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《人类角蛋白14(krt14)基因的生物信息学分析的论文》由会员上传分享，免费在线阅读，更多相关内容在教育资源-天天文库。
1、-人类角蛋白14(KRT14)基因的生物信息学分析前言：角蛋白14(Keratin14,K14)是角蛋白家族中一员，与角蛋白5组成一组角蛋白对。在正常胎儿和成人皮肤内，K14的转录和翻译主要在表皮基底层和毛囊进行。角蛋白（keratin）系硬蛋白之一，是一类具有结缔和保护功能的纤维状蛋白质。由处于α-螺旋或β-折叠构象的平行的多肽链组成不溶于水的起着保护或结构作用蛋白质。角蛋白（Keratin）是以各种动物的毛发、鳞片、羽毛、蹄、角为主要形式广泛存在于自然界中的一种结构蛋白。胶原（Collagen）主要存在于
2、动物的皮、骨、软骨、肌腱、韧带和血管中，是结缔组织重要的结构物质。角蛋白和胶原均为很好的动物蛋白资源[9]，已被广泛的运用到医药、食品等方面，但由于两者特殊的化学结构，性质较稳定，动物难以大量直接吸收，这局限了其在饲料方面的发展[10,11]。而微生物来源的蛋白酶尽管活性很强[12]，可以水解多种难降解的纤维蛋白，如角蛋白和胶原等，但往往不是安全的菌株。
关键词：KRT14、序列、引物、进化树、图谱、基因一、材料与方法1.材料：数据来源NCBI的GenBank数据库。获得KRT14相应的mRNA序列及其注释。
3、2.方法2.1人类角蛋白14的序列分析：利用NCBI的ORFFind预测开放阅读框ORF；利用DNAstar的genquest程序对序列进行转录因子结合位点、限制性内切酶图谱分析；用clustalX进行同源序列比对并构建进化树，用NCBI中的primer-blast设计引物。2.2人类角蛋白14(KRT14)基因的生物信息学分析二、结果与分析1.从NCBI中获得人类角蛋白14(KRT14)基因全长序列。其全长：1653bp登录号：NM_000526，更新时间：2011年10月16日。基因来源菌种分类为：Hom
4、osapiens、Eukaryota;Metazoa;Chordata;Craniata;Vertebrata;Euteleostomi;Mammalia;Eutheria;Euarchontoglires;Primates;Haplorrhini;Catarrhini;Hominidae;Homo.作者分别为：Natsuga,K.,Nishie,W.,Smith,B.J.,Shinkuma,S.,Smith,T.A.,Parry,D.A.,Oiso,N.,Kawada,A.,Yoneda,K.,Akiyam
5、a,M.和Shimizu,H..-2.mRNA序列如下：1acccgagcaccttctcttcactcagccaactgctcgctcgctcacctccctcctctgcac61catgaccacctgcagccgccagttcacctcctccagctccatgaagggctcctgcggcat121cgggggcggcatcgggggcggctccagccgcatctcctccgtcctggccggagggtcctg181ccgcgcccccagcacctacgggggcggcctgtctgtctca
6、tcctcccgcttctcctctgg241gggagcctacgggctggggggcggctatggcggtggcttcagcagcagcagcagcagctt301tggtagtggctttgggggaggatatggtggtggccttggtgctggcttgggtggtggctt361tggtggtggctttgctggtggtgatgggcttctggtgggcagtgagaaggtgaccatgca421gaacctcaatgaccgcctggcctcctacctggacaaggtgcgtgc
7、tctggaggaggccaa481cgccgacctggaagtgaagatccgtgactggtaccagaggcagcggcctgctgagatcaa541agactacagtccctacttcaagaccattgaggacctgaggaacaagattctcacagccac601agtggacaatgccaatgtccttctgcagattgacaatgcccgtctggccgcggatgactt661ccgcaccaagtatgagacagagttgaacctgcgcatgagtgtggaagccg
8、acatcaatgg721cctgcgcagggtgctggacgaactgaccctggccagagctgacctggagatgcagattga781gagcctgaaggaggagctggcctacctgaagaagaaccacgaggaggagatgaatgccct841gagaggccaggtgggtggagatgtcaatgtggagatggacgctgcacctggcgtggacct90
