lammps安装指南

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时间:2019-05-18

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1、sudo–I进入根权限cd..回到上级菜单输入suroot进入不了root,而输入sudosu和sudo-i可以,为什么?这3个命令有什么不同?suroot就是一个切换用户命令,root是用户名,那么你需要输入的就是root账户的密码要用什么root权限做事在前面加sudo就行了sudo-i选项是指更改shell环境参量为目标用户的,而你没指名目标所以默认了root,并且把环境参量也换成root的了,就更root登录shell一样。关于安装lammps单机并行版最终过程(ubuntu)! 每次在

2、论坛上得到各位高手的指点,真的是感激不尽! 下面是本人结合各位高手的结果和本人的体会,给出单机并行版的安装最终过程,已报答论坛的帮助,希望各位拍砖! 切换到根目录(root) sudo-s 先更新安装gccsudoapt-getinstallg++-安装fftw 1下载源码包fftw-2.1.5.tar.gz,解压tarxvzffftw-2.1.5.tar.gz 2cdfftw-2.1.5. 3./conefigur--prefix=/opt/mathlib/fftw215-gnu--enabl

3、e-float   其它选项: 4make 5makeinstall 二安装mpich 1下载mpich.tar.gz 2cdmpich-1.2.7** (版本太低用2.1.5)--3./configure--prefix=/opt/mpich-gnu 需要安装gfortransudo apt-get install gfortran4make 5makeinstall 三 编辑/etc/hosts.equiv文件,在其中加入本机主机名(用hostname可以得到),单独一行! 前三步都在roo

4、t下进行。 下面的步骤都在自己的用户中进行 还要安装一个jpegsrc.v8c.tar.gz。否则四中编译运行会说缺少此文件。cd jpeg-8c./configure --prefix=/opt/jpeg (配置JPEG库安装路径,请记住,后面需要用到)makemake install然后再把src/MAKE里面的Makefile.g++文件修改一下JPG_INC =       -I/opt/jpeg/includeJPG_PATH =     -L/opt/jpeg/lib安装build-

5、essential软件包$sudo apt-get install build-essential再在src目录下,用命令make package-status查看一下安装了哪些包删了后生成lmp_g++可执行文件。四 安装lammps 1tarxvzflammps.tar.gz 2cdlammps** 3cdsrc 4vimMAKE/Makefile.g++   修改mpich的安装路径   修改fftw的安装路径 (每个都有两处,include前面和lib前面的部分) MPI_INC=-DM

6、PICH_SKIP_MPICXX-l/opt/mpich-gnu/includeMPI_PATH=-L/opt/mpich-gnu/libFFT_INC=-DFFT_FFTW-l/opt/mathlib/fftw215-gnu/includeFFT_PATH=-L/opt/mathlib/fftw215-gnu/libJPG_INC=JPG_PATH=JPG_LIB=-ljpeg(这里是它的jpegsrc.v8c.tar.gz路径)设置环境变量:在根目录下然后在你的主文件夹下找到.bashrc文

7、件,在最后加入下面的内容LD_LIBRARY_PATH=/opt/mpich2/lib:/opt/fftw215/lib:/home/sky/tools/lammps/src/lib:$LD_LIBRARY_PATH注意按照你自己的安装路径进行改动。然后用命令source ~/.bashrc进行更新exportLD_LIBRARY_PATH=/opt/mpich2/lib:/opt/fftw215/lib:/home/sky/tools/lammps/src/lib:$LD_LIBRARY_PA

8、TH输入echo$LD_LIBRARY_PATH查看环境变量是否应用source ~/.bashrc5makeg++(在src目录下) 生成lmp_g++ 四 运行lammps 1cd../bench 2/opt/mpich-gnu/bin/mpirun-np16../src/lmp_g++

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