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时间:2019-05-10
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1、第1章生命的化学特征(生物分子导论)ChemicalPropertiesofLife1本章主要内容生命物质的化学组成生物分子的三维结构生命有机体中的化学键生物化学反应的能量来源水在生命化学过程中的作用细胞的分子组织层次生物分子的起源与进化21.生命中的元素生命与非生命物质在化学组成上有很大的差异,然而组成生命物质的元素都是存在于非生命界的元素。元素周期表中各种元素在生命机体中的丰度氢、氧、碳和氮硫和磷钾、钠、氯、钙与镁其他微量元素3硫和磷可以形成相对比较弱的化学键,在化学基团和能量转移中有重要作用,如巯基
2、-SH用于携带和转移脂酰基,磷酰基用于贮存和转移化学能钾、钠、氯、钙、镁维持细胞渗透压、细胞容积、离子平衡、细胞膜电位钠、钾离子神经肌肉正常兴奋性,糖原合成和蛋白质代谢镁离子是300多种酶的辅因子钙离子是骨骼的主要成分,参与广泛的细胞生理活动,如物质的转运与分泌,血液凝固,是细胞信号传导的第二信使等其他的微量元素主要有铁与铜化学价可变(Cu2+/Cu+,Fe3+/Fe2+),在生物氧化过程中作为电子递体,是许多酶的辅因子。还有Zn2+,Mn2+,Mo2+和I等也有重要生理功能。42.生物分子2.1生物大分
3、子参与生命有机体活动的许多分子是非常巨大的,我们把生物机体中这些巨大的分子称为生物大分子(biologicalmacromolecules)。生物大分子通过组成它们的单体之间的非共价相互作用,形成特定的空间结构,从而具有了不同的生物学功能。生物大分子是表现生命特征的基本物质。血红蛋白的空间结构5表2‑1生物分子中的共价键与键能类型键能(kJ/mol)类型键能*(kJ/mol)单键双键O-H458C=O708H-H433C=N612P-O416C=C608C-H413P=O500C-O350三键**C-C3
4、46C≡C813S-H338C-N297C-S258N-O220S-S212*指键断裂所需要的能量**生物分子中很少见6核酸,蛋白质和多糖是主要的生物大分子72.2类脂类脂(如磷脂)是富含碳氢元素的一族生物小分子,其在水溶液中溶解性较差、兼具亲水和亲脂特性。细胞的膜结构就是大量磷脂分子的聚合体。2.3有机小分子细胞中还存在许多具有独特功能的有机小分子物质,也是合成较大分子的前体。如:核苷酸、氨基酸、葡萄糖脂肪酸、胆碱、甘油等83生物分子的结构9构型异构几何异构旋光异构对映体非对映体10由于单键的旋转或扭曲
5、(键不断开)而引起分子中原子或原子团在空间的不同排列形式称为构象。这种因单键的旋转或扭曲而产生的异构体称为构象异构体。在构象异构体之间,构造式相同,而原子或原子团的空间排布方式却不相同,故属于立体异构。11一定构象的分子就是具有一定三维结构的分子。许多生物分子间相互作用具有立体专一性。124.生命有机体中的化学键在生物大分子之间主要存在的非共价的相互作用力包括氢键、离子键、范德瓦尔力、疏水力。氢键(hydrogenbonds)由两个原子来分享一个氢原子,具有高度定向性,一个是氢供体,另一个是氢受体范德瓦尔
6、力(VanderWaalsbonds)一定距离内的原子之间通过偶极发生的相互作用,本质上也是静电引力疏水力(hydrophobicinteraction)非极性分子或基团在水相环境中相互吸引、聚集的作用力离子键(ionicbonds)正、负电荷之间的静电引力134种非共价作用力的示意图范德瓦尔接触距离145.生物能量学生物能量学(bioenergetics):研究生命有机体传递和消耗能量的过程,阐明能量的转换和交流的基本规律。体内能量的产生、转移和利用15自由能(freeenergy)能量总是从能态较高的
7、物体流向能态较低的物体。这些过程都是自发的。凡是自发的过程,都有能量的释放,而且其中一部分可以用来带动非自发的过程。自发过程中能用于做功的能量称为自由能.体系可做功的能量(自由能)=体系总能量–不被利用做功的能量表示为:G=H–S∙TH表示体系的总能量(焓值);S∙T表示不能被利用做功的能量,S为熵值,T为绝对温度,那么体系可做功的能量等于H–S∙T,称为自由能,用G表示.自由能G是一个状态函数。在等温等压条件下,体系从一种状态转变为另一种状态时,自由能的改变为:ΔG=ΔH–ΔS∙T在自发过程中,自由能的
8、改变为负值,表示释放的自由能可以用来做功。而在非自发过程中,其变化是正值,表示这种改变要从外界输入能量才能实现。16能量偶联反应在生命有机体中一个放能的反应可以与一个耗能的反应偶联以推动原本不能进行的反应。葡萄糖+磷酸葡萄糖-6-磷酸(耗能,ΔG>0,为14kJ/mol)ATPADP+Pi(放能,ΔG<0,为-31kJ/mol)葡萄糖+ATP葡萄糖-6-磷酸+ADP(放能,ΔG<0,为-17kJ/mol)由葡萄糖激酶催化的反应
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