槲皮素与核酸碱基分子间氢键的结合位点

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1、学位论文独创性声明本人承诺：所早交的学位论文是本人在导师指导卜所取得的研究成果。论文中除特别加以标注和致谢的地方外，不包含他人平¨其他机构已经撰写或发表过的研究成果，其他I—J志的研究成果对本人的启示和所提供的帮助，均己在论文中做了明确的卢明并表示谢意。学位论文作者签名：盘查塑学位论文版权的使用授权书本学位论文作者完全了解辽宁师范大学有关保留、使用学位论文的规定，及学校有权保留并向国家有关部门或机构送交复印件或磁盘，允许论文被查阅和借阅。本文授权辽宁师范大学，可以将学位论文的全部或部分内容编入有关数据库并进行检索，可以采用影印、缩印或

2、扫描等复制手段保存、汇编学位沧文，并且本人电子文档的内容和纸质论文的内容相一致。保密的学位论文在解密后使用本授权书。学位论文作者签名：量盘至3指导教师签名：≥趔签名日期：．加I弓年多月乡D日辽宁师范人学硕+学位论文摘要深入理解药物分子和核酸碱基问的相互作用机制对合理设计研发新型高效药物有重要意义。本文运用密度泛函理论B3LYP方法对药物小分子槲皮素与核酸碱基分子A、T、U的氢键相互作用位点进行了研究。在B3LYP／6—31G(d)L罩论水平上优化得到了稳定的氢键复合物，用B3LYP／6．31l+m(3af,2p)(BSSE)方法计算了

3、这些复合物的结合能。计算结果表明，槲皮素可以使用4个不同结合位点与尿嘧啶或胸腺嘧啶形成氢键复合物，尿嘧啶或胸腺嘧啶可以使用3个不同的结合位点与槲皮素形成氢键复合物。当槲皮素的结合位点固定时，槲皮素与尿嘧啶的位点u1或胸腺嘧啶的位点t1形成的氢键作用最强，与位点u2或位点t2形成氢键强度最弱；当尿嘧啶或胸腺嘧啶的作用位点固定时，二者与槲皮素的位点qul形成氢键作用最强，与位点qu4作用强度次之，与位点qu3的作用强度最弱。槲皮素与腺嘌呤形成15种氢键复合物，当槲皮素的结合位点固定时，槲皮素与腺嘌呤五元环上的N—H比六元环侧链上的N—H形

4、成的氢键的能力强，腺嘌呤六元环上N的孤对电子比五元环上N的孤对电子形成氢键能力强，槲皮素与腺嘌呤位点a1形成氢键能力最强。灿M和NBO计算结果表明轨道作用在氢键中起重要作用。关键词：槲皮素；核酸；氢键；结合能；自然键轨道(NB0)分析；分子中原子(AIM)分析Site．PreferenceofNucleicAcidBasesHydrogenBondingtoQuercetinAbstractExplonngbindingfeaturesbetweensmalldrugmoleculeandbiomoleculeisparticular

5、lyimportantbecauseitcanprovidevaluableinformationfordeeplyunderstandingtheinteractionmechanismandthereforerationallydesigning，modifyingandscreeningofnewdrugs．Inthispaper，thesite-preferenceofthenucleicacidbasesA，TandUhydrogenbondingtothesmallmedicalmoleculequercetinisinv

6、estigatedusingthedensityfunctionaltheorymethod．Thestablehydrogen．bondedcomplexeswerelocatedattheB3LYP／6-310(d)leveloftheory．ThebindingenergiesforthesecomplexeswerefurtherevaluatedattheB3LYP／6—31l++G(3df,2p)leveloftheorywiththebasissetsuperpositionerroLcorrections．Theres

7、ultsindicatethatquercetincaninteractwithuracilorthyminethroughfivebindingsiteswhichhereinwerefertoasSitequl，Sitequ2，Sitequ3，andSitequ4，anduracil(orthymine)caninteractwithquercetinthroughthreebindingsiteswhichhereinwerefertoasSiteul，Siteu2，andSiteu3(orSitetl，Sitet2，andSi

8、tet3)．Wefindthatoncethebindingsiteofquercetinisfixed，thehydrogenbondsformedthroughuracilSiteulorthroughthymine