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《亚洲栽培稻遗传变异分析最少SSR引物数的研究》由会员上传分享,免费在线阅读,更多相关内容在行业资料-天天文库。
1、中国水稻科学(ChinJRiceSci),2015,29(6):578-586http://www.ricesci.cn578DOI:10.3969/ji.ssn.1001G7216.2015.06.003亚洲栽培稻遗传变异分析最少SSR引物数的研究袁筱萍王彩红邓宏中徐群冯跃余汉勇王一平魏兴华∗(中国水稻研究所水稻生物学国家重点实验室,杭州310006;∗通讯联系人,EGmail:weixinghua@caas.cn)MinimumofSSRMarkersforAnalyzingGeneticVar
2、iationofOryzasativaL.YUANXiaoGping,WANGCaiGhong,DENGHongGzhong,XUQun,FENGYue,YUHanGyong,WANGYiGping,WEIXingGhua∗(StateKeyLaboratoryofRiceBiology,ChinaNationalRiceResearchInstitute,Hangzhou310006,China;∗Correspondingauthor,EGmail:weixinghua@caasc.n)YUAN
3、Xiaoping,WANGCaihong,DENGHongzhong,etal.MinimumofSSRmarkersforanalyzinggeneticvariationofOryzasativaL..ChinJRiceSci,2015,29(6):578G586.Abstract:Atotalof120SSRmarkerswereusedtodeterminetheminimumofSSRmarkersforanalyzinggeneticvariationof69OryzasativaL.a
4、ccessions,whichhavebeenclearlyclassified,basedonthegeneticdiversityandpopulationstructure.Theresultsshowedthat:1)atotalof1,256allelesweredetectedwith120SSRmarkers.Thenumberofallelesperlocuswidelyrangedfrom2to27withanaverageof10.5.Nei′sgeneticdiversityi
5、ndexperlocusvariedfrom0?413to0.951withameanof0.760;2)theminimumofSSRmarkersforanalyzinggeneticdiversityofricewas72;3)thenumberofSSRmarkersforanalyzingpopulationstructureofricewasatleast60.Keywords:OryzasativaL.;simplesequencerepeat;geneticdiversity;pop
6、ulationstructure;Mantelcorrelationtest袁筱萍,王彩红,邓宏中,等.亚洲栽培稻遗传变异分析最少SSR引物数的研究.中国水稻科学,2015,29(6):578G586.摘要:以69份类型明确的亚洲栽培稻品种为材料,选用120对SSR引物,通过评估遗传多样性和群体结构,研究分析其遗传变异对SSR引物数的要求.结果表明:1)120对引物在69份试验材料中共检测到1256个等位变异,每个位点的等位基因数差异较大,变化范围为2~27,平均为10.5;平均Nei基因多样性指数
7、变化范围为0.4058~0.9452,平均为0.7616;2)分析亚洲栽培稻遗传多样性时,至少需要72对SSR引物;3)分析亚洲栽培稻群体结构时所需最少引物数可降低至60对.关键词:亚洲栽培稻;SSR标记;遗传多样性;群体结构;矩阵相关性检测中图分类号:Q755;S511?024文献标识码:A文章编号:1001G7216(2015)06G0578G09[2]采用快捷、可靠、精确的方法,分析水稻种质资等选用36对SSR标记确定中国水稻品种资源初[3]源遗传变异,有利于资源鉴定、分类,种质库管理以级核心
8、种质;Gao等利用6对SSR标记研究中国及遗传学研究.利用地理分布、形态特征、杂交亲和7省47份普通野生稻自然居群的遗传多样性.数力等传统技术手段,往往难以高效、精确地鉴别数以目较少的SSR标记所反映的遗传多样性是否真实、万计的稻种资源.DNA分子标记技术的开发和利群体结构是否稳定等问题,困扰着遗传变异研究.[4]用,提升了遗传变异分析的能力,尤其是微卫星标记之后,Garris等采用172对SSR标记分析亚洲栽(simplesequencerepeat,SSR),因其