EB病毒相关胃癌病毒基因多态性的研究

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1、EB病毒相关胃癌病毒基因多态性的研究中文摘要目的分析我国鼻咽癌(nasopharyngealcarcinoma,NPC)非高发区EB病毒相关胃癌(Epstein.BarrVirusassociatedgastriccarcinoma,EBVaGC)组织中EBV分型及多种基因的多态性,确定是否存在与EBVaGC相关的EBV基因变异,深入探讨我国EBV基因型在人群中的分布以及EBV在胃癌发生发展中的作用。方法①收集山东地区362例新鲜胃癌组织及639例石蜡包埋胃癌组织,应用PCR.Southern杂交检测其特异性EBVDNA,进一步用原位杂交技术检测PCR阳性标本石蜡切片组织中EBV编码的小RNA

2、(EBVeneodingsmallRNA,EBER)1的表达,以确证EBVaGC。以PCR—Southern杂交检测260例健康人咽漱液(throatwashings,TWs),筛选EBVB日性标本以做EB病毒相关胃癌病毒基因多态性研究的对照。②采用PCR.RFLP、巢式PCR及DNA测序等方法,检测EBV阳性标本病毒1/2分型、F/f分型、矾分型及LMPlXhoI(+)/(.)等4种基因变异,比较各组间EBV分型异同。③巢式PCR及DNA测序法对潜伏膜蛋白(1atentmembraneprotein)LMPl和LMP2A编码基因,以及裂解期基因BARFl和BHRFI的多态性进行全面检测,并参

3、照B95.8标准株序列,应用DNASTAR软件对所得序列进行比对分析,同时与已发表文献中EBV基因多态性检测结果比对分析,以寻找EBVaGC及健康Tws中上述病毒基因变异规律,探讨是否存在与EBVaGC相关的EBV基因变异。结果①1001例胃癌组织中有63例为EBVaGC(6.29%),而健康TWs中EBV阳性率为23.08%(60/260)。(至)EBVaGCs和EBV阴性胃癌(EBV-negativegastriccarcinoma,EBVnGC)在年龄、发病部位及病理类型的差异有显著性,EBVaGCs在<60岁人群的感染率高于≥60岁人群的感染率(#=11.581,P=0.0007),胃

4、底贲f-J并n胃体发生率高于胃窦发生率(f=-4.684,P=-0.030),且病理类型以低分化腺癌多见(f=19.797,P=-0.0005)。残胃癌EBV感染率高达33.33%。此外,EBVaGCs和EBVnGC在性别和淋巴结转移的差异均无显著性。⑨EBVaGC中i型及XhoI(.)型EBV的比率高于健康人,差异有显著性;而1/2分型,F/f分型在EBVaGC和健康人群中的分布无差异。i/XhoI(.)亚型在EBVaGC中的比率(77.6%)高于健康人(52.6%),差异有显著性(f=7.115,P=0.008)。④据LMPl特征性突变分型,23例EBVaGC病毒株中,有22例出现Chin

5、al型EBV特征性点突变,其中19株为Chinal型EBV。29例Tws株中,则有18例为Chinal型,该型EBV在两组间的差别无统计学意义。另外,Tws中尚有6例为Med.型,1例为China2型,l例为NC型,其余3例标本则具有不同型别的突变特点。分别有19例EBVaGC及22例TWs呈30bp(168294nt.168265nt,AA343.352)缺失,两者之间30bp缺失率差异无统计学意义。21株EBVaGC发生AA326E—O突变,而Tws中仅有7株,EBVaGC此位点突变率远高于健康对照。⑤与EBVB95—8毒株比较发现,EBVaGC及健康对照Tws标本LMP2A基因共出现30

6、处错义突变,并导致9处CTL表位变异,其中4处表位的变异情况为首次报道;4处突变为所有标本共有。外显子l与外显子2.8变异不同步:外显子1各变异类型在EBVaGC及健康对照中分布频率无显著性差异;而外显子2.8中主要变异类型Groupl出现频率在EBVaGC和1ws中的分布有显著性差异;氨基末端主要功能区在所有标本中均严格保守。⑥除BHRFl基因编码区内1处突变(AA88L—V)在多株标本出现外,各标本病毒裂解期基因BARFl及BHRFl未发现一致序列变异,仅有的少数变异呈散在分布。与B95.8标准株序列相比,各标本BARFl序列同源性均耋98.9%,而BHRFl同源性均耋99.1%。EBVa

7、GC及健康人稚ws标本间两基因均无明显差异。BHRFl基因变异多分布于现已确认的bcl-2同源结构域外。结论@EBV感染与部分胃癌的发生有关,且EBVaGC具有独特I临床病理特征。②本研究初步证实i/XhoI(.)型EBV是与山东地区EBVaGC相关的变异型。③首次证实以LMPl基因变异分类的Chinal型为山东地区EBVaGC和健康人群中的优势病毒亚型。AA326E—Q突变可能与胃癌发生相关。④

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