利用TP-M13-SSR标记构建苹果栽培品种的分子身份证

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1、园艺学报，2016，43(1)：25–37.ActaHorticulturaeSinicadoi：10.16420/j.issn.0513-353x.2015-0324；http：//www.ahs.ac.cn25利用TP-M13-SSR标记构建苹果栽培品种的分子身份证*高源，王昆，王大江，龚欣，刘立军，刘凤之（中国农业科学院果树研究所，农业部园艺作物种质资源利用重点实验室，辽宁兴城125100）摘要：以国家果树种质兴城梨、苹果圃保存的314份来自19个国家的苹果栽培品种为试材，利用TP-M13-SSR标记，基于TP-M13-SS

2、R指纹图谱构建苹果种质分子身份证。16对SSR引物在供试种质间共检测出等位基因357个，平均每对引物检测到22.3个。根据引物扩增等位基因数和Shannon’s指数，从1对引物开始逐步增加引物数量筛选可将供试材料全部区分的引物组合，最终确定6对核心引物可以区分全部供试苹果种质。基于供试苹果种质在6个SSR位点的指纹图谱，将等位基因编码成字符串获得分子身份证，利用条码技术其进一步转化成可被机器快速扫描的条码分子身份证，使每份种质具有可辨的分子身份证，达到利用最少、最特异引物区分最多苹果种质的目的。关键词：苹果；栽培品种；TP-M13

3、-SSR；指纹图谱；分子身份证中图分类号：S661.1文献标志码：A文章编号：0513-353X（2016）01-0025-13MolecularIDEstablishmentofAppleCultivarsbyTP-M13-SSR*GAOYuan，WANGKun，WANGDa-jiang，GONGXin，LIULi-jun，andLIUFeng-zhi（ResearchInstituteofPomology，ChineseAcademyofAgriculturalSciences/KeyLaboratoryofBiologyan

4、dGeneticImprovementofHorticulturalCropGermplasmResourcesUtilization，MinistryofAgriculture，Xingcheng，Liaoning125100，China）Abstract：Atotalof314applecultivarsfrom19countriesallovertheworldinthenationalpearandapplerepositoryofXingchengwerestudiedwithtailedprimerM13microsa

5、tellitemarkers（TP-M13-SSR）.Analysiswasmadetoestablishthe314applecultivarsmolecularID.Theresultsshowedthatbyusing16selectedSSRmarkers，357allelesweredetectedwithameanvalueof22.3alleles.BasedonnumberofallelesandShannon’sinformationindex，moreandmorelociwereaddedtodistingu

6、ishalltheappleaccessions，andfinallysixcoreprimersatleastwerescreenedtoestablishgermplasmsmolecularID.Baseongeneticfingerprintsatsixloci，locithatamplifiedbyeachmarkerwerecoded，thenthecodewerecombinedasamolecularID.UsingbarcodetechnologymolecularIDcanbetransferredintoba

7、rcodeIDthatcanbescanedquicklybymachine.Everyapplegermplasmobtainit’sspecialmolecularID.Thepurposethatusingleastprimersdistinguishesmostapplegermplasmshasbeencometrue.Keywords：apple；cultivar；TP-M13-SSR；geneticfingerprints；molecularID收稿日期：2015–06–23；修回日期：2016–01–13基金项目：

8、中央级公益性科研院所基本科研业务费专项（2011006）；农业部农作物种质资源物种保护项目（NB2013-2130135-39）*通信作者Authorforcorrespondence（E-mail：wangkun5488@163.com）GaoY