基因表达关系分析中的关键算法和并行优化技术研究

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1、分类号TP319学号14060026UDC004密级公开工学硕士学位论文基因表达关系分析中的关键算法和并行优化技术研究硕士生姓名高明学科专业计算机科学与技术研究方向高性能计算应用支撑技术指导教师朱小谦研究员国防科学技术大学研究生院二〇一六年十二月ResearchonKeyAlgorithmandParallelOptimizationTechnologyforGeneExpressionRelationshipAnalysisCandidate:GaoMingAdvisor:ProfessorZhuXiaoqianAdis

2、sertationSubmittedinpartialfulfillmentoftherequirementsforthedegreeofMasterofEngineeringinComputerScienceandTechnologyGraduateSchoolofNationalUniversityofDefenseTechnologyChangsha,Hunan,P.R.ChinaDecember7,2016国防科学技术大学研究生院硕士学位论文目录摘要.................................

3、.......................................................................................iABSTRACT...............................................................................................................iii第一章绪论.................................................

4、...........................................................11.1课题来源...................................................................................................11.2背景知识..........................................................................................

5、.........11.2.1基因组学与表观遗传学................................................................11.2.2基因表达关系分析的理论及方法................................................21.2.3海量数据背景下的问题和挑战....................................................41.3相关工作............................

6、.......................................................................61.3.1全基因组DNA甲基化研究的WGBS分析方法........................61.3.2WGBS分析软件的并行性............................................................71.3.3miRNA调控基因表达的分析方法..........................................

7、.....81.4本文的主要工作.......................................................................................91.5本文的组织结构.......................................................................................10第二章Hint-Hunt:新型WGBS检测和分析软件...................................

8、.............112.1WGBS分析的流程和问题.......................................................................112.2Hint-Hunt软件的文件格式及需求分析.........................