS/SDBS注册号、元素组成、光谱峰值位置/强度方式搜索。生物核磁共振数据库：http://bmrb.protein.osaka-u.ac.jp/depositCRYSTAL程序基组数据库：http://www.tcm.phy.cam.ac.uk/~mdt2

3、6/crystal.html√计算化学比较和基准数据库(CCCBDB)：http://cccbdb.nist.gov简介：此数据库包括各种量子化学方法、各种基组下对不同分子的各种属性的计算结果，也包含实验数据。可用来对比不同方法计算结果优劣，此数据库内容在不断增加。√量化频率计算校正因子：http://cccbdb.nist.gov/vibscale.asp简介：实际上就是CCCBDB的一个子页面，比较重要故单独列出。IUPAC金属络合物稳定常数数据库：http://www.acadsoft.co.uk注：需要付

4、费，可免费下载试用版。√NIST化学数据库：http://webbook.nist.gov/chemistry简介：是美国国家标准与技术研究院NIST的基于Web的物性数据库。输入分子查找条件，可获得分子量、CAS登记号、各种热力学数据、谱图等信息，部分分子包含3D结构。RESPESPchargeDDataBase(REDDB)：http://q4md-forcefieldtools.org/REDDB/index.php简介：分子的RESP电荷的数据库UppsalaElectronDensityServer：h

5、ttp://eds.bmc.uu.se/eds简介：用于评价蛋白质数据库中晶体结构电子密度。输入pdbID（比如1cbs）进入后可以对各种内容做图。点击EDSSummary下面的Go按钮可以自动启动基于java的电子密度图可视化程序观看电子密度图，注意不要开启浏览器的弹出窗口过滤。√上海有机所化学专业数据库：http://202.127.145.134/scdb/default.htm简介：十分有用的数据库，免费注册。可获得分子的红外、质谱谱图、结构、物化性质、毒性、生物活性以及相关反应等。还包括中英互译、药品名

6、称检索等功能。√EMSL基组数据库：https://bse.pnl.gov/bse/portalClarkson大学相对论有效势数据库：http://people.clarkson.edu/~pac/reps.html含重原子全电子STO基组数据库：http://www.scm.com/Downloads/zorabasis/Welcome.html原子间势参数数据库：http://www.dfrl.ucl.ac.uk/PotentialsStuttgart赝势参数数据库：http://www.theochem.

7、uni-stuttgar...ls/clickpse.en.htmlChemBioFinder：http://chembiofinder.cambridgeso...r/SimpleSearch.aspx简介：根据分子质量、名称或者自行绘制结构，从几十万分子中搜索，得到二维结构、Smiles、InCHI字符串、分子量等简单信息。Sigma-Aldrich公司产品数据库：http://www.sigmaaldrich.com/Area.../United_States.html简介：主要用来获得化合物IR、NMR谱

8、图。右上角输入化合物的名字，搜索到后进入相应条目，如果在左侧有FT-IRRaman、FT-NMR字样，就可以进入察看，没有则说明此化合物无光谱数据。也可以获得化合物的一些物性数据，但不全面。基本物理常数数据库：http://physics.nist.gov/cuu/Constants/index.html简介；可以查到精确的计算化学中涉及的物理常数及换算关系，如hartr