一些计算化学相关的的在线数据库

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1、一些计算化学相关的免费的在线数据库、分子结构库及工具1在线信息数据库部分ChemSpider小分子信息整合数据库:http://www.chemspider.com简介:是当前众多的在线分子数据库的信息整合,便于用户搜索,数据来自200种数据库。根据分子俗名、系统命名、Smile/InChI字符串、注册号、分子式等方式搜索,会列出分子平面结构、实验测定和实时估算的理化性质(含LogP等)、毒性、分子简介、Smile/InChI/InChIKey字符串、在其它分子数据库中的编号和链接、相关文章及专利、同义词、相关蛋白质、NMR/IR光谱图等,某些分子还可

2、以链入webCSD获得三维结构。√SDBS光谱数据库:http://riodb01.ibase.aist.go.jp/sdbs/cgi-bin/direct_frame_top.cgi简介:很好的有机化合物光谱数据库,包含六类光谱:EI-MS、FT-IR、H-NMR、C13-NMR、ESR、Raman。含3万余个化合物,其中以商业化学试剂为主,约2/3的数据是6碳至16碳的化合物。数据大部分是其自行测定的,并不断添加。可以通过化合物、分子式、分子量、CAS/SDBS注册号、元素组成、光谱峰值位置/强度方式搜索。生物核磁共振数据库:http://bmrb

3、.protein.osaka-u.ac.jp/depositCRYSTAL程序基组数据库:http://www.tcm.phy.cam.ac.uk/~mdt26/crystal.htmlTURBOMOLE程序基组数据库:http://bases.turbo-forum.com/TURBOMOLE_BASISSET_LIBRARY/tbl.html√计算化学比较和基准数据库(CCCBDB):http://cccbdb.nist.gov简介:此数据库包括各种量子化学方法、各种基组下对不同分子的各种属性的计算结果,也包含实验数据。可用来对比不同方法计算结果优

4、劣,此数据库内容在不断增加。√量化频率计算校正因子:http://cccbdb.nist.gov/vibscale.asp简介:实际上就是CCCBDB的一个子页面,比较重要故单独列出。IUPAC金属络合物稳定常数数据库:http://www.acadsoft.co.uk注:需要付费,可免费下载试用版。√NIST化学数据库:http://webbook.nist.gov/chemistry简介:是美国国家标准与技术研究院NIST的基于Web的物性数据库。输入分子查找条件,可获得分子量、CAS登记号、各种热力学数据、谱图等信息,部分分子包含3D结构。11R

5、ESPESPchargeDDataBase(REDDB):http://q4md-forcefieldtools.org/REDDB/index.php简介:分子的RESP电荷的数据库UppsalaElectronDensityServer:http://eds.bmc.uu.se/eds简介:用于评价蛋白质数据库中晶体结构电子密度。输入pdbID(比如1cbs)进入后可以对各种内容做图。点击EDSSummary下面的Go按钮可以自动启动基于java的电子密度图可视化程序观看电子密度图,注意不要开启浏览器的弹出窗口过滤。√上海有机所化学专业数据库:ht

6、tp://202.127.145.134/scdb/default.htm简介:十分有用的数据库,免费注册。可获得分子的红外、质谱谱图、结构、物化性质、毒性、生物活性以及相关反应等。还包括中英互译、药品名称检索等功能。√EMSL基组数据库:https://bse.pnl.gov/bse/portalClarkson大学相对论有效势数据库:http://people.clarkson.edu/~pac/reps.html含重原子全电子STO基组数据库:http://www.scm.com/Downloads/zorabasis/Welcome.html原

7、子间势参数数据库:http://www.dfrl.ucl.ac.uk/PotentialsStuttgart赝势参数数据库:http://www.theochem.uni-stuttgart.de/pseudopotentials/clickpse.en.htmlChemBioFinder:http://chembiofinder.cambridgesoft.com/chembiofinder/SimpleSearch.aspx简介:根据分子质量、名称或者自行绘制结构,从几十万分子中搜索,得到二维结构、Smiles、InCHI字符串、分子量等简单信息。

8、Sigma-Aldrich公司产品数据库:http://www.sigmaaldrich.co

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