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《亚洲栽培稻遗传变异分析最少SSR引物数的研究》由会员上传分享，免费在线阅读，更多相关内容在行业资料-天天文库。
1、中国水稻科学(ChinJRiceSci),２０１５,２９(６):５７８－５８６http://www．ricesci．cn５７８DOI:１０．３９６９/ji．ssn．１００１Ｇ７２１６．２０１５．０６．００３亚洲栽培稻遗传变异分析最少SSR引物数的研究袁筱萍王彩红邓宏中徐群冯跃余汉勇王一平魏兴华∗(中国水稻研究所水稻生物学国家重点实验室,杭州３１０００６;∗通讯联系人,EＧmail:weixinghua＠caas．cn)MinimumofSSRMarkersforAnalyzingGeneticVar
2、iationofOryzasativaL．YUANXiaoＧping,WANGCaiＧhong,DENGHongＧzhong,XUQun,FENGYue,YUHanＧyong,WANGYiＧping,WEIXingＧhua∗(StateKeyLaboratoryofRiceBiology,ChinaNationalRiceResearchInstitute,Hangzhou３１０００６,China;∗Correspondingauthor,EＧmail:weixinghua＠caasc．n)YUAN
3、Xiaoping,WANGCaihong,DENGHongzhong,etal．MinimumofSSRmarkersforanalyzinggeneticvariationofOryzasativaL．．ChinJRiceSci,２０１５,２９(６):５７８Ｇ５８６．Abstract:Atotalof１２０SSRmarkerswereusedtodeterminetheminimumofSSRmarkersforanalyzinggeneticvariationof６９OryzasativaL．a
4、ccessions,whichhavebeenclearlyclassified,basedonthegeneticdiversityandpopulationstructure．Theresultsshowedthat:１)atotalof１,２５６allelesweredetectedwith１２０SSRmarkers．Thenumberofallelesperlocuswidelyrangedfrom２to２７withanaverageof１０．５．Nei′sgeneticdiversityi
5、ndexperlocusvariedfrom０?４１３to０．９５１withameanof０．７６０;２)theminimumofSSRmarkersforanalyzinggeneticdiversityofricewas７２;３)thenumberofSSRmarkersforanalyzingpopulationstructureofricewasatleast６０．Keywords:OryzasativaL．;simplesequencerepeat;geneticdiversity;pop
6、ulationstructure;Mantelcorrelationtest袁筱萍,王彩红,邓宏中,等．亚洲栽培稻遗传变异分析最少SSR引物数的研究．中国水稻科学,２０１５,２９(６):５７８Ｇ５８６．摘要:以６９份类型明确的亚洲栽培稻品种为材料,选用１２０对SSR引物,通过评估遗传多样性和群体结构,研究分析其遗传变异对SSR引物数的要求.结果表明:１)１２０对引物在６９份试验材料中共检测到１２５６个等位变异,每个位点的等位基因数差异较大,变化范围为２~２７,平均为１０．５;平均Nei基因多样性指数
7、变化范围为０．４０５８~０．９４５２,平均为０．７６１６;２)分析亚洲栽培稻遗传多样性时,至少需要７２对SSR引物;３)分析亚洲栽培稻群体结构时所需最少引物数可降低至６０对.关键词:亚洲栽培稻;SSR标记;遗传多样性;群体结构;矩阵相关性检测中图分类号:Q７５５;S５１１?０２４文献标识码:A文章编号:１００１Ｇ７２１６(２０１５)０６Ｇ０５７８Ｇ０９[２]采用快捷、可靠、精确的方法,分析水稻种质资等选用３６对SSR标记确定中国水稻品种资源初[３]源遗传变异,有利于资源鉴定、分类,种质库管理以级核心
8、种质;Gao等利用６对SSR标记研究中国及遗传学研究.利用地理分布、形态特征、杂交亲和７省４７份普通野生稻自然居群的遗传多样性.数力等传统技术手段,往往难以高效、精确地鉴别数以目较少的SSR标记所反映的遗传多样性是否真实、万计的稻种资源.DNA分子标记技术的开发和利群体结构是否稳定等问题,困扰着遗传变异研究.[４]用,提升了遗传变异分析的能力,尤其是微卫星标记之后,Garris等采用１７２对SSR标记分析亚洲栽(simplesequencerepeat,SSR),因其
