宏基因组序列分析算法和优化技术研究

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1、分类号TP311.5学号14060100ＵＤＣ密级公开工学硕士学位论文宏基因组序列分析算法和优化技术研究硕士生姓名顾祥学科专业软件工程研究方向高性能计算指导教师廖湘科研究员国防科学技术大学研究生院二〇一六年十一月ResearchonBigDataAlgorithmandOptimizationTechnologyofMetagenomicsAnalysisCandidate：GuXiangAdvisor：Prof.LiaoXiangkeAdissertationSubmittedinpartialfulfillmentoftherequirementsforthedegreeof

2、MasterofEngineeringinSoftwareEngineeringGraduateSchoolofNationalUniversityofDefenseTechnologyChangsha，Hunan，P.R.ChinaNovember,2016国防科学技术大学研究生院硕士学位论文目录摘要.................................................................................................................iABSTRACT...................

3、......................................................................................ii第一章绪论......................................................................................................11.1研究背景及意义.......................................................................................

4、........11.1.1课题来源................................................................................................11.1.2宏基因组的生物信息学分析简介........................................................11.1.3宏基因组的生物信息学分析分析面临的挑战....................................31.1.4大数据平台：Hadoop和Spark简介................

5、...................................51.2相关工作...........................................................................................................81.2.1序列比对................................................................................................81.2.2APSS问题.........................

6、......................................................................91.2.3社区发现算法......................................................................................101.3本文的主要工作.............................................................................................111.4本文的组织结构........

7、.....................................................................................12第二章基于Hadoop平台的宏基因组序列比对方法.......................................132.1SOAPaligner简介..........................................................................