lammps学习指南 小木虫

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1、【转帖】Lammps学习指南1作者:duxiao3150  收录日期:2009-12-11  发布日期:2009-12-11本文结构:      0.  写在最开始的话      1.  首先确定lammps是不是适合你      2.  下载和编译      3.  如何使用lammps进行计算      4.  关于manual.pdf(20/JUL/07)的阅读建议      5.  Comannds的简单讲解      6.  解决问题的途径      7.  写在最后面的话温馨提示:      (1)点击标题可直接到相关的

2、“章节”.      (2)为避免混淆,上面的各“章”,  在本文中用“步骤2”、“步骤5”这样的词代指;而文中其它地方出现的“章节”是指lammps手册中的章节.      (3)文中跟某些名词相关的网页已加注超链接,直接点击可浏览该页面以获得更详尽的信息.==========================================================================0.写在最开始的话      从2007年5月初开始接触和学习lammps,时至今日,依然对lammps存有很多疑惑.如同一个刚入

3、门的工匠面对着一台功能强大的复杂机器,不知所措.虽然还有好多好多的东西要学习,但是也已经了解了一些最最基本的东西了.我可以去帮助那些刚刚入门的人,正如我刚刚开始学习lammps时诸位热心网友对我的帮助.现在,我写一写自己知道的东西,希望对lammps的新手有所帮助,不当之处,真诚地希望各位读者多多指正.      我写的这点儿东西,使用者仅限于使用lammps的新手,而且里面只讲到了ubuntu下编译lammps的单机版,没有涉及并行版的编译.我希望这个“指南”会帮他们更快地了解和学习lammps.如果你已经在使用lammps了,我

4、觉得这个“指南”是不会对你有什么帮助的.不过,对于高手来说,如果你有时间,我还是希望你能看完这篇,因为我接触lammps和MD的时间都不长,我怕我的某些错误会误导新手.所以,希望大家一起努力,完善这个指南.      对这个“指南”有任何的建议,请联系我,联系方式如下:QQ:365449075Email:wfc@mail.ustc.edu.cn      另外,我只把这篇文章放在这个由学校提供的个人网页空间.之前QQ空间的那篇文章,因为对其内容改动较大,故我已将其删除.我并不反对转载,(先自我陶醉一下下,可是会有吗?呵呵)但是转载之

5、前,请注意:      (1)  文章中的一些表述我尚不肯定正确与否.所以转载之前,请你负责任地认真读完这篇文章并确认你是否认可我的表述.如果发现错误,请及时联系我,谢谢先了.        (2)  我知道有些论坛的用户可以设置回复或者付出金币or积分等才能查看某些帖子,我坚决反对这篇文章被这么做.        (3)  本文没有所谓的版权,完全是分享性质的.转载的时候,没有必要著上是我写的,可是我不希望有一天看到这篇指南成了另外的一个名字的原创.如果你发现文中的错误并做了修改(最好也通知我),那样我们可以算是这篇文章的共同作者

6、.      (4)  严禁本文被用作其它用途.      我还要再次重申,我不想写成像教科书一样的东西.我写这篇指南的意图也绝对不是“哦,你是lammps新手吧,那你按照我说的做吧.”那我岂不成了教父了?呵呵.要知道,这篇文章的作者只不过是一个3个月前才知道世上有lammps这款代码的家伙,他根本就没有完全读完和读懂lammps手册,他对MD的基本理论了解的是少之又少.我只不过是想结合我学习lammps的过程,写一下我的体会和建议,供新手参考.如果你觉得这个指南对你有用,那固然很好;但是如果你看后觉得我说的都是屁话,那也很好,你可

7、以按照另外的思路去学习lammps,同时,你还可以按照我的联系方式大骂我一顿,我也会洗耳恭听的.      如果这篇文章真的对lammps的初学者有些许帮助,那我将感到十分的欣慰.  (返回本文目录)==========================================================================1.首先确定lammps是不是适合你      可以从以下两个网页找到答案:      http://lammps.sandia.gov/features.html      http://

8、lammps.sandia.gov/non_features.html      如果你觉得看英文很不爽,这里有一个中文翻译----Byhooge.lu      我也简单说几句,分子动力学要做的,大部分lammps都可以做(呵呵,这

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