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1、【转帖】Lammps学习指南1作者:duxiao3150 收录日期:2009-12-11 发布日期:2009-12-11本文结构: 0. 写在最开始的话 1. 首先确定lammps是不是适合你 2. 下载和编译 3. 如何使用lammps进行计算 4. 关于manual.pdf(20/JUL/07)的阅读建议 5. Comannds的简单讲解 6. 解决问题的途径 7. 写在最后面的话温馨提示： (1)点击标题可直接到相关的
2、“章节”. (2)为避免混淆,上面的各“章”, 在本文中用“步骤2”、“步骤5”这样的词代指;而文中其它地方出现的“章节”是指lammps手册中的章节. (3)文中跟某些名词相关的网页已加注超链接,直接点击可浏览该页面以获得更详尽的信息.==========================================================================0.写在最开始的话 从2007年5月初开始接触和学习lammps,时至今日,依然对lammps存有很多疑惑.如同一个刚入
3、门的工匠面对着一台功能强大的复杂机器,不知所措.虽然还有好多好多的东西要学习,但是也已经了解了一些最最基本的东西了.我可以去帮助那些刚刚入门的人,正如我刚刚开始学习lammps时诸位热心网友对我的帮助.现在,我写一写自己知道的东西,希望对lammps的新手有所帮助,不当之处,真诚地希望各位读者多多指正. 我写的这点儿东西,使用者仅限于使用lammps的新手,而且里面只讲到了ubuntu下编译lammps的单机版,没有涉及并行版的编译.我希望这个“指南”会帮他们更快地了解和学习lammps.如果你已经在使用lammps了,我
4、觉得这个“指南”是不会对你有什么帮助的.不过,对于高手来说,如果你有时间,我还是希望你能看完这篇,因为我接触lammps和MD的时间都不长,我怕我的某些错误会误导新手.所以,希望大家一起努力,完善这个指南. 对这个“指南”有任何的建议,请联系我,联系方式如下:QQ:365449075Email:wfc@mail.ustc.edu.cn 另外,我只把这篇文章放在这个由学校提供的个人网页空间.之前QQ空间的那篇文章,因为对其内容改动较大,故我已将其删除.我并不反对转载,(先自我陶醉一下下,可是会有吗?呵呵)但是转载之
5、前,请注意: (1) 文章中的一些表述我尚不肯定正确与否.所以转载之前,请你负责任地认真读完这篇文章并确认你是否认可我的表述.如果发现错误,请及时联系我,谢谢先了. (2) 我知道有些论坛的用户可以设置回复或者付出金币or积分等才能查看某些帖子,我坚决反对这篇文章被这么做. (3) 本文没有所谓的版权,完全是分享性质的.转载的时候,没有必要著上是我写的,可是我不希望有一天看到这篇指南成了另外的一个名字的原创.如果你发现文中的错误并做了修改(最好也通知我),那样我们可以算是这篇文章的共同作者
6、. (4) 严禁本文被用作其它用途. 我还要再次重申,我不想写成像教科书一样的东西.我写这篇指南的意图也绝对不是“哦,你是lammps新手吧,那你按照我说的做吧.”那我岂不成了教父了?呵呵.要知道,这篇文章的作者只不过是一个3个月前才知道世上有lammps这款代码的家伙,他根本就没有完全读完和读懂lammps手册,他对MD的基本理论了解的是少之又少.我只不过是想结合我学习lammps的过程,写一下我的体会和建议,供新手参考.如果你觉得这个指南对你有用,那固然很好;但是如果你看后觉得我说的都是屁话,那也很好,你可
7、以按照另外的思路去学习lammps,同时,你还可以按照我的联系方式大骂我一顿,我也会洗耳恭听的. 如果这篇文章真的对lammps的初学者有些许帮助,那我将感到十分的欣慰. (返回本文目录)==========================================================================1.首先确定lammps是不是适合你 可以从以下两个网页找到答案: http://lammps.sandia.gov/features.html http://
8、lammps.sandia.gov/non_features.html 如果你觉得看英文很不爽,这里有一个中文翻译----Byhooge.lu 我也简单说几句,分子动力学要做的,大部分lammps都可以做(呵呵,这
