《race操作步骤》

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1、StorageConditionsStoreControlHumanPlacentalTotalRNAandSMARTerIIAOligonucleotideat–70°C.StoretheNucleoTrapGelExtractionKitatroomtemperature.Storeallotherreagentsat–20°C.IMPORTANT:PriortocDNAsynthesis,pleasemakesurethatyourRNAisintact完好的andfreeofcontaminants(seeSectionV.C.Asse

2、ssingtheQualityoftheRNATemplate).Donotchangethesize(volume)ofanyofthereactions.Allcomponentshavebeenoptimizedforthevolumesspecified.1.10µl体系,PCR管冰上配制,混匀并瞬时离心,室温放至第7步2.0µl5XFirst-StrandBuffer1.0µlDTT(20mM)1.0µldNTPMix(10mM)4.0µl总体积2.新PCR管分别混匀以下试剂5'-RACE-ReadycDNA3'-RACE-Ready

3、cDNA1.0–2.75µlRNA*1.0–3.75µlRNA*1.0µl5'-CDSPrimerA1.0µl3'-CDSPrimerA3.加无菌水至3.75µl加无菌水至4.75µl4.混匀并瞬时离心混匀并瞬时离心5PCR仪:72℃3min,42℃2min,瞬时离心14000g,10s(12000rpm,10s).6.5'-RACE-ReadycDNA每反应加1.0ulSMARTerⅡAoligo7.4.0µlBufferMixfromStep10.25µlRNaseInhibitor(40U/μl)1.0µlSMARTScribe™Reve

4、rseTranscriptase(100U)5.25µl总体积8.5'-RACE3'-RACE5.25ulMasterMixfromstep⑦5.25ulMasterMixfromstep⑦4.75µl5'RACEcDNAfromstep⑥4.75ul3'-RACEcDNAfromstep⑤10µl总体积10µl总体积9.轻轻吸打混匀,并瞬时离心10.PCR仪:42℃90min11.PCR仪:70°C10min.12.稀释反应产物:用Tricine-EDTAbuffer如果起初的总RNA≤200ng,则加20µl进行稀释如果起初的总RNA≥20

5、0ng,则加100µl进行稀释(本试验采用的100µl稀释)如果起初用的是PolyA+RNA,则加250µl进行稀释13.稀释后的样品可以放-20℃保存(保质期3个月)VI.RapidAmplificationofcDNAEnds(RACE)cDNA末端快速扩增(RACE)1.PCR管,50µl体系,冰上混匀以下试剂:34.5µlPCR-GradeWater5.0µl10XAdvantage2PCRBuffer1.0µldNTPMix(10mM;inSMARTerRACEorAdvantage2PCRKit)1.0µl50XAdvantage2

6、PolymeraseMix41.5µl总体积2.枪头轻轻吸打混匀,无气泡,瞬时离心3.5’-RACEPCR体系:5’-RACE-ReadycDNA2.5ulUPM(10*)5.0ul5’RACE引物(10µM)1.0ulMasterMix41.5ul总体积50.0ul吸打混匀,瞬时离心3’-RACE-ReadycDNA2.5ulUPM(10*)5.0ul3’RACE引物(10µM)1.0ulMasterMix41.5ul总体积50.0ul吸打混匀,瞬时离心4.PCR反应(热启动):94℃5min94℃30s61℃40s自己设计的引物的温度72℃

7、3min240cycle72℃10min4℃10h⑤PCR产物可以-20℃保存第二轮PCR或巢式PCR1.将第一轮PCR产物用Tricine-EDTA稀释50倍(吸取第一轮PCR产物5.0µl,加到245µl的Tricine-EDTABuffer中,将剩余的-20℃保存)2.混匀以下试剂PCR-GradeWater36ul10XAdvantage2PCRBuffer5.0uldNTPMix(10mM)1.0ul50XAdvantage2PolymeraseMix(5U/ul)1.0ul稀释50倍的PCR产物5.0ulNUPPrimer(10uM

8、)1.0ul5’或3’RACE引物(10uM)1.0ul总体积50ul枪头吸打混匀,瞬时离心。3.PCR反应(热启动):94℃5min94℃30s57

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