水稻稻瘟病抗性基因Pita的SNP检测方法

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1、中国水稻科学(ChinJRiceSci),2013,27(3):325-328http://www.ricesci.cnDOI:10.3969/j.issn.1001-7216.2013.03.014325水稻稻瘟病抗性基因Pi-ta的SNP检测方法张羽1张晓娟1杨凤娇2冯志峰3(1陕西理工学院生物科学与工程学院,陕西汉中723000;2北京林业大学,北京100083;3陕西省汉中市农业科学研究所,陕西汉中723000)SNP-basedDetectingMethodofRiceBlastResist

2、anceGenePi-taZHANGYu1,ZHANGXiao-juan1,YANGFeng-jiao2,FENGZhi-feng3(1SchoolofBiologicalSciencesandEngineering,ShaanxiUniversityofTechnology,Hanzhong723000,China;2BeijingForestryUniversity,Beijing100083,China;3HanzhongInstituteofAgriculturalSciences,Hanzh

3、ong723000,China)ZHANGYu,ZHANGXiaojuan,YANGFengjiao,etal.SNP-baseddetectingmethodofriceblastresistancegenePi-ta.ChinJRiceSci,2013,27(3):325-328.Abstract:ThereisonlyoneaminoaciddifferencebetweenriceblastresistancegenePi-taanditssusceptibleallele.According

4、tothis,aSNP-basedPi-tadiagnosticmethodhasbeenestabishedbasedontetra-primerARMSPCRtechnology.ThedistributionofPi-tageneamong62ricegermplasmfromnationalriceregionaltestintheupperYangtzeRiverin2012and97ricegermplasmfromriceregionaltestinShanxiProvincein201

5、2wasanalyzedbythismethod,andtheresultwasconsistentwiththatwiththeotherSNPmarkerpreviouslyreported.ItshowedthatthemethodcanbeeffectivelyusedinthedetectionofPi-tageneinrice.Keywords:riceblast;Pi-ta;detectingmethod;singlenucleotidepolymorphism张羽,张晓娟,杨凤娇,等.

6、水稻稻瘟病抗性基因Pi-ta的SNP检测方法.中国水稻科学,2013,27(3):325-328.摘要:针对稻瘟病抗性基因Pi-ta位点上的抗感基因的编码产物仅有1个氨基酸的差异,利用已经建立的检测该基因的SNP方法以及作者在该基因编码序列构建的四引物扩增受阻突变体系PCR,对62份2012年长江上游国家水稻区域试验材料和97份陕西省水稻区域试验材料进行了Pi-ta基因检测,2种分子标记检测结果一致。该方法的检测结果真实可靠,可以用于检测水稻Pi-ta基因位点。关键词:稻瘟病;Pi-ta;检测方法;单

7、核苷酸多态性中图分类号:S435.111.4+1;S511.034文献标识码:A文章编号:1001-7216(2013)03-0325-04稻瘟病是造成水稻严重减产的主要病害之一,在全了一个单核苷酸多态性(singlenucleotidepolymorphism,球85个水稻种植国家和地区都有发生。每年因稻瘟病SNP),即由密码子GCT变为TCT,第918个氨基酸位点导致的生产损失约占总产量的10%~15%[1]。目前控制由抗病产物的丙氨酸变异为感病产物的丝氨酸[13]。时克稻瘟病最好的方法是发掘广谱

8、稻瘟病抗性基因或主效等[14-16]研究表明,主效抗稻瘟病基因Pi-ta在中国很多稻QTL,通过聚合育种,得到广谱持久抗病的水稻品种。因区表现高水平的稻瘟病抗性,被广泛应用于中国的水稻此,抗性基因分析以及抗源筛选就显得尤为重要[1-6]。育种和生产。20世纪60年代中期,日本率先开展了水稻品种稻瘟SNP主要是指在基因组水平上由单个核苷酸的变异病抗性基因分析的研究工作,截至2012年6月,已至少报所引起的DNA序列多态性,这种变异可由单个碱基的转道了63个